Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14460
• Subject: XR_001752490.2
• Aligned Length: 2659
• Identities: 2020
• Gaps: 636

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  TAGAAATGGCTGTGGCTACTCTTCGGCAGTCAGTGGAGGAAGTGAAAAAAAACACGGGGTCACAGGTATTTCTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GAAAACTCAAACTGTTTTTCCTCTACTCTGATACCACAAGAATCATCAGCACAGAGGAAGACTTCTGTGATCAA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ATGTGGTGGGAGAGGGAGGTTTTCACCAGCACATGAGCAGTCAGTTCTGCCGCAGACTCGGCGGGTGTCCTTCG  222

Query    1  -----------------------------------------------------ATGCTGCCACTGGGCTCAGAG  21
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTCAGTTCCAACACCGCCTGCCTGGAGAGAGGTCAGACCACAGGCGGCCACCATGCTGCCACTGGGCTCAGAG  296

Query   22  CCCGCCCTGAATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCCAGCTGCA  95
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCGCCCTGAATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCCAGCTGCA  370

Query   96  GGAGGCGGCTCTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAGGAGGACT  169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGAGGCGGCTCTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAGGAGGACT  444

Query  170  TTGTCTACAACCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGCCCAGGCC  243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTGTCTACAACCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGCCCAGGCC  518

Query  244  AGGGAGTGGGAGGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGCAGGCGCT  317
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGGAGTGGGAAGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGCAGGCGCT  592

Query  318  AGCCAGAGAGGCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGCCTGGAGC  391
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCCAGAGAGGCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGCCTGGAGC  666

Query  392  TGGAGCGCGTCCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAAATGGACA  465
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGGAGCGCGTCCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAAATGGACA  740

Query  466  CTGGAGAGAAAACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGTTTGAATC  539
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGGAGAGAAAACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGTTTGAATC  814

Query  540  GAAAATGCGGAAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCCCGGGAGC  613
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAAAATGCGGAAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCCCGGGAGC  888

Query  614  TTAAGGTTAAACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAGTCTGCAG  687
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTAAGGTTAAACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAGTCTGCAG  962

Query  688  AGGGCAGAGGCCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGATCTGGAGGC  761
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  963  AGGGCAGAGGCCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGACCTGGAGGC  1036

Query  762  CATGAGCCGCGCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAGGAAGAGG  835
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CATGAGCCGCGCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAGGAAGAGG  1110

Query  836  AAACATTTAAGAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGCGGTGAAG  909
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAACATTTAAGAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGCGGTGAAG  1184

Query  910  GGAGCCCACGTGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGACCCTCGA  983
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGCCCACGTGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGACCCTCGA  1258

Query  984  GGCGCAGCTCCGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGACCAACTTC  1057
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGCGCAGCTCCGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGACCAACTTC  1332

Query 1058  GTGAAGATGCATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGTCTCCAGA  1131
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGAAGATGCATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGTCTCCAGA  1406

Query 1132  GACCTTCAGATTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGCAGGACAT  1205
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GACCTTCAGATTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGCAGGACAT  1480

Query 1206  TGAAAGGTACAAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTGCAGCTGG  1279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGAAAGGTACAAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTGCAGCTGG  1554

Query 1280  GCCTGGACTGGCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGATTCAGGGT  1353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCCTGGACTGGCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGATTCAGGGT  1628

Query 1354  CTGAGCATGGCAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGGAGGTGGT  1427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTGAGCATGGCAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGGAGGTGGT  1702

Query 1428  GCTGAAGGCCATGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGACCAGGGG  1501
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCTGAAGGCCGTGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGACCAGGGG  1776

Query 1502  CAC-----------------------------------------------------------------------  1504
            |||                                                                       
Sbjct 1777  CACAGGGAGACAGGAGACATCAATCAACATATGTAAGATGAACAGTGGTTCCATCTGCAGAGGCGGGACAACTC  1850

Query 1505  ---------------------------AGATGCTTCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCA  1551
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAAGTGGGGAGGAGGCTTCCGGGTCATAGATGCTTCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCA  1924

Query 1552  TCCAGTGAGATCCAGCGGCTCCGAGAGCAGAACACGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAAT  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCCAGTGAGATCCAGCGGCTCCGAGAGCAGAACACGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAAT  1998

Query 1626  GGAGGCTCTAAGCCATCAGATTCCTCCTCCCATCCAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACC  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGAGGCTCTAAGCCATCAGATTCCTCCTCCCATCCAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACC  2072

Query 1700  CAGAGGCTGGGGGAGATGCCGCCACTCCTGATTATGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCAT  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CAGAGGCTGGGGGAGATGCCGCCACTCCTGATTATGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCAT  2146

Query 1774  AAGTTTAAAACTCTGGAAAAGCATCTAGAAGATGTGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTC  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AAGTTTAAAACTCTGGAAAAGCATCTAGAAGATGTGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTC  2220

Query 1848  TCAGCCCAGCGTCCGCACCTCGACAGAGACGACT---------------------------------GGAGGGT  1888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 |||||||
Sbjct 2221  TCAGCCCAGCGTCCGCACCTCGACAGAGACGACTGGTATGAGCTGACAGAAGCCACTCTTCTCTGCAGGAGGGT  2294

Query 1889  CTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAAGCTGGCCCAGTA  1962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAAGCTGGCCCAGTA  2368

Query 1963  TCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGACACGACTCAGACA  2036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct 2369  TCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGA-------------  2429

Query 2037  GAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGGACCAGGTACACC  2110
                                                                                      
Sbjct 2430  --------------------------------------------------------------------------  2429

Query 2111  TGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAGCACGGGGGAGCG  2184
                                                                                      
Sbjct 2430  --------------------------------------------------------------------------  2429

Query 2185  GAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGGGAGAGAGGTGGGTGNCCGC  2253
                                                                                 
Sbjct 2430  ---------------------------------------------------------------------  2429