Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14337
- Subject:
- XM_017026077.1
- Aligned Length:
- 1602
- Identities:
- 1107
- Gaps:
- 492
Alignment
Query 1 ATGAAACAGCCCAACAGGAAAAGGAAGCTTAATATGGATTCCAAAGAGCGTTTGGATCAGGACGGACGCTTGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAACAGCCCAACAGGAAAAGGAAGCTTAATATGGATTCCAAAGAGCGTTTGGATCAGGACGGACGCTTGGA 74
Query 75 GCAAGCTGAAGAGGAAAAGAAGCCCAAGGATAGCACAACCCCTTTGAGTCACGTCCCTTCAGCGGCTGCACAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCAAGCTGAAGAGGAAAAGAAGCCCAAGGATAGCACAACCCCTTTGAGTCACGTCCCTTCAGCGGCTGCACAGG 148
Query 149 GAGCATGGTCTTGGGAGTGGTACTTGAAAGAACAGAAGGCTGTCGCAGCACCTGTTGAGCTGTTTTCCAAGGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GAGCATGGTCTTGGGAGTGGTACTTGAAAGAACAGAAGGCTGTCGCAGCACCTGTTGAGCTGTTTTCCAAGGAT 222
Query 223 CAGTCCTTTCCAGAGCATGAAAATGGTTTTCAGATTGGAATGAGATTAGAAGGCATTGATCCCCGACATCCATC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGTCCTTTCCAGAGCATGAAAATGGTTTTCAGATTGGAATGAGATTAGAAGGCATTGATCCCCGACATCCATC 296
Query 297 GGTATTCTGTGTGCTTTCTGTAGCGGAGGTTTGTGGTTACCGTCTAAGACTTCATTTTGATGGTTATTTAAGTT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTATTCTGTGTGCTTTCTGTAGCGGAGGTTTGTGGTTACCGTCTAAGACTTCATTTTGATGGTTATTTAAGTT 370
Query 371 GCTATGATTTTTGGACCAATGCTGGTTCCCCTGACATTCATCCAGTAGGATGGTGTGAAAAGACCAAACATGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCTATGATTTTTGGACCAATGCTGGTTCCCCTGACATTCATCCAGTAGGATGGTGTGAAAAGACCAAACATGAA 444
Query 445 CTGCACATCCCTAAGGGTTATAGAAAAGATAAATTTGTTTGGATGGATTACTTGAAGGCCTGCAAATTGCAAAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGCACATCCCTAAGGGTTATAGAAAAGATAAATTTGTTTGGATGGATTACTTGAAGGCCTGCAAATTGCAAAA 518
Query 519 TGCTCCAAAGAAATTATTCAGAAACAGAAGTCCTAATGGGCCAATGTCTAAAGAATTTCAGGTTGGAATGAAGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCTCCAAAGAAATTATTCAGAAACAGAAGTCCTAATGGGCCAATGTCTAAAGAATTTCAGGTTGGAATGAAGC 592
Query 593 TGGAGGCCGTGGACAGGAAGAACCCTTCCTTGGTGTGTGTGGCGACCATAGCAGATATTGTTGAAGATCGCTTA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGAGGCCGTGGACAGGAAGAACCCTTCCTTGGTGTGTGTGGCGACCATAGCAGATATTGTTGAAGATCGCTTA 666
Query 667 CTAGTGCATTTTGACAACTGGGATGATAGTTACGATTACTGGTGCGATGTTAATAGCCCTTATGTCCAGCCAGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTAGTGCATTTTGACAACTGGGATGATAGTTACGATTACTGGTGCGATGTTAATAGCCCTTATGTCCAGCCAGT 740
Query 741 TGGTTGGTGTCAGGAGAATGGAAGAACTCTGATAGCACCCCAAGGTTATCCCAATCCAGAAAATTTTTCCTGGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGTTGGTGTCAGGAGAATGGAAGAACTCTGATAGCACCCCAAGGTTATCCCAATCCAGAAAATTTTTCCTGGA 814
Query 815 CAGAATACCTGGAAGCTACTCAAACCAATGCAGTTCCTGCCAAAGTTTTTAAAATGAGGTTGCCTCATGGTTTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGAATACCTGGAAGCTACTCAAACCAATGCAGTTCCTGCCAAAGTTTTTAAAATGAGGTTGCCTCATGGTTTT 888
Query 889 CTGCCAAATATGAAACTTGAAGTTGTGGATAAACGGAACCCCAGGTTAATTCGTGTTGCTACGATTGTAGATGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGCCAAATATGAAACTTGAAGTTGTGGATAAACGGAACCCCAGGTTAATTCGTGTTGCTACGATTGTAGATGT 962
Query 963 TGATGACCAAAGAGTAAAGGTTCATTTTGATGGTTGGGACCATAAGTATGACTACTGGGTGGAGGCAGACAGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGATGACCAAAGAGTAAAGGTTCATTTTGATGGTTGGGACCATAAGTATGACTACTGGGTGGAGGCAGACAGCC 1036
Query 1037 CTGATATCCACCCGATCGGATGGTGTGATGTCACAGGGCATCCACTGGAAGTGCCACAGCGAACGAATGACCTG 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |.|||.|
Sbjct 1037 CTGATATCCACCCGATCGGATGGTGTGATGTCACAGGGCATCCACTGGAAGTGCCACAGC--AC-ATTGAGC-- 1105
Query 1111 AAGATCCTTCCAGGTCAAGCTGTCTGTCCTACTCCCGGGTGCCGAGGAATAGGCCATATCCGTGGTCCACGTTA 1184
|.|||
Sbjct 1106 ---------CAAGG------------------------------------------------------------ 1110
Query 1185 TTCGGGACATCACAGTGCTTTTGGCTGCCCGTATTCAGACATGAACTTGAAAAAGGAGGCAACACTTCACGATC 1258
Sbjct 1111 -------------------------------------------------------------------------- 1110
Query 1259 GTTTGAGAGAACAAACACAGGCAAATTTGGAATCAGACTCTTCACATTCAAAATCAAAAAGCCTCTGTAGTTTG 1332
Sbjct 1111 -------------------------------------------------------------------------- 1110
Query 1333 AACTTCAATGGAAAACATGAAAAGGTGAACAGTCAGCCCAGACTTGTACAGCAGGCAAAGTGTTTGAAAATCAA 1406
Sbjct 1111 -------------------------------------------------------------------------- 1110
Query 1407 AGGAAAAGAAGATATTGACTTGGATAATCTCTTCAGAGGCCGAGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAC 1480
Sbjct 1111 -------------------------------------------------------------------------- 1110
Query 1481 TTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACGAGATCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCCAACGCAGTGAAACCCCGT 1554
Sbjct 1111 -------------------------------------------------------------------------- 1110
Query 1555 CTCTACCAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCGGGCGCCTA 1602
Sbjct 1111 ------------------------------------------------ 1110