Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14378
- Subject:
- XM_024452710.1
- Aligned Length:
- 1515
- Identities:
- 1313
- Gaps:
- 198
Alignment
Query 1 ----------------------------------------------ATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTT 28
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAATCTGAAATAAAATCCCTTCTCAATGAAGAGAACATTGGAAATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTT 74
Query 29 T------------------------------------------------------------------------- 29
|
Sbjct 75 TGAGCAAGAGCTATCAGAACAACAGTGCACATATCTTAAAAATGTAATAAATCCTATTCAGCAGCTGAGAGCAG 148
Query 30 -------------------------------------------------------------------------- 29
Sbjct 149 ATCTAAAATACAGACAGCATCACACTTTGCAGCATTCACACCCACATATTGAGTTTAACTCCATGAAAGTATTG 222
Query 30 -----GGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAAAACTGTCTTTGAAAGACTTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGA 98
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGAGGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAAAACTGTCTTTGAAAGACTTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGA 296
Query 99 AAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTCTAGATCATTCTTTGGAAGAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAAC 172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTCTAGATCATTCTTTGGAAGAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAAC 370
Query 173 TGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCATACCCTGATTTGAAATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAG 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCATACCCTGATTTGAAATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAG 444
Query 247 TTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGACTTTAATCTGCAGTTGGAAGACATATACAGAAACTGTCAACT 320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGACTTTAATCTGCAGTTGGAAGACATATACAGAAACTGTCAACT 518
Query 321 AAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTATTTTGGATCAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTC 394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTATTTTGGATCAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTC 592
Query 395 TGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCTCACAAATCTAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGT 468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCTCACAAATCTAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGT 666
Query 469 GACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAATATCCTGATATCAAATTGGAATAAAAATAGGAAAGACTTTAT 542
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 667 GACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAATATCCTGATATCAAATTGGAATAAAAATAAGAAAGACTTTAT 740
Query 543 ACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTTGTGCAACACATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGA 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTTGTGCAACACATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGA 814
Query 617 AAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAAGCCAAGGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCA 690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAAGCCAAGGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCA 888
Query 691 AGACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAGAGAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGA 764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAGAGAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGA 962
Query 765 ATTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAGCATAAAAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAA 838
|||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAAAATAAAAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAA 1036
Query 839 TGGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAACTGAAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAA 912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAACTGAAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAA 1110
Query 913 AGGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAGGCGTTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCA 986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAGGCGTTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCA 1184
Query 987 TGAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAGCCCTTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTG 1060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAGCCCTTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTG 1258
Query 1061 TTAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAAGCTAGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAA 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAAGCTAGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAA 1332
Query 1135 AAGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGAACAGCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGC 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGAACAGCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGC 1406
Query 1209 ACTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTTATGCTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTC 1282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ACTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTTATGCTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTC 1480
Query 1283 CAAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTGAAAATA 1317
||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481 CAAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTTAAAATA 1515