Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14460
- Subject:
- XR_001752485.2
- Aligned Length:
- 2919
- Identities:
- 2242
- Gaps:
- 672
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 TGTGGCTACTCTTCGGCAGTCAGTGGAGGAAGTGAAAAAAAACACGGGGTCACAGGTATTTCTGGAAAACTCAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ACTGTTTTTCCTCTACTCTGATACCACAAGAATCATCAGCACAGAGGAAGACTTCTGTGATCAAATGTGGTGGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGAGGGAGGTTTTCACCAGCACATGAGCAGTCAGTTCTGCCGCAGACTCGGCGGGTGTCCTTCGGTTCAGTTCC 222
Query 1 -------------------------------------------ATGCTGCCACTGGGCTCAGAGCCCGCCCTGA 31
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACACCGCCTGCCTGGAGAGAGGTCAGACCACAGGCGGCCACCATGCTGCCACTGGGCTCAGAGCCCGCCCTGA 296
Query 32 ATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCCAGCTGCAGGAGGCGGCT 105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCCAGCTGCAGGAGGCGGCT 370
Query 106 CTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAGGAGGACTTTGTCTACAA 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAGGAGGACTTTGTCTACAA 444
Query 180 CCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGCCCAGGCCAGGGAGTGGG 253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGCCCAGGCCAGGGAGTGGG 518
Query 254 AGGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGCAGGCGCTAGCCAGAGAG 327
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGCAGGCGCTAGCCAGAGAG 592
Query 328 GCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGCCTGGAGCTGGAGCGCGT 401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGCCTGGAGCTGGAGCGCGT 666
Query 402 CCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAAATGGACACTGGAGAGAA 475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAAATGGACACTGGAGAGAA 740
Query 476 AACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGTTTGAATCGAAAATGCGG 549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGTTTGAATCGAAAATGCGG 814
Query 550 AAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCCCGGGAGCTTAAGGTTAA 623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCCCGGGAGCTTAAGGTTAA 888
Query 624 ACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAGTCTGCAGAGGGCAGAGG 697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAGTCTGCAGAGGGCAGAGG 962
Query 698 CCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGATCTGGAGGCCATGAGCCGC 771
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGACCTGGAGGCCATGAGCCGC 1036
Query 772 GCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAGGAAGAGGAAACATTTAA 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAGGAAGAGGAAACATTTAA 1110
Query 846 GAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGCGGTGAAGGGAGCCCACG 919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGCGGTGAAGGGAGCCCACG 1184
Query 920 TGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGACCCTCGAGGCGCAGCTC 993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGACCCTCGAGGCGCAGCTC 1258
Query 994 CGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGACCAACTTCGTGAAGATGC 1067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGACCAACTTCGTGAAGATGC 1332
Query 1068 ATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGTCTCCAGAGACCTTCAGA 1141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGTCTCCAGAGACCTTCAGA 1406
Query 1142 TTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGCAGGACATTGAAAGGTAC 1215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGCAGGACATTGAAAGGTAC 1480
Query 1216 AAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTGCAGCTGGGCCTGGACTG 1289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTGCAGCTGGGCCTGGACTG 1554
Query 1290 GCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGATTCAGGGTCTGAGCATGG 1363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGATTCAGGGTCTGAGCATGG 1628
Query 1364 CAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGGAGGTGGTGCTGAAGGCC 1437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGGAGGTGGTGCTGAAGGCC 1702
Query 1438 ATGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGACCAGGGGCACAGATGCT 1511
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGACCAGGGGCACAGATGCT 1776
Query 1512 TCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCGGCTCCGAGAGCAGAACA 1585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCGGCTCCGAGAGCAGAACA 1850
Query 1586 CGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATCAGATTCCTCCTCCCATC 1659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATCAGATTCCTCCTCCCATC 1924
Query 1660 CAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGATGCCGCCACTCCTGATTA 1733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGATGCCGCCACTCCTGATTA 1998
Query 1734 TGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGAAAAGCATCTAGAAGATG 1807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGAAAAGCATCTAGAAGATG 2072
Query 1808 TGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCACCTCGACAGAGACGACT 1881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCACCTCGACAGAGACGACT 2146
Query 1882 GGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAAGCTGG 1955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAAGCTGG 2220
Query 1956 CCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGACACGAC 2029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGACACGAC 2294
Query 2030 TCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGGACCAG 2103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGGACCAG 2368
Query 2104 GTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAGCACGG 2177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAGCACGG 2442
Query 2178 GGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGGGAGAGAGGTGGGTGNCC 2251
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.||
Sbjct 2443 GGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGGGAGAGAG------GGCC 2510
Query 2252 GC------------------------------------------------------------------------ 2253
.|
Sbjct 2511 TCACCAAGAGAGGGCCTATGGAGGCCGAGGACCAGGGGGAGCTTTTCCTGCACCTCCGGTCAGTGGCACGTGCC 2584
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2585 CCCCAGACCTTATCTATGCACCGACTCCAGAGAAAGCTGAAGGAGGCAGCCAGAAAAATCATCAGCCTCCGCCT 2658
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2659 GGAGAAAGAGCAGCTCATCGAGATGGGGAACAGGCTCCGTGCAGAGCTGGGCCGACCCGAAAGACGCCAAGAGT 2732
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2733 GCCGAGGATGAGGCTCCTTCCAGACACTTGGGAAAGCACCAGCCCCGCTCAGCACAGGTGGGCAGCAGACTTGA 2806
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2807 CGCCCTGCAAGGCCCGAAGACACAACACAGCATCCACACGGTGACCTGTAAATCACCTCGGCAGAAAGAAGACA 2880
Query 2254 --------------------------------- 2253
Sbjct 2881 GGTCCCCAAAGCCACCCCAGGCTCCCCAGCACC 2913