Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14546
• Subject: NM_001190974.1
• Aligned Length: 2692
• Identities: 2264
• Gaps: 65

Alignment

Query    1  ATGGCGTGGCGGTGCCCCAGGATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGCTTGGCGCTGTGCGGCTGGGCGTGCAT  74
                                 ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||.|||  |
Sbjct    1  ---------------------ATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGGTTGGCGCTGTGCTGCTGGGGGTG--T  51

Query   75  G--GCCCCCAGGGGCACGCAGGCTGA---AGAAAGTCCCTTCGTGGGCAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCCG  143
            |  ||||..|.||.|||.|||.|.||   .|..||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   52  GCAGCCCATAAGGACACACAGACCGAGGCTGGCAGCCCGTTTGTGGGGAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCAG  125

Query  144  GGGACTCACGGGCACCCTTCGGTGTCAGCTCCAGGTTCAGGGAGAGCCCCCCGAGGTACATTGGCTTCGGGATG  217
            .|||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||....||||||||.||||
Sbjct  126  AGGACTCACGGGGACACTTCGGTGTGAGCTCCAGGTTCAGGGGGAACCCCCTGAGGTGGTGTGGCTTCGAGATG  199

Query  218  GACAGATCCTGGAGCTCGCGGACAGCACCCAGACCCAGGTGCCCCTGGGTGAGGA-TGAACAGGATGACTGGAT  290
            ||||||||||.||.||.||.||.|.||||||||||||||||||.|||||.||.|| || .||.|||||.||||.
Sbjct  200  GACAGATCCTAGAACTGGCTGATAACACCCAGACCCAGGTGCCTCTGGGCGAAGACTG-GCAAGATGAATGGAA  272

Query  291  AGTGGTCAGCCAGCTCAGAATCACCTCCCTGCAGCTTTCCGA--CACGGGACAGTACCAGTGTTTGGTGTTTCT  362
            |||.|||||.||||||||||||.|..|||||||.|||||.||  ||.|||  |||||||||||.|||||..|||
Sbjct  273  AGTTGTCAGTCAGCTCAGAATCTCAGCCCTGCAACTTTCAGATGCAGGGG--AGTACCAGTGTATGGTGCATCT  344

Query  363  GGGACATCAGACCTTCGTGTCCCAGCCTGGCTATGTTGGGCTGGAGGGCTTGCCTTACTTCCTGGAGGAGCCCG  436
            .|.|...|.||||||.|||||.|||||.||||.|||.||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  345  AGAAGGACGGACCTTTGTGTCTCAGCCGGGCTTTGTAGGGCTGGAAGGTCTCCCGTACTTCCTGGAGGAGCCTG  418

Query  437  AAGACAGGACTGTGGCCGCCAACACCCCCTTCAACCTGAGCTGCCAAGCTCAGGGACCCCCAGAGCCCGTGGAC  510
            |.||||...|||||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||..|
Sbjct  419  AGGACAAAGCTGTGCCTGCCAACACCCCTTTCAACCTAAGCTGCCAGGCCCAGGGACCCCCGGAACCCGTGACC  492

Query  511  CTACTCTGGCTCCAGGATGCTGTCCCCCTGGCCACGGCTC-CAGGTCACGGCCCCCAGCGCAGCCTGCATGTTC  583
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.| || ||||.|||.||.||||||.|||.|||||...||
Sbjct  493  CTACTCTGGCTTCAAGATGCTGTCCCCCTGGCCCCAG-TCACAGGACACAGCTCCCAGCACAGTCTGCAAACTC  565

Query  584  CAGGGCTGAACAAGACATCCTCTTTCTCCTGCGAAGCCCATAACGCCAAGGGGGTCACCACATCCCGCACAGCC  657
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  566  CAGGCCTGAACAAGACATCTTCTTTCTCATGTGAAGCCCACAATGCCAAGGGAGTCACCACCTCCCGCACAGCC  639

Query  658  ACCATCACAGTGCTCCCCCAGCAGCCCCGTAACCTCCACCTGGTCTCCCGCCAACCCACGGAGCTGGAGGTGGC  731
            |||||||||||||||||||||..|||.|...|.||||||.||||.|||.|.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  640  ACCATCACAGTGCTCCCCCAGAGGCCTCACCATCTCCACGTGGTTTCCAGACAACCTACGGAGCTAGAGGTAGC  713

Query  732  TTGGACTCCAGGCCTGAGCGGCATCTACCCCCTGACCCACTGCACCCTGCAGGCTGTGCTGTCAGACGATGGGA  805
            ||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.
Sbjct  714  TTGGACCCCTGGCCTGAGTGGCATCTACCCGCTCACCCACTGCAACCTGCAGGCCGTGCTGTCAGACGATGGGG  787

Query  806  TGGGCATCCAGGC-GGGAGAACCAGACCCCCCAGAGGAGCCCCTCACCTCGCAAGCATCCGTGCCCCCCCATCA  878
            ||||.|| |.||| ||||.|..||||.||.||.||.||.||||||||||.|||||.|||.|||||||||||.||
Sbjct  788  TGGGTAT-CTGGCTGGGAAAGTCAGATCCTCCTGAAGACCCCCTCACCTTGCAAGTATCAGTGCCCCCCCACCA  860

Query  879  GCTTCGGCTAGGCAGCCTCCATCCTCACACCCCTTATCACATCCGCGTGGCATGCACCAGCAGCCAGGGCCCCT  952
            |||||||||.|..|..||||.||||||||||||.|||||||||||..|..|.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  861  GCTTCGGCTGGAAAAGCTCCTTCCTCACACCCCGTATCACATCCGGATATCCTGCAGCAGCAGCCAGGGCCCCT  934

Query  953  CATCCTGGACCCACTGGCTTCCTGTGGAGACGCCGGAGGGAGTGCCCCTGGGCCCCCCTGAGAACATTAGTGCT  1026
            ||.|.||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||.||||.||||||||||||.||||.||.
Sbjct  935  CACCTTGGACCCACTGGCTTCCTGTGGAGACCACAGAGGGAGTGCCCTTGGGTCCCCCTGAGAACGTTAGCGCC  1008

Query 1027  ACGCGGAATGGGAGCCAGGCCTTCGTGCATTGGCAAGAGCCCCGGGCGCCCCTGCAGGGTACCCTGTTAGGGTA  1100
            |.|||||||||||||||||.|.||||||.||||||.|||||..|||.|||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1009  ATGCGGAATGGGAGCCAGGTCCTCGTGCGTTGGCAGGAGCCAAGGGTGCCCCTGCAAGGCACCCTGTTAGGGTA  1082

Query 1101  CCGGCTGGCGTATCAAGGCCAGGACACCCCAGAGGTGCTAATGGACATAGGGCTAAGGCAAGAGGTGACCCTGG  1174
            |||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||..|.||||||||||.|||
Sbjct 1083  CCGGCTGGCATATCGAGGCCAGGACACCCCCGAGGTACTTATGGATATAGGGCTAACTCGAGAGGTGACCTTGG  1156

Query 1175  AGCTGCAGGGGGACGGGTCTGTGTCCAATCTGACAGTGTGTGTGGCAGCCTACACTGCTGCTGGGGATGGACCC  1248
            |.||||.|||||||.||.|||||.|.||.|||||.||||.||||.|||||||.||..|.|||||||||||.|||
Sbjct 1157  AACTGCGGGGGGACAGGCCTGTGGCTAACCTGACTGTGTCTGTGACAGCCTATACCTCGGCTGGGGATGGGCCC  1230

Query 1249  TGGAGCCTCCCAGTACCCCTGGAGGCCTGGCGCCCAGGGCAAGCACAGCCAGTCCACCAGCTGGTGAAGGAACC  1322
            ||||||||.||.||.|||||.|||.|||||||||||                           ||||..|||||
Sbjct 1231  TGGAGCCTTCCTGTGCCCCTAGAGCCCTGGCGCCCA---------------------------GTGAGTGAACC  1277

Query 1323  TTCAACTCCTGCCTTCTCGTGGCCCTGGTGGTATGTACTGCTAGGAGCAGTCGTGGCCGCTGCCTGTGTCCTCA  1396
            ..||.|||..||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1278  CCCACCTCGCGCCTTCTCGTGGCCTTGGTGGTATGTACTGCTGGGAGCACTTGTGGCTGCCGCCTGCGTCCTCA  1351

Query 1397  TCTTGGCTCTCTTCCTTGTCCACCGGCGAAAGAAGGAGACCCGTTATGGAGAAGTGTTTGAACCAACAGTGGAA  1470
            |||||||.||.|||||||||||.|||.|.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1352  TCTTGGCCCTGTTCCTTGTCCATCGGAGGAAGAAGGAGACTCGATATGGGGAGGTGTTTGAGCCAACCGTGGAA  1425

Query 1471  AGAGGTGAACTGGTAGTCAGGTACCGCGTGCGCAAGTCCTACAGTCGTCGGACCACTGAAGCTACCTTGAACAG  1544
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1426  AGAGGTGAACTGGTAGTCAGGTACCGTGTCCGAAAGTCCTACAGCCGGCGGACCACTGAAGCCACCTTGAACAG  1499

Query 1545  CCTGGGCATCAGTGAAGAGCTGAAGGAGAAGCTGCGGGATGTGATGGTGGACCGGCACAAGGTGGCCCTGGGGA  1618
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||||||.||||||
Sbjct 1500  TCTGGGCATCAGTGAAGAGCTGAAGGAGAAACTACGAGACGTCATGGTAGATCGGCATAAGGTGGCCTTGGGGA  1573

Query 1619  AGACTCTGGGAGAGGGAGAGTTTGGAGCTGTGATGGAAGGCCAGCTCAACCAGGACGACTCCATCCTCAAGGTG  1692
            ||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1574  AGACCCTGGGAGAAGGAGAATTTGGCGCTGTGATGGAAGGTCAGCTCAATCAGGATGACTCCATCCTCAAGGTC  1647

