Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14422
• Subject: XM_017319718.1
• Aligned Length: 2134
• Identities: 1876
• Gaps: 52

Alignment

Query    1  ATGGCCAGCACCCAGGAGTATCGAGCTGGAGCACTTTGAGGAACGGGACAAAAGGCCGCGGCCGGGGTCGCGGA  74
            |||||||||| |.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct    1  ATGGCCAGCA-CAAGGAGCATTGAGCTGGAACATTTTGAAGAACGGGACAAAAGGCCGCGGCCAGGGTCACGGA  73

Query   75  GAGGGGCCCCCAGCTCCTCCGGGGGCAGCAGCAGCTCGGGCCCCAAGGGGAACGGGCTCATCCCCAGTCCGGCG  148
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct   74  GAGGGGCTCCCAGCTCCTCCGGGGGCAGCAGCATCTCTGGCCCCAAGGGCAACGGGCTCATCCCCAGCCCGGCG  147

Query  149  CACAGTGCCCACTGCAGCTTCTACCGCACGCGGACCCTGCAGGCCCTCAGCTCGGAGAAGAAGGCCAAGAAGGC  222
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  CACAGTGCTCACTGCAGCTTCTACCGCACGCGGACCTTGCAGGCCCTCAGCTCGGAGAAGAAGGCCAAGAAGGC  221

Query  223  GCGCTTCTACCGGAACGGGGACCGCTACTTCAAGGGCCTGGTGTTTGCCATCTCCAGCGACCGCTTCCGGTCCT  296
            |||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||.||||||.|||||.||||
Sbjct  222  GCGGTTCTACCGGAATGGGGACCGCTATTTCAAAGGCCTGGTCTTTGCCATCTCCAACGACCGTTTCCGTTCCT  295

Query  297  TCGATGCGCTCCTCATAGAGCTCACCCGCTCCCTGTCGGACAACGTGAACCTGCCCCAGGGTGTCCGCACTATC  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  296  TCGATGCGCTCCTCATAGAGCTCACCCGCTCACTGTCTGACAATGTGAACCTGCCCCAGGGCGTCCGCACCATC  369

Query  371  TACACCATCGACGGCAGCCGGAAGGTCACCAGCCTGGACGAGCTGCTGGAAGGTGAGAGTTACGTGTGTGCATC  444
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  370  TACACCATAGACGGCAGCCGGAAGGTCACCAGCCTGGACGAGCTGCTGGAAGGTGAAAGTTACGTGTGTGCCTC  443

Query  445  CAATGAACCATTTCGTAAAGTCGATTACACCAAAAATATTAATCCAAACTGGTCTGTGAACATCAAGGGTGGGA  518
            |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  444  CAACGAACCATTTCGTAAAGTTGATTACACCAAAAACGTTAATCCGAACTGGTCTGTGAACATCAAGGGCGGAA  517

Query  519  CATCCCGAGCGCTGGCTGCTGCCTCCTCTGTGAAAAGTGAAGTAAAAGAAAGTAAAGATTTCATCAAACCCAAG  592
            |..||||..|.|||||.|..|   ||||||.|||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct  518  CCACCCGCACCCTGGCCGTGG---CCTCTGCGAAGAGTGAGGTGAAAGAAAGCAAAGACTTCATTAAACCCAAG  588

Query  593  TTAGTGACTGTGATTCGAAGTGGAGTGAAGCCTAGAAAAGCCGTGCGGATCCTTCTGAATAAAAAGACTGCTCA  666
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  589  TTAGTGACTGTGATTCGAAGCGGAGTGAAGCCTAGAAAGGCCGTGCGGATCCTTCTGAATAAAAAGACTGCCCA  662

Query  667  TTCCTTTGAACAAGTCTTAACAGATATCACCGAAGCCATTAAACTAGACTCAGGAGTCGTCAAGAGGCTCTGCA  740
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  663  TTCCTTTGAGCAGGTCTTAACAGATATCACCGAAGCCATTAAACTAGACTCAGGCGTGGTCAAGAGGCTGTGCA  736

Query  741  CCCTGGATGGAAAGCAGGTTACTTGTCTGCAAGACTTTTTTGGTGATGACGATGTTTTTATTGCATGTGGACCA  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  737  CCCTGGATGGAAAGCAGGTTACTTGTCTGCAAGACTTTTTTGGAGACGATGATGTTTTTATTGCATGTGGACCT  810

Query  815  GAAAAATTTCGTTATGCCCAAGATGACTTTGTCCTGGATCATAGTGAATGTCGTGTCCTGAAGTCATCTTATTC  888
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||
Sbjct  811  GAAAAATATCGTTATGCCCAAGATGACTTTGTCCTGGATCATAGCGAATGCCGTGTCCTGAAATCGTCCTACTC  884

Query  889  TCGATCCTCAGCTGTTAAGTATTCTGGATCCAAAAGCCCTGGGCCCTCTCGACGCAGCAAATCACCAGCTT---  959
            ||||.|||||||||..||||||||||||||||.||||||.|||..|||.||.||||||||.||||||||||   
Sbjct  885  TCGAGCCTCAGCTGCGAAGTATTCTGGATCCAGAAGCCCAGGGTTCTCCCGCCGCAGCAAGTCACCAGCTTCAG  958

Query  960  ---------------------------------------------CAGTTAATGGAACTCCCAGCAGCCAACTT  988
                                                         ||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  959  TAAAGAGGGCTGGCCACTCCAGTGCCTATTCTACAGCCAAATCCCCAGTGAATGGAACTCCCAGTAGCCAGCTT  1032

