Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14527
• Subject: NM_001347663.1
• Aligned Length: 1527
• Identities: 1525
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGTAGATGGAGTGATGATTCTTCCTGTGCTTATCATGATTGCTCTCCCCTCCCCTAGTATGGAAGATGAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTAGATGGAGTGATGATTCTTCCTGTGCTTATCATGATTGCTCTCCCCTCCCCTAGTATGGAAGATGAGAA  74

Query   75  GCCCAAGGTCAACCCCAAACTCTACATGTGTGTGTGTGAAGGTCTCTCCTGCGGTAATGAGGACCACTGTGAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCCAAGGTCAACCCCAAACTCTACATGTGTGTGTGTGAAGGTCTCTCCTGCGGTAATGAGGACCACTGTGAAG  148

Query  149  GCCAGCAGTGCTTTTCCTCACTGAGCATCAACGATGGCTTCCACGTCTACCAGAAAGGCTGCTTCCAGGTTTAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCAGCAGTGCTTTTCCTCACTGAGCATCAACGATGGCTTCCACGTCTACCAGAAAGGCTGCTTCCAGGTTTAT  222

Query  223  GAGCAGGGAAAGATGACCTGTAAGACCCCGCCGTCCCCTGGCCAAGCTGTGGAGTGCTGCCAAGGGGACTGGTG  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGCAGGGAAAGATGACCTGTAAGACCCCGCCGTCCCCTGGCCAAGCCGTGGAGTGCTGCCAAGGGGACTGGTG  296

Query  297  TAACAGGAACATCACGGCCCAGCTGCCCACTAAAGGAAAATCCTTCCCTGGAACACAGAATTTCCACTTGGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAACAGGAACATCACGGCCCAGCTGCCCACTAAAGGAAAATCCTTCCCTGGAACACAGAATTTCCACTTGGAGG  370

Query  371  TTGGCCTCATTATTCTCTCTGTAGTGTTCGCAGTATGTCTTTTAGCCTGCCTGCTGGGAGTTGCTCTCCGAAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGGCCTCATTATTCTCTCTGTAGTGTTCGCAGTATGTCTTTTAGCCTGCCTGCTGGGAGTTGCTCTCCGAAAA  444

Query  445  TTTAAAAGGCGCAACCAAGAACGCCTCAATCCCCGAGACGTGGAGTATGGCACTATCGAAGGGCTCATCACCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTAAAAGGCGCAACCAAGAACGCCTCAATCCCCGAGACGTGGAGTATGGCACTATCGAAGGGCTCATCACCAC  518

Query  519  CAATGTTGGAGACAGCACTTTAGCAGATTTATTGGATCATTCGTGTACATCAGGAAGTGGCTCTGGTCTTCCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAATGTTGGAGACAGCACTTTAGCAGATTTATTGGATCATTCGTGTACATCAGGAAGTGGCTCTGGTCTTCCTT  592

Query  593  TTCTGGTACAAAGAACAGTGGCTCGCCAGATTACACTGTTGGAGTGTGTCGGGAAAGGCAGGTATGGTGAGGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCTGGTACAAAGAACAGTGGCTCGCCAGATTACACTGTTGGAGTGTGTCGGGAAAGGCAGGTATGGTGAGGTG  666

Query  667  TGGAGGGGCAGCTGGCAAGGGGAAAATGTTGCCGTGAAGATCTTCTCCTCCCGTGATGAGAAGTCATGGTTCAG  740
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGGAGGGGCAGCTGGCAAGGGGAGAATGTTGCCGTGAAGATCTTCTCCTCCCGTGATGAGAAGTCATGGTTCAG  740

Query  741  GGAAACGGAATTGTACAACACTGTGATGCTGAGGCATGAAAATATCTTAGGTTTCATTGCTTCAGACATGACAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAAACGGAATTGTACAACACTGTGATGCTGAGGCATGAAAATATCTTAGGTTTCATTGCTTCAGACATGACAT  814

Query  815  CAAGACACTCCAGTACCCAGCTGTGGTTAATTACACATTATCATGAAATGGGATCGTTGTACGACTATCTTCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAAGACACTCCAGTACCCAGCTGTGGTTAATTACACATTATCATGAAATGGGATCGTTGTACGACTATCTTCAG  888

Query  889  CTTACTACTCTGGATACAGTTAGCTGCCTTCGAATAGTGCTGTCCATAGCTAGTGGTCTTGCACATTTGCACAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTACTACTCTGGATACAGTTAGCTGCCTTCGAATAGTGCTGTCCATAGCTAGTGGTCTTGCACATTTGCACAT  962

Query  963  AGAGATATTTGGGACCCAAGGGAAACCAGCCATTGCCCATCGAGATTTAAAGAGCAAAAATATTCTGGTTAAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAGATATTTGGGACCCAAGGGAAACCAGCCATTGCCCATCGAGATTTAAAGAGCAAAAATATTCTGGTTAAGA  1036

Query 1037  AGAATGGACAGTGTTGCATAGCAGATTTGGGCCTGGCAGTCATGCATTCCCAGAGCACCAATCAGCTTGATGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAATGGACAGTGTTGCATAGCAGATTTGGGCCTGGCAGTCATGCATTCCCAGAGCACCAATCAGCTTGATGTG  1110

Query 1111  GGGAACAATCCCCGTGTGGGCACCAAGCGCTACATGGCCCCCGAAGTTCTAGATGAAACCATCCAGGTGGATTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGAACAATCCCCGTGTGGGCACCAAGCGCTACATGGCCCCCGAAGTTCTAGATGAAACCATCCAGGTGGATTG  1184

Query 1185  TTTCGATTCTTATAAAAGGGTCGATATTTGGGCCTTTGGACTTGTTTTGTGGGAAGTGGCCAGGCGGATGGTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTCGATTCTTATAAAAGGGTCGATATTTGGGCCTTTGGACTTGTTTTGTGGGAAGTGGCCAGGCGGATGGTGA  1258

Query 1259  GCAATGGTATAGTGGAGGATTACAAGCCACCGTTCTACGATGTGGTTCCCAATGACCCAAGTTTTGAAGATATG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCAATGGTATAGTGGAGGATTACAAGCCACCGTTCTACGATGTGGTTCCCAATGACCCAAGTTTTGAAGATATG  1332

Query 1333  AGGAAGGTAGTCTGTGTGGATCAACAAAGGCCAAACATACCCAACAGATGGTTCTCAGACCCGACATTAACCTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGGAAGGTAGTCTGTGTGGATCAACAAAGGCCAAACATACCCAACAGATGGTTCTCAGACCCGACATTAACCTC  1406

Query 1407  TCTGGCCAAGCTAATGAAAGAATGCTGGTATCAAAATCCATCCGCAAGACTCACAGCACTGCGTATCAAAAAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCTGGCCAAGCTAATGAAAGAATGCTGGTATCAAAATCCATCCGCAAGACTCACAGCACTGCGTATCAAAAAGA  1480

Query 1481  CTTTGACCAAAATTGATAATTCCCTCGACAAATTGAAAACTGACTGT  1527
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTTTGACCAAAATTGATAATTCCCTCGACAAATTGAAAACTGACTGT  1527