Query 1693  GCTGTGAAGACGATGAAGATTGCCATCTGCACGAGGTCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCGGTCTGCAT  1766
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1648  GCTGTGAAGACCATGAAAATTGCCATCTGCACAAGATCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCTGTCTGCAT  1721

Query 1767  GAAGGAATTTGACCATCCCAACGTCATGAGGCTCATCGGTGTCTGTTTCCAGGGTTCTGAACGAGAGAGCTTCC  1840
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||..|||||.|.||||
Sbjct 1722  GAAGGAATTTGACCACCCCAACGTCATGAGGCTCATTGGCGTCTGTTTTCAGGGCTCTGACAGAGAGGGTTTCC  1795

Query 1841  CAGCACCTGTGGTCATCTTACCTTTCATGAAACATGGAGACCTACACAGCTTCCTCCTCTATTCCCGGCTCGGG  1914
            |||.|||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1796  CAGAACCTGTGGTCATCTTGCCTTTCATGAAACACGGAGACCTACACAGTTTCCTCCTGTACTCCCGGCTCGGG  1869

Query 1915  GACCAGCCAGTGTACCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCAGACATCGCCAGTGGCATGGAGTATCT  1988
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1870  GACCAGCCAGTGTTCCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCCGACATTGCCAGTGGTATGGAGTACCT  1943

Query 1989  GAGTACCAAGAGATTCATACACCGGGACCTGGCGGCCAGGAACTGCATGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTG  2062
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1944  GAGTACCAAGAGATTCATACATCGGGACCTGGCTGCCAGGAACTGCATGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTG  2017

Query 2063  TGGCGGACTTCGGGCTCTCCAAGAAGATCTACAATGGGGACTACTACCGCCAGGGACGTATCGCCAAGATGCCA  2136
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct 2018  TGGCAGACTTCGGGCTCTCCAAGAAGATCTACAACGGGGATTACTACCGCCAAGGGCGCATTGCCAAGATGCCA  2091

Query 2137  GTCAAGTGGATTGCCATTGAGAGTCTAGCTGACCGTGTCTACACCAGCAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGGGT  2210
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2092  GTCAAGTGGATTGCTATTGAGAGTCTGGCAGATCGGGTCTACACCAGCAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGTGT  2165

Query 2211  GACAATGTGGGAGATTGCCACAAGAGGCCAAACCCCATATCCGGGCGTGGAGAACAGCGAGATTTATGACTATC  2284
            |||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 2166  GACAATGTGGGAGATCGCCACCCGAGGCCAAACTCCCTATCCAGGGGTGGAGAACAGTGAGATTTACGACTACC  2239

Query 2285  TGCGCCAGGGAAATCGCCTGAAGCAGCCTGCGGACTGTCTGGATGGACTGTATGCCTTGATGTCGCGGTGCTGG  2358
            ||||.||.||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 2240  TGCGTCAAGGAAATCGGCTGAAACAGCCTGTGGACTGTCTGGACGGCCTGTATGCCCTGATGTCTCGGTGCTGG  2313

Query 2359  GAGCTAAATCCCCAGGACCGGCCAAGTTTTACAGAGCTGCGGGAAGATTTGGAGAACACACTGAAGGCCTTGCC  2432
            ||.||.||.||.|..|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 2314  GAACTGAACCCTCGAGACCGGCCAAGTTTTGCGGAGCTCCGGGAAGACTTGGAGAACACACTGAAGGCTCTGCC  2387

Query 2433  TCCTGCCCAGGAGCCTGACGAAATCCTCTATGTCAACATGGATGAGGGTGGAGGTTATCCTGAACCCCCTGGAG  2506
            .|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|..|.|.||||||||.|||.|
Sbjct 2388  CCCTGCTCAGGAGCCAGATGAAATCCTCTATGTCAACATGGATGAGGGCGGAAGCCACCTTGAACCCCGTGGGG  2461

Query 2507  CTGCAGGAGGAGCTGACCCCCCAACCCAGCCAGACCCTAAGGATTCCTGTAGCTGCCTCACTGCGGCTGAGGTC  2580
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 2462  CTGCTGGAGGAGCTGACCCCCCAACCCAACCTGATCCTAAGGATTCCTGTAGCTGTCTCACTGCAGCTGACGTC  2535

Query 2581  CATCCTGCTGGACGCTATGTCCTCTGCCCTTCCACAACCCCTAGCCCCGCTCAGCCTGCTGATAGGGGCTCCCC  2654
            ||..|.|||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||..|.|||.|||.|.|||||||.||.||||.|||
Sbjct 2536  CACTCAGCTGGACGCTATGTCCTTTGTCCTTCTACAGCCCCAGGACCCACTCTGTCTGCTGACAGAGGCTGCCC  2609

Query 2655  AGCAGCCCCAGGGCAGGAGGATGGTGCC  2682
            ||||.|.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2610  AGCACCTCCAGGGCAGGAGGACGGAGCC  2637