Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14460
- Subject:
- XM_011523545.3
- Aligned Length:
- 3594
- Identities:
- 2242
- Gaps:
- 1347
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTGTGGCTACTCTTCGGCAGTCAGTGGAGGAAGTGAAAAAAAACACGGGGTCACAGGTATTTCTGGAAAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTCAAACTGTTTTTCCTCTACTCTGATACCACAAGAATCATCAGCACAGAGGAAGACTTCTGTGATCAAATGTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GTGGGAGAGGGAGGTTTTCACCAGCACATGAGCAGTCAGTTCTGCCGCAGACTCGGCGGGTGTCCTTCGGTTCA 222
Query 1 ------------------------------------------------ATGCTGCCACTGGGCTCAGAGCCCGC 26
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTTCCAACACCGCCTGCCTGGAGAGAGGTCAGACCACAGGCGGCCACCATGCTGCCACTGGGCTCAGAGCCCGC 296
Query 27 CCTGAATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCCAGCTGCAGGAGG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCTGAATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCCAGCTGCAGGAGG 370
Query 101 CGGCTCTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAGGAGGACTTTGTC 174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGGCTCTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAGGAGGACTTTGTC 444
Query 175 TACAACCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGCCCAGGCCAGGGA 248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TACAACCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGCCCAGGCCAGGGA 518
Query 249 GTGGGAGGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGCAGGCGCTAGCCA 322
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTGGGAAGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGCAGGCGCTAGCCA 592
Query 323 GAGAGGCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGCCTGGAGCTGGAG 396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGAGGCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGCCTGGAGCTGGAG 666
Query 397 CGCGTCCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAAATGGACACTGGA 470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGCGTCCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAAATGGACACTGGA 740
Query 471 GAGAAAACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGTTTGAATCGAAAA 544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAGAAAACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGTTTGAATCGAAAA 814
Query 545 TGCGGAAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCCCGGGAGCTTAAG 618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCGGAAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCCCGGGAGCTTAAG 888
Query 619 GTTAAACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAGTCTGCAGAGGGC 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTTAAACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAGTCTGCAGAGGGC 962
Query 693 AGAGGCCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGATCTGGAGGCCATGA 766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 963 AGAGGCCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGACCTGGAGGCCATGA 1036
Query 767 GCCGCGCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAGGAAGAGGAAACA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCCGCGCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAGGAAGAGGAAACA 1110
Query 841 TTTAAGAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGCGGTGAAGGGAGC 914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTTAAGAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGCGGTGAAGGGAGC 1184
Query 915 CCACGTGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGACCCTCGAGGCGC 988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCACGTGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGACCCTCGAGGCGC 1258
Query 989 AGCTCCGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGACCAACTTCGTGAA 1062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGCTCCGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGACCAACTTCGTGAA 1332
Query 1063 GATGCATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGTCTCCAGAGACCT 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GATGCATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGTCTCCAGAGACCT 1406
Query 1137 TCAGATTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGCAGGACATTGAAA 1210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCAGATTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGCAGGACATTGAAA 1480
Query 1211 GGTACAAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTGCAGCTGGGCCTG 1284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GGTACAAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTGCAGCTGGGCCTG 1554
Query 1285 GACTGGCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGATTCAGGGTCTGAG 1358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GACTGGCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGATTCAGGGTCTGAG 1628
Query 1359 CATGGCAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGGAGGTGGTGCTGA 1432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CATGGCAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGGAGGTGGTGCTGA 1702
Query 1433 AGGCCATGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGACCAGGGGCACAG 1506
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGGCCGTGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGACCAGGGGCACAG 1776
Query 1507 ATGCTTCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCGGCTCCGAGAGCA 1580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATGCTTCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCGGCTCCGAGAGCA 1850
Query 1581 GAACACGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATCAGATTCCTCCTC 1654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GAACACGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATCAGATTCCTCCTC 1924
Query 1655 CCATCCAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGATGCCGCCACTCCT 1728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CCATCCAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGATGCCGCCACTCCT 1998
Query 1729 GATTATGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGAAAAGCATCTAGA 1802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GATTATGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGAAAAGCATCTAGA 2072
Query 1803 AGATGTGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCACCTCGACAGAGA 1876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGATGTGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCACCTCGACAGAGA 2146
Query 1877 CGACTGGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAA 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CGACTGGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAA 2220
Query 1951 GCTGGCCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGAC 2024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GCTGGCCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGAC 2294
Query 2025 ACGACTCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGG 2098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ACGACTCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGG 2368
Query 2099 ACCAGGTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAG 2172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 ACCAGGTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAG 2442
Query 2173 CACGGGGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGGGAGAGAGGTGGG 2246
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CACGGGGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGGGAGAGAG----- 2511
Query 2247 TGNCCGC------------------------------------------------------------------- 2253
|.||.|
Sbjct 2512 -GGCCTCACCAAGAGAGGGCCTATGGAGGCCGAGGACCAGGGGGAGCTTTTCCTGCACCTCCGGTCAGTGGCAC 2584
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2585 GTGCCCCCCAGACCTTATCTATGCACCGACTCCAGAGAAAGCTGAAGGAGGCAGCCAGAAAAATCATCAGCCTC 2658
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2659 CGCCTGGAGAAAGAGCAGCTCATCGAGATGGGGAACAGGCTCCGTGCAGAGCTGGGCCGACCCGAAAGGTGGCT 2732
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2733 GTTGCACCACGCCCTCCCTCCTGCCCCTGAGGCCCGGAAGCCAGGCGAGGAGCCCAGGAGGCCTTTGGATCGCA 2806
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2807 GCCCACCTTTGGGACAGGTGCAGCCCCATTTTACATCTCAGGACGCCAAGAGTGCCGAGGATGAGGCTCCTTCC 2880
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2881 AGACACTTGGGAAAGCACCAGCCCCGCTCAGCACAGGTGGGCAGCAGACTTGACGCCCTGCAAGGCCCGAAGAC 2954
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2955 ACAACACAGCATCCACACGGTGACCTGTAAATCACCTCGGCAGAAAGAAGACAGGTCCCCAAAGCCACCCCAGG 3028
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 3029 CTCCCCAGCACCCTGAGGAGCATGGTCGCCAATCCCACAGCTCCTCCTCCTTTGCCAGTGGCACCCTCCAGGAC 3102
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 3103 ATGTGGAGGTTGCTAGACCTGGGATCCAGCCCTTCTGGTGTCACCTCCCAGGGTGACTCAACTCCAGAAATGGG 3176
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 3177 GTCTCACTATGTCACCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCAGTCCTGCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTG 3250
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 3251 CTGAGATGACAGGTGTGGGCCCCACGCCCAGCCTGGCGTGGAGTGGAGCCCTTCACCCAAACATGAACCAGGAG 3324
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 3325 GCGAGCTTGGTAAGGAGCACGTGGGCTCCAGGAATGCGAGGGGGAATGAATGGAGGCAGCTCCTCAGTGTGCAA 3398
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 3399 AAACATGCAGCGCGGGCCTCACTGGTCACCATCACAGCAGCCTTGCAGTGGGATCAGGACAGTCCTGCTGTCCA 3472
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 3473 GGAAGGAGAGGACCCTGCTCTCTTGTTTCTCACTACCTGCTCCTGTCGTTCTAGTCCCATTGCTGCTCTCAGGA 3546
Query 2254 ------------------------------------------ 2253
Sbjct 3547 CAAGCTGTGACTGAGAGAGCAGGTCACGCTGGTGACATTTTA 3588