Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14342
• Subject: NM_001346395.2
• Aligned Length: 787
• Identities: 643
• Gaps: 132

Alignment

Query   1  -------ATGGGAC-AGGTCTCTGGGAGACGTTCTGTGCCCCCCAGG-----------GGCCTTGTGGAACAGG  55
                  |||.||| |||                       ||||||           |||||..|||  ||||
Sbjct   1  ATGGTGAATGAGACGAGG-----------------------CCCAGGCTGCAGAAAGTGGCCTCATGG--CAGG  49

Query  56  ----TGA-------GCCTG-------GCTTTC-----CT---------------TATAT---------------  76
               |.|       |||||       ||||||     ||               |.|||               
Sbjct  50  CACATCAATTCGAGGCCTGGATTGCTGCTTTCAATTACTGGCATCCAGAAATTGTGTATTCAGGGGGCGACGAT  123

Query  77  -GCCTCCTGTGG---TTGGTC----GG------------TTTC--------------AGCTATGATGAACACAT  116
            ||||.|||.||   |.||.|    ||            ||||              |||||||||||||||||
Sbjct 124  GGCCTTCTGAGGGGCTGGGACACCAGGGTACCCGGCAAATTTCTCTTCACCAGCAAAAGCTATGATGAACACAT  197

Query 117  CCTACTGTGGGACACACGAAACATGAAGCAGCCGTTGGCAGATACGCCTGTGCAGGGTGGGGTATGGAGAATCA  190
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 198  CCTACTGTGGGACACACGAAACATGAAGCAGCCGTTGGCAGATACGCCTGTGCAGGGTGGGGTATGGAGAATCA  271

Query 191  AGTGGCACCCTTTCCACCACAACCTGCTCCTGGCCGCCTGCATGCACAGTGGCTTTAAGATCCTCAACTGCCAA  264
           ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272  AGTGGCACCCTTTCCACCACCACCTGCTCCTGGCCGCCTGCATGCACAGTGGCTTTAAGATCCTCAACTGCCAA  345

Query 265  AAGGCAATGGAGGAGAGGCAGGAGGCGACGGTCCTGACATCTCACACATTGCCCGACTCGCTGGTGTATGGAGC  338
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 346  AAGGCAATGGAGGAGAGGCAGGAGGCGACGGTCCTGACATCTCACACATTGCCCGACTCGCTGGTGTATGGAGC  419

Query 339  CGACTGGTCCTGGCTGCTCTTCCGTTCTCTGCAGCGGGCCCCCTCGTGGTCCTTTCCTAGCAACCTAGGAACCA  412
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420  CGACTGGTCCTGGCTGCTCTTCCGTTCTCTGCAGCGGGCCCCCTCGTGGTCCTTTCCTAGCAACCTAGGAACCA  493

Query 413  AGACGGCAGACCTGAAGGGTGCAAGCGAGTTGCCAACACCCTGTCATGAATGCAGAGAGGATAACGATGGGGAG  486
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494  AGACGGCAGACCTGAAGGGTGCAAGCGAGTTGCCAACACCCTGTCATGAATGCAGAGAGGATAACGATGGGGAG  567

Query 487  GGCCATGCCAGACCCCAGAGTGGAATGAAGCCACTCACAGAGGGCATGAGGAAGAATGGCACCTGGCTGCAGGC  560
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 568  GGCCATGCCAGACCCCAGAGTGGAATGAAGCCACTCACAGAGGGCATGAGGAAGAATGGCACCTGGCTGCAGGC  641

Query 561  TACAGCAGCCACCACACGTGACTGTGGCGTGAACCCAGAAGAAGCAGACTCAGCCTTCAGCCTCCTGGCCACCT  634
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 642  TACAGCAGCCACCACACGTGACTGTGGCGTGAACCCAGAAGAAGCAGACTCAGCCTTCAGCCTCCTGGCCACCT  715

Query 635  GCTCATTCTATGACCATGCGCTCCACCTCTGGGAGTGGGAGGGGAC-  680
           ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||. 
Sbjct 716  GCTCCTTCTATGACCATGCGCTCCACCTCTGGGAGTGGGAGGGGAAC  762