Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14356
- Subject:
- XM_017018764.1
- Aligned Length:
- 1887
- Identities:
- 1377
- Gaps:
- 510
Alignment
Query 1 ATGGGCGAGCGGCGCAGGAAGCAGCCGGAGCCGGACGCGGCGAGCGCGGCCGGGGAGTGCAGCCTCCTGGCTGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGCCGAATCGAGCACCAGCCTGCAGAGCGCGGGCGCGGGCGGCGGCGGCGTCGGGGACCTGGAGCGCGCGGCGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGCGGCAGTTCCAGCAGGACGAGACCCCCGCCTTCGTGTACGTGGTGGCCGTCTTCTCCGCGCTGGGCGGCTTC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTGTTTGGCTATGACACCGGGGTGGTGTCAGGGGCCATGCTGCTGCTCAAGCGGCAGCTCAGTCTGGACGCGCT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GTGGCAGGAGCTGCTGGTGTCCAGCACGGTGGGGGCGGCTGCCGTCTCGGCGCTGGCCGGAGGCGCCCTCAACG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GCGTCTTCGGCCGCCGCGCTGCCATCCTCCTGGCCAGTGCCCTCTTCACCGCCGGCTCCGCGGTGCTGGCTGCG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GCCAACAACAAGGAGACACTGCTCGCCGGCCGCCTGGTCGTGGGACTCGGCATCGGCATTGCTTCTATGACAGT 518
||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------ATGACAGT 8
Query 519 GCCAGTGTACATTGCGGAGGTCTCACCACCCAATTTAAGAGGCCGATTAGTCACCATTAATACCCTCTTCATCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9 GCCAGTGTACATTGCGGAGGTCTCACCACCCAATTTAAGAGGCCGATTAGTCACCATTAATACCCTCTTCATCA 82
Query 593 CAGGAGGGCAGTTCTTTGCAAGTGTTGTTGATGGAGCCTTCAGTTATCTCCAGAAGGATGGATGGAGGTACATG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83 CAGGAGGGCAGTTCTTTGCAAGTGTTGTTGATGGAGCCTTCAGTTATCTCCAGAAGGATGGATGGAGGTACATG 156
Query 667 TTGGGACTTGCAGCAGTTCCGGCGGTTATACAGTTTTTTGGCTTTCTCTTTTTGCCTGAAAGCCCTCGATGGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 TTGGGACTTGCAGCAGTTCCGGCGGTTATACAGTTTTTTGGCTTTCTCTTTTTGCCTGAAAGCCCTCGATGGCT 230
Query 741 TATTCAGAAAGGACAGACTCAGAAGGCCCGTAGAATTTTATCTCAGATGCGTGGTAACCAGACCATTGATGAGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 TATTCAGAAAGGACAGACTCAGAAGGCCCGTAGAATTTTATCTCAGATGCGTGGTAACCAGACCATTGATGAGG 304
Query 815 AATATGATAGCATCAAAAACAACATTGAAGAGGAGGAAAAAGAGGTTGGCTCAGCTGGACCTGTGATCTGCAGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 AATATGATAGCATCAAAAACAACATTGAAGAGGAGGAAAAAGAGGTTGGCTCAGCTGGACCTGTGATCTGCAGA 378
Query 889 ATGCTGAGTTATCCCCCAACTCGCCGAGCTTTAATTGTGGGTTGTGGCCTACAAATGTTCCAGCAGCTCTCAGG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 ATGCTGAGTTATCCCCCAACTCGCCGAGCTTTAATTGTGGGTTGTGGCCTACAAATGTTCCAGCAGCTCTCAGG 452
Query 963 CATTAACACCATCATGTACTACAGTGCAACCATTCTGCAGATGTCTGGTGTTGAAGATGATAGACTTGCAATAT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453 CATTAACACCATCATGTACTACAGTGCAACCATTCTGCAGATGTCTGGTGTTGAAGATGATAGACTTGCAATAT 526
Query 1037 GGCTGGCTTCAGTTACAGCCTTCACAAATTTCATTTTCACACTTGTGGGAGTCTGGCTTGTTGAGAAGGTGGGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 GGCTGGCTTCAGTTACAGCCTTCACAAATTTCATTTTCACACTTGTGGGAGTCTGGCTTGTTGAGAAGGTGGGC 600
Query 1111 CGCAGAAAGCTTACCTTTGGTAGTTTAGCAGGTACCACCGTAGCACTCATTATTCTTGCCTTGGGATTTGTGCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CGCAGAAAGCTTACCTTTGGTAGTTTAGCAGGTACCACCGTAGCACTCATTATTCTTGCCTTGGGATTTGTGCT 674
Query 1185 ATCAGCCCAAGTTTCCCCACGCATCACTTTTAAGCCAATAGCTCCGTCAGGTCAGAACGCCACTTGCACAAGAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 ATCAGCCCAAGTTTCCCCACGCATCACTTTTAAGCCAATAGCTCCGTCAGGTCAGAACGCCACTTGCACAAGAT 748
Query 1259 ACAGTTACTGTAATGAATGTATGTTGGATCCAGACTGCGGTTTCTGCTACAAGATGAACAAATCAACTGTCATT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 ACAGTTACTGTAATGAATGTATGTTGGATCCAGACTGCGGTTTCTGCTACAAGATGAACAAATCAACTGTCATT 822
Query 1333 GACTCCTCCTGTGTTCCAGTTAATAAAGCATCTACAAATGAGGCAGCCTGGGGCAGGTGTGAAAATGAAACCAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 GACTCCTCCTGTGTTCCAGTTAATAAAGCATCTACAAATGAGGCAGCCTGGGGCAGGTGTGAAAATGAAACCAA 896
Query 1407 GTTCAAAACAGAAGATATATTTTGGGCTTACAATTTCTGCCCTACTCCATACTCCTGGACTGCACTTCTGGGCC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 GTTCAAAACAGAAGATATATTTTGGGCTTACAATTTCTGCCCTACTCCATACTCCTGGACTGCACTTCTGGGCC 970
Query 1481 TTATTTTATATCTTGTCTTCTTTGCACCTGGAATGGGACCAATGCCTTGGACTGTGAATTCTGAAATATATCCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 971 TTATTTTATATCTTGTCTTCTTTGCACCTGGAATGGGACCAATGCCTTGGACTGTGAATTCTGAAATATATCCC 1044
Query 1555 CTTTGGGCAAGAAGTACAGGAAATGCATGTTCATCTGGAATAAACTGGATTTTCAATGTCCTGGTTTCACTAAC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045 CTTTGGGCAAGAAGTACAGGAAATGCATGTTCATCTGGAATAAACTGGATTTTCAATGTCCTGGTTTCACTAAC 1118
Query 1629 ATTTTTACACACAGCAGAGTATCTTACATACTATGGAGCTTTCTTCCTCTATGCTGGATTTGCTGCTGTGGGAC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119 ATTTTTACACACAGCAGAGTATCTTACATACTATGGAGCTTTCTTCCTCTATGCTGGATTTGCTGCTGTGGGAC 1192
Query 1703 TCCTTTTCATCTATGGCTGTCTTCCTGAGACCAAAGGCAAAAAATTAGAGGAAATTGAATCACTCTTTGACAAC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 TCCTTTTCATCTATGGCTGTCTTCCTGAGACCAAAGGCAAAAAATTAGAGGAAATTGAATCACTCTTTGACAAC 1266
Query 1777 AGGCTATGTACATGTGGCACTTCAGATTCTGATGAAGGGAGATATATTGAATATATTCGGGTAAAGGGAAGTAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267 AGGCTATGTACATGTGGCACTTCAGATTCTGATGAAGGGAGATATATTGAATATATTCGGGTAAAGGGAAGTAA 1340
Query 1851 CTATCATCTTTCTGACAATGATGCTTCTGATGTGGAA 1887
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341 CTATCATCTTTCTGACAATGATGCTTCTGATGTGGAA 1377
