Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14460
• Subject: XM_011523546.3
• Aligned Length: 3384
• Identities: 2242
• Gaps: 1137

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGCTGCCACTGGG  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCCAGGAACTGTGCAAGAAAACCATGATGTGTCATTGTACCACAACAGCGGCCACCATGCTGCCACTGGG  74

Query   15  CTCAGAGCCCGCCCTGAATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCC  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCAGAGCCCGCCCTGAATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCC  148

Query   89  AGCTGCAGGAGGCGGCTCTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAG  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCTGCAGGAGGCGGCTCTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAG  222

Query  163  GAGGACTTTGTCTACAACCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGC  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGGACTTTGTCTACAACCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGC  296

Query  237  CCAGGCCAGGGAGTGGGAGGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGC  310
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGGCCAGGGAGTGGGAAGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGC  370

Query  311  AGGCGCTAGCCAGAGAGGCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGC  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGCGCTAGCCAGAGAGGCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGC  444

Query  385  CTGGAGCTGGAGCGCGTCCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAA  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGAGCTGGAGCGCGTCCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAA  518

Query  459  ATGGACACTGGAGAGAAAACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGT  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATGGACACTGGAGAGAAAACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGT  592

Query  533  TTGAATCGAAAATGCGGAAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCC  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGAATCGAAAATGCGGAAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCC  666

Query  607  CGGGAGCTTAAGGTTAAACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAG  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGGGAGCTTAAGGTTAAACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAG  740

Query  681  TCTGCAGAGGGCAGAGGCCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGATC  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  TCTGCAGAGGGCAGAGGCCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGACC  814

Query  755  TGGAGGCCATGAGCCGCGCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAG  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAGGCCATGAGCCGCGCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAG  888

Query  829  GAAGAGGAAACATTTAAGAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGC  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAGAGGAAACATTTAAGAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGC  962

Query  903  GGTGAAGGGAGCCCACGTGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGA  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGTGAAGGGAGCCCACGTGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGA  1036

Query  977  CCCTCGAGGCGCAGCTCCGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGAC  1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCTCGAGGCGCAGCTCCGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGAC  1110

Query 1051  CAACTTCGTGAAGATGCATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGT  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAACTTCGTGAAGATGCATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGT  1184

Query 1125  CTCCAGAGACCTTCAGATTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGC  1198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCCAGAGACCTTCAGATTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGC  1258

Query 1199  AGGACATTGAAAGGTACAAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTG  1272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGACATTGAAAGGTACAAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTG  1332

Query 1273  CAGCTGGGCCTGGACTGGCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGAT  1346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGCTGGGCCTGGACTGGCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGAT  1406

Query 1347  TCAGGGTCTGAGCATGGCAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGG  1420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCAGGGTCTGAGCATGGCAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGG  1480

Query 1421  AGGTGGTGCTGAAGGCCATGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGA  1494
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGTGGTGCTGAAGGCCGTGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGA  1554

Query 1495  CCAGGGGCACAGATGCTTCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCG  1568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCAGGGGCACAGATGCTTCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCG  1628

Query 1569  GCTCCGAGAGCAGAACACGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATC  1642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCTCCGAGAGCAGAACACGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATC  1702

Query 1643  AGATTCCTCCTCCCATCCAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGAT  1716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGATTCCTCCTCCCATCCAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGAT  1776

Query 1717  GCCGCCACTCCTGATTATGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGA  1790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCGCCACTCCTGATTATGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGA  1850

Query 1791  AAAGCATCTAGAAGATGTGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCA  1864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AAAGCATCTAGAAGATGTGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCA  1924

Query 1865  CCTCGACAGAGACGACTGGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGA  1938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCTCGACAGAGACGACTGGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGA  1998

Query 1939  GGATCTGTCCAAGCTGGCCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAA  2012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGATCTGTCCAAGCTGGCCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAA  2072

Query 2013  CCTGCTGGTGACACGACTCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTC  2086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCTGCTGGTGACACGACTCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTC  2146

Query 2087  CCCGTGAGGTGGACCAGGTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTC  2160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCCGTGAGGTGGACCAGGTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTC  2220

Query 2161  AGGATAGCCCAGCACGGGGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGG  2234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGGATAGCCCAGCACGGGGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGG  2294

Query 2235  GAGAGAGGTGGGTGNCCGC-------------------------------------------------------  2253
            |||||||      |.||.|                                                       
Sbjct 2295  GAGAGAG------GGCCTCACCAAGAGAGGGCCTATGGAGGCCGAGGACCAGGGGGAGCTTTTCCTGCACCTCC  2362

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2363  GGTCAGTGGCACGTGCCCCCCAGACCTTATCTATGCACCGACTCCAGAGAAAGCTGAAGGAGGCAGCCAGAAAA  2436

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2437  ATCATCAGCCTCCGCCTGGAGAAAGAGCAGCTCATCGAGATGGGGAACAGGCTCCGTGCAGAGCTGGGCCGACC  2510

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2511  CGAAAGGTGGCTGTTGCACCACGCCCTCCCTCCTGCCCCTGAGGCCCGGAAGCCAGGCGAGGAGCCCAGGAGGC  2584

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2585  CTTTGGATCGCAGCCCACCTTTGGGACAGGTGCAGCCCCATTTTACATCTCAGGACGCCAAGAGTGCCGAGGAT  2658

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2659  GAGGCTCCTTCCAGACACTTGGGAAAGCACCAGCCCCGCTCAGCACAGGTGGGCAGCAGACTTGACGCCCTGCA  2732

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2733  AGGCCCGAAGACACAACACAGCATCCACACGGTGACCTGTAAATCACCTCGGCAGAAAGAAGACAGGTCCCCAA  2806

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2807  AGCCACCCCAGGCTCCCCAGCACCCTGAGGAGCATGGTCGCCAATCCCACAGCTCCTCCTCCTTTGCCAGTGGC  2880

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2881  ACCCTCCAGGACATGTGGAGGTTGCTAGACCTGGGATCCAGCCCTTCTGGTGTCACCTCCCAGGGTGACTCAAC  2954

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2955  TCCAGAAATGGGGTCTCACTATGTCACCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCAGTCCTGCCGCCTTGG  3028

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3029  CCTCCCAAAGTGCTGAGATGACAGGTGTGGGCCCCACGCCCAGCCTGGCGTGGAGTGGAGCCCTTCACCCAAAC  3102

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3103  ATGAACCAGGAGGCGAGCTTGGTAAGGAGCACGTGGGCTCCAGGAATGCGAGGGGGAATGAATGGAGGCAGCTC  3176

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3177  CTCAGTGTGCAAAAACATGCAGCGCGGGCCTCACTGGTCACCATCACAGCAGCCTTGCAGTGGGATCAGGACAG  3250

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3251  TCCTGCTGTCCAGGAAGGAGAGGACCCTGCTCTCTTGTTTCTCACTACCTGCTCCTGTCGTTCTAGTCCCATTG  3324

Query 2254  ------------------------------------------------------  2253
                                                                  
Sbjct 3325  CTGCTCTCAGGACAAGCTGTGACTGAGAGAGCAGGTCACGCTGGTGACATTTTA  3378