Query  989  TCTACTCCTAAATCTACGAAATCCTCCAGTTCCTCTCCAACTAGTCCAGGAAGTTTCAGAGGATTAAAGATTTC  1062
            ||.|||||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1033  TCCACTCCGAAGTCCACCAAGTCCTCCAGCTCCTCTCCAACCAGCCCGGGAAGTTTCAGAGGATTGAAGATTTC  1106

Query 1063  TGCTCATGGCAGATCTTCTTCCAATGTAAACGGTGGACCTGAGCTTGACCGTTGCATAAGTCCTGAAGGTGTGA  1136
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.|.||.|||||||||||||
Sbjct 1107  TGCTCAGGGCAGATCTTCTTCCAACGTAAACGGTGGGCCTGAACTTGACCGTTGCCTGAGCCCTGAAGGTGTGA  1180

Query 1137  ATGGAAACAGATGCTCTGAATCATCAACTCTTCTTGAGAAATACAAAATTGGAAAGGTCATTGGTGATGGCAAT  1210
            ||||||||.|.|||||.||.||.|...|.|||||.||||||||||.|||.||.||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 1181  ATGGAAACCGGTGCTCCGAGTCGTTCCCCCTTCTGGAGAAATACAGAATAGGGAAGGTCATCGGGGACGGCAAC  1254

Query 1211  TTTGCAGTAGTCAAAGAGTGTATAGACAGGTCCACTGGAAAGGAGTTTGCCCTAAAGATTATAGACAAAGCCAA  1284
            ||.||.|||||.||.|||||..|.|||||||.|||||||||.||||||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  TTCGCGGTAGTTAAGGAGTGCGTGGACAGGTACACTGGAAAAGAGTTTGCATTAAAGATTATAGACAAAGCCAA  1328

Query 1285  ATGTTGTGGAAAGGAACACCTGATTGAGAATGAAGTGTCAATACTGCGCCGAGTGAAACATCCCAATATCATTA  1358
            |||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 1329  ATGCTGTGGAAAGGAGCATCTGATTGAGAACGAAGTGTCAATCCTGCGCCGAGTGAAGCACCCCAACATCATCA  1402

Query 1359  TGCTGGTCGAGGAGATGGAAACAGCAACTGAGCTCTTTCTGGTGATGGAATTGGTCAAAGGTGGAGATCTCTTT  1432
            ||.||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  TGTTGGTTGAAGAGATGGAAACAGCAACTGACCTCTTTCTAGTGATGGAACTGGTCAAAGGTGGAGATCTCTTT  1476

Query 1433  GATGCAATTACTTCGTCGACCAAGTACACTGAGAGAGATGGCAGTGCCATGGTGTACAACTTAGCCAATGCCCT  1506
            |||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1477  GATGCGATTACCTCTTCAACCAAGTACACTGAGAGAGATGGAAGCGCCATGGTGTACAACCTAGCCAATGCCCT  1550

Query 1507  CAGGTATCTCCATGGCCTCAGCATCGTGCACAGAGACATCAAACCAGAGAATCTCTTGGTGTGTGAATATCCTG  1580
            |.||||.||.||..|||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||..|||||||.|||||.||.|
Sbjct 1551  CCGGTACCTGCACAGCCTCAGCATCGTCCACAGGGACATCAAGCCTGAGAATCTGCTGGTGTGCGAATACCCAG  1624

Query 1581  ATGGAACCAAGTCTTTGAAACTGGGAGACTTTGGGCTTGCGACTGTGGTAGAAGGCCCTTTATACACAGTCTGT  1654
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1625  ATGGAACCAAGTCTTTGAAGCTGGGAGACTTTGGGCTGGCGACGGTGGTTGAAGGCCCGTTGTACACGGTCTGT  1698

Query 1655  GGCACACCCACTTATGTGGCTCCAGAAATCATTGCTGAAACTGGCTATGGCCTGAAGGTGGACATTTGGGCAGC  1728
            |||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct 1699  GGCACGCCAACTTATGTGGCACCAGAGATCATAGCTGAAACAGGTTATGGCCTGAAGGTGGATGTTTGGGCAGC  1772

Query 1729  TGGTGTGATCACATACATACTTCTCTGTGGATTCCCACCATTCCGAAGTGAGAACAATCTCCAGGAAGATCTCT  1802
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  TGGTGTGATTACATACATACTTCTCTGTGGATTCCCACCATTCCGGAGTGAGAACAATCTCCAGGAAGATCTCT  1846

Query 1803  TCGACCAGATCTTGGCTGGGAAGCTGGAGTTTCCGGCCCCCTACTGGGATAACATCACGGACTCTGCCAAGGAA  1876
            |.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1847  TTGACCAGATCTTGGCTGGAAAGCTGGAATTCCCAGCCCCCTACTGGGACAACATTACAGACTCTGCCAAGGAG  1920

Query 1877  TTAATCAGTCAAATGCTTCAGGTAAATGTTGAAGCTCGGTGTACCGCGGGACAAATCCTGAGTCACCCCTGGGT  1950
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1921  TTAATCAGTCAAATGCTTCAGGTAAACGTTGAAGCTCGCTGTACTGCGGGAGAAATTCTGAGTCACCCCTGGGT  1994

Query 1951  GTCAGATGATGCCTCCCAGGAGAATAACATGCAAGCTGAGGTGACAGGTAAACTAAAACAGCACTTTAATAATG  2024
            ||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995  GTCAGATGATGCATCCCAGGAGAACAATATGCAAGCCGAGGTTACAGGTAAACTAAAACAGCACTTTAATAATG  2068

Query 2025  CGCTCCCCAAACAGAACAGCACTACCACCGGGGTCTCCGTCATCATGTTTGATTTGACAGTT  2086
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2069  CGCTCCCCAAACAGAACAGCACCACCACCGGGGTCTCCGTTATCATGTTTGATTTGACAGTT  2130