Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14383
• Subject: XR_002956410.1
• Aligned Length: 2514
• Identities: 1872
• Gaps: 626

Alignment

Query    1  ----------------ATGGCGACCTCCGAGAGGGGCTCTCCTGAGGACCAGAGCTGCCTCTCTCCTGAGAGGC  58
                            |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  AACCCCGCTAAACAAGATGGCGACCTCCGAGA-GGGCTCTCCTGAGGACCAGAGCTGCCTCTCTCCTGAGAGGC  73

Query   59  TTGGGCAGATCCCGAACTGGAGCCCGATCGTTACAGTTTCGCGCAGAAAAAGAGCGTCAGCCTTGCTGGTCTTT  132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  TTGGGCAGATCCCGAACTGGAGCCCGATCGTTACAGTTTCGCGCAGAAAAAGAGCGTCAGCCTTGCTGGTCTTT  147

Query  133  TCCCATGGGGCAGAAGACGAAAGGCAGCTCTAACATAGCCTCCTCCTACCTGCTCCAGCAGCTCATGCACCGCT  206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  TCCCATGGGGCAGAAGACGAAAGGCAGCTCTAACATAGCCTCCTCCTACCTGCTCCAGCAGCTCATGCACCGCT  221

Query  207  ATCAGGAGCTGGACTCGGACGGAGATGAGGACCAGGGCGAGGGCGAGGCGGGATCCGAGGAGTCCTCAGAGTCC  280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  ATCAGGAGCTGGACTCGGACGGAGATGAGGACCAGGGCGAGGGCGAGGCGGGATCCGAGGAGTCCTCAGAGTCC  295

Query  281  GAAATGCTGAATTTGGAGGAGGAATTTGATGGGGTCCTGAGAGAGGAGGCTGTGGCCAAAGCACTCCATCACTT  354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  GAAATGCTGAATTTGGAGGAGGAATTTGATGGGGTCCTGAGAGAGGAGGCTGTGGCCAAAGCACTCCATCACTT  369

Query  355  GGGGCGCTCAGGCTCTGGGACTGAGCAAGTCTACCTCAATCTAACTTTATCAGGTTGTAATTTAATTGATGTTA  428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  GGGGCGCTCAGGCTCTGGGACTGAGCAAGTCTACCTCAATCTAACTTTATCAGGTTGTAATTTAATTGATGTTA  443

Query  429  GCATTCTCTGTGGATATGTTCATCTACAGAAGTTGGATCTTTCAGCGAATAAAATTGAAGATTTATCTTGTGTG  502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GCATTCTCTGTGGATATGTTCATCTACAGAAGTTGGATCTTTCAGCGAATAAAATTGAAGATTTATCTTGTGTG  517

Query  503  AGTTGTATGCCTTATCTCCTAGAACTTAATGCTTCTCAAAATAATTTGACTACGTTCTTCAATTTCAAGCCACC  576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  AGTTGTATGCCTTATCTCCTAGAACTTAATGCTTCTCAAAATAATTTGACTACGTTCTTCAATTTCAAGCCACC  591

Query  577  CAAAAACCTCAAGAAGGCGGATTTTTCCCACAACCAAATTTCTGAAATTTGTGATTTGTCAGCGTATCATGCTC  650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  CAAAAACCTCAAGAAGGCGGATTTTTCCCACAACCAAATTTCTGAAATTTGTGATTTGTCAGCGTATCATGCTC  665

Query  651  TCACTAAACTAATTTTGGATGGCAATGAGATAGAAGAAATCAGTGGACTAGAGATGTGCAACAACCTAATTCAC  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  TCACTAAACTAATTTTGGATGGCAATGAGATAGAAGAAATCAGTGGACTAGAGATGTGCAACAACCTAATTCAC  739

Query  725  CTTAGTTTGGCCAACAATAAGATCACGACAATTAATGGCTTAAACAAGTTACCAATCAAAATACTTTGTCTGAG  798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  CTTAGTTTGGCCAACAATAAGATCACGACAATTAATGGCTTAAACAAGTTACCAATCAAAATACTTTGTCTGAG  813

Query  799  CAATAACCAGATTGAGATGATCACAGGTTTGGAGGATCTGAAAGCCCTGCAGAACCTGGATCTGTCCCACAATC  872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CAATAACCAGATTGAGATGATCACAGGTTTGGAGGATCTGAAAGCCCTGCAGAACCTGGATCTGTCCCACAATC  887

Query  873  AGATAAGCAGCCTCCAAGGCTTAGAGAATCATGACCTCCTGGAAGTGATCAACCTGGAGGATAATAAGATTGCT  946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  AGATAAGCAGCCTCCAAGGCTTAGAGAATCATGACCTCCTGGAAGTGATCAACCTGGAGGATAATAAGATTGCT  961

Query  947  GAGCTGAGAGAAATAGAATACATTAAAAATTTACCCATCCTTCGAGTTCTCAATCTTCTAGAAAATCCAATTCA  1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  GAGCTGAGAGAAATAGAATACATTAAAAATTTACCCATCCTTCGAGTTCTCAATCTTCTAGAAAATCCAATTCA  1035

Query 1021  GGAAAAGTCTGAATATTGGTTCTTCGTAATTTTTATGCTTCTGCGATTAACAGAATTAGATCAGAAGAAGATTA  1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GGAAAAGTCTGAATATTGGTTCTTCGTAATTTTTATGCTTCTGCGATTAACAGAATTAGATCAGAAGAAGATTA  1109

Query 1095  AAGTGGAAGAAAAGGTTTCAGCAGTGAATAAATATGATCCTCCCCCTGAAGTGGTTGCAGCTCAAGACCACCTG  1168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  AAGTGGAAGAAAAGGTTTCAGCAGTGAATAAATATGATCCTCCCCCTGAAGTGGTTGCAGCTCAAGACCACCTG  1183

Query 1169  ACCCATGTTGTCAACAGCGTGATGCAGCCGCAGAGGATCTTTGACAGCACTCTTCCCAGCCTGGATGCTCCTTA  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1184  ACCCATGTTGTCAACAGCGTGATGCAGCCGCAGAGGATCTTTGACAGCACTCTTCCCAGCCTGGATGCCCCTTA  1257

Query 1243  TCCCATGCTGATACTAGCTGGTCCTGAAGCTTGTGGGAAACGAGAGCTTGCCCATCGCCTCTGCAGACAGTTTA  1316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  TCCCATGCTGATACTAGCTGGTCCTGAAGCTTGTGGGAAACGAGAGCTTGCCCATCGCCTCTGCAGACAGTTTA  1331

Query 1317  GCACTTACTTCAGATATGGGGCCTGTCATACCACAAGACCACCTTACTTTGGAGAAGGGGATCGAGTTGATTAT  1390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  GCACTTACTTCAGATATGGGGCCTGTCATACCACAAGACCACCTTACTTTGGAGAAGGGGATCGAGTTGATTAT  1405

Query 1391  CATTTTATCTCTCAAGACGTTTTTGATGAAATGGTGAACATGGGGAAATTCATTCTAACATTTAGTTATGGTAA  1464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  CATTTTATCTCTCAAGACGTTTTTGATGAAATGGTGAACATGGGGAAATTCATTCTAACATTTAGTTATGGTAA  1479

Query 1465  TCACAAGTATGGATTAAATAGGGACACCGTAGAAGGTATCGCAAGAGATGGTTTGGCAAGCTGTATTCATATGG  1538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  TCACAAGTATGGATTAAATAGGGACACCGTAGAAGGTATCGCAAGAGATGGTTTGGCAAGCTGTATTCATATGG  1553

Query 1539  AAATAGAAGGTGTAAGAAGTTTGAAATATTCCTATTTTGAGCCTCGTTATATCCTGGTGGTGCCCATGAACAAG  1612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  AAATAGAAGGTGTAAGAAGTTTGAAATATTCCTATTTTGAGCCTCGTTATATCCTGGTGGTGCCCATGAACAAG  1627

Query 1613  GAAAAATATGAGGGATATTTGCGGAGAAAAGGATTATTCAGTCGTGCAGAAATTGAATTTGCTGTCTCCAGAGT  1686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  GAAAAATATGAGGGATATTTGCGGAGAAAAGGATTATTCAGTCGTGCAGAAATTGAATTTGCTGTCTCCAGAGT  1701

Query 1687  GGACCTTTATATTAAAATTAATCAGAATTTTCCGGGATATTTTGATGAGGTAATCAATGCAGATGATCTGGATG  1760
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||
Sbjct 1702  GGACCTTTATATTAAAATTAATCAGAATTTTCCGGGATATTTTGATG-------------AGATGATCTGGATG  1762

Query 1761  TTGCCTACCAAAAACTGAGTCAGCTCATTAGAGAATACCTTGGATTGACTGAGGAACTTGCCAAGAGTTTGGCT  1834
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1763  TTGCCTACCAAAAACTGAGTCAGCTCATTAGAGAATACCTTGGATTGACTGAGGAACCTGCCAAGAGTTTGGCT  1836

Query 1835  ACAACTGC---AGATGTTAAGACATCCC--------ACCTGAAACCTGAAGCGCA---TCCT--ACAAAGT---  1889
            ||||||||   |||||  |||..|  ||        |||||    ||||...|.|   ||||  |.|||||   
Sbjct 1837  ACAACTGCAGGAGATG--AAGTGA--CCAGGGTATGACCTG----CTGACTGGAATGTTCCTGGAGAAAGTTTG  1902

Query 1890  ATATTTCTTCGAATATG---GGTGATTTCCTGCATTCTACAGACAGAAACTACCTCATTAAATTTTGGGCCAAA  1960
            |..|.||||..||||.|   ||.|                                                  
Sbjct 1903  ACCTGTCTTAAAATAGGAATGGAG--------------------------------------------------  1926

Query 1961  CTTTCAGCCAAAAAAACACCAGCGGAAAGAGATTCTATACACAGACAGCACGAGGCAGCCCGGCAAGCTCTAAT  2034
                                                                                      
Sbjct 1927  --------------------------------------------------------------------------  1926

Query 2035  GGGAAGGATACGCCCTGATCACACACTCCTATTTCAAAGGGGTCCAGTACCAGCACCTCTCACCAGTGGTCTAC  2108
                                                                                      
Sbjct 1927  --------------------------------------------------------------------------  1926

Query 2109  ACTATTATACAACTTTAGAAGAACTCTGGAAAAGTTTTGATCTTTGTGAAGACTATTTTAAACCTCCATTTGGA  2182
                                                                                      
Sbjct 1927  --------------------------------------------------------------------------  1926

Query 2183  CCATATCCTGAAAAGAGTGGGAAGGATTCCTTGGTTTCCATGAAATGTTCATTGTTTCGGTTCTGTCCGTGGTC  2256
                                                                                      
Sbjct 1927  --------------------------------------------------------------------------  1926

Query 2257  AAAAGAATTGCCTTTCCAGCCTCCGGAGGGGAGCATTTCTTCACACCTAGGATCAGGAGCCAGTGACAGTGAGA  2330
                                                                                      
Sbjct 1927  --------------------------------------------------------------------------  1926

Query 2331  CCGAAGAGACCCGGAAAGCACTACCTATACAATCATTTTCACATGAAAAAGAGTCTCACCAACACAGACAACAC  2404
                                                                                      
Sbjct 1927  --------------------------------------------------------------------------  1926

Query 2405  TCGGTCCCAGTCATCAGTCGCCCAGGTTCCAACGTCAAACCCACCCTCCCTCCAATCCCTCAGGGCCGCAGG  2476
                                                                                    
Sbjct 1927  ------------------------------------------------------------------------  1926