Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14547
• Subject: XM_017316855.1
• Aligned Length: 2121
• Identities: 1886
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCCTCGCCGGCTGACAGCTGTATCCAGTTCACCCGCCATGCCAGTGATGTTCTTCTCAACCTTAATCGTCT  74
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCCTCCCCGGCