Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14378
- Subject:
- XM_017003395.1
- Aligned Length:
- 1554
- Identities:
- 1313
- Gaps:
- 237
Alignment
Query 1 ----------------------------------------------ATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTT 28
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAATCTGAAATAAAATCCCTTCTCAATGAAGAGAACATTGGAAATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTT 74
Query 29 T------------------------------------------------------------------------- 29
|
Sbjct 75 TGAGCAAGAGCTATCAGAACAACAGTGCACATATCTTAAAAATGTAATAAATCCTATTCAGCAGCTGAGAGCAG 148
Query 30 -------------------------------------------------------------------------- 29
Sbjct 149 ATCTAAAATACAGACAGCATCACACTTTGCAGCATTCACACCCACATATTGAGTTTAACTCCATGAAAGTATTG 222
Query 30 -----GGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAAAACTGTCTTTGAAAGACTTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGA 98
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGAGGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAAAACTGTCTTTGAAAGACTTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGA 296
Query 99 AAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTCTAGATCATTCTTTGGAAGAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAAC 172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTCTAGATCATTCTTTGGAAGAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAAC 370
Query 173 TGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCATACCCTGATTTGAAATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAG 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCATACCCTGATTTGAAATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAG 444
Query 247 TTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGACTTTAATCTGCAGTTGGAAGACATATACAGAAACTGTCAACT 320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGACTTTAATCTGCAGTTGGAAGACATATACAGAAACTGTCAACT 518
Query 321 AAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTATTTTGGATCAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTC 394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTATTTTGGATCAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTC 592
Query 395 TGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCTCACAAATCTAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGT 468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCTCACAAATCTAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGT 666
Query 469 GACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAATATCCTGATATCAAATTGGAATAAAAATAGGAAAGACTTTAT 542
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 667 GACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAATATCCTGATATCAAATTGGAATAAAAATAAGAAAGACTTTAT 740
Query 543 ACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTTGTGCAACACATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGA 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTTGTGCAACACATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGA 814
Query 617 AAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAAGCCAA------------------------------------- 653
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAAGCCAAGGAAGTGATTCTATTCAGAGATAACCAATATCATTAT 888
Query 654 --GGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCAAGACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAGAGA 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTGGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCAAGACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAGAGA 962
Query 726 AAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGAATTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAGCATAA 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 963 AAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGAATTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAAAATAA 1036
Query 800 AAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAATGGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAACTG 873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAATGGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAACTG 1110
Query 874 AAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAAAGGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAGGCG 947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAAAGGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAGGCG 1184
Query 948 TTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCATGAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAGCCC 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCATGAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAGCCC 1258
Query 1022 TTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTGTTAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAAGCT 1095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTGTTAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAAGCT 1332
Query 1096 AGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAAAAGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGAACA 1169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAAAAGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGAACA 1406
Query 1170 GCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGCACTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTTATG 1243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGCACTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTTATG 1480
Query 1244 CTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTCCAAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTGAAAATA 1317
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481 CTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTCCAAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTTAAAATA 1554