Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14460
- Subject:
- XR_001752494.1
- Aligned Length:
- 2646
- Identities:
- 1948
- Gaps:
- 694
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 TTTAGAAATGGCTGTGGCTACTCTTCGGCAGTCAGTGGAGGAAGTGAAAAAAAACACGGGGTCACAGGTATTTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGGAAAACTCAAACTGTTTTTCCTCTACTCTGATACCACAAGAATCATCAGCACAGAGGAAGACTTCTGTGATC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AAATGTGGTGGGAGAGGGAGGTTTTCACCAGCACATGAGCAGTCAGTTCTGCCGCAGACTCGGCGGGTGTCCTT 222
Query 1 -------------------------------------------------------ATGCTGCCACTGGGCTCAG 19
|||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGGTTCAGTTCCAACACCGCCTGCCTGGAGAGAGGTCAGACCACAGGCGGCCACCATGCTGCCACTGGGCTCAG 296
Query 20 AGCCCGCCCTGAATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCCAGCTG 93
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGCCCGCCCTGAATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCCAGCTG 370
Query 94 CAGGAGGCGGCTCTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAGGAGGA 167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAGGAGGCGGCTCTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAGGAGGA 444
Query 168 CTTTGTCTACAACCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGCCCAGG 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTTTGTCTACAACCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGCCCAGG 518
Query 242 CCAGGGAGTGGGAGGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGCAGGCG 315
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCAGGGAGTGGGAAGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGCAGGCG 592
Query 316 CTAGCCAGAGAGGCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGCCTGGA 389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTAGCCAGAGAGGCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGCCTGGA 666
Query 390 GCTGGAGCGCGTCCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAAATGGA 463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTGGAGCGCGTCCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAAATGGA 740
Query 464 CACTGGAGAGAAAACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGTTTGAA 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CACTGGAGAGAAAACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGTTTGAA 814
Query 538 TCGAAAATGCGGAAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCCCGGGA 611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCGAAAATGCGGAAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCCCGGGA 888
Query 612 GCTTAAGGTTAAACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAGTCTGC 685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCTTAAGGTTAAACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAGTCTGC 962
Query 686 AGAGGGCAGAGGCCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGATCTGGAG 759
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 963 AGAGGGCAGAGGCCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGACCTGGAG 1036
Query 760 GCCATGAGCCGCGCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAGGAAGA 833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCCATGAGCCGCGCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAGGAAGA 1110
Query 834 GGAAACATTTAAGAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGCGGTGA 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGAAACATTTAAGAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGCGGTGA 1184
Query 908 AGGGAGCCCACGTGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGACCCTC 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGGGAGCCCACGTGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGACCCTC 1258
Query 982 GAGGCGCAGCTCCGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGACCAACT 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GAGGCGCAGCTCCGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGACCAACT 1332
Query 1056 TCGTGAAGATGCATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGTCTCCA 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCGTGAAGATGCATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGTCTCCA 1406
Query 1130 GAGACCTTCAGATTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGCAGGAC 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAGACCTTCAGATTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGCAGGAC 1480
Query 1204 ATTGAAAGGTACAAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTGCAGCT 1277
||||||
Sbjct 1481 ATTGAA-------------------------------------------------------------------- 1486
Query 1278 GGGCCTGGACTGGCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGATTCAGG 1351
Sbjct 1487 -------------------------------------------------------------------------- 1486
Query 1352 GTCTGAGCATGGCAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGGAGGTG 1425
Sbjct 1487 -------------------------------------------------------------------------- 1486
Query 1426 GTGCTGAAGGCCATGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGACCAGG 1499
Sbjct 1487 -------------------------------------------------------------------------- 1486
Query 1500 GGCACAGATGCTTCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCGGCTCC 1573
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1487 -----AGATGCTTCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCGGCTCC 1555
Query 1574 GAGAGCAGAACACGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATCAGATT 1647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 GAGAGCAGAACACGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATCAGATT 1629
Query 1648 CCTCCTCCCATCCAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGATGCCGC 1721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1630 CCTCCTCCCATCCAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGATGCCGC 1703
Query 1722 CACTCCTGATTATGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGAAAAGC 1795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1704 CACTCCTGATTATGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGAAAAGC 1777
Query 1796 ATCTAGAAGATGTGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCACCTCG 1869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1778 ATCTAGAAGATGTGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCACCTCG 1851
Query 1870 ACAGAGACGACT---------------------------------GGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGG 1910
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1852 ACAGAGACGACTGGTATGAGCTGACAGAAGCCACTCTTCTCTGCAGGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGG 1925
Query 1911 AGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAAGCTGGCCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGA 1984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1926 AGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAAGCTGGCCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGA 1999
Query 1985 AGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGACACGACTCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTG 2058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2000 AGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGACACGACTCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTG 2073
Query 2059 GAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGGACCAGGTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAA 2132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2074 GAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGGACCAGGTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAA 2147
Query 2133 GCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAGCACGGGGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGC 2206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2148 GCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAGCACGGGGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGC 2221
Query 2207 CCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGGGAGAGAGGTGGGTGNCCGC--------------------------- 2253
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.||.|
Sbjct 2222 CCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGGGAGAGAG------GGCCTCACCAAGAGAGGGCCTATGGAGGCCGAG 2289
Query 2254 -------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2290 GACCAGGGGGAGCTTTTCCTGCACCTCCGGTCAGTGGCACGTGCCCCCCAGACCTT 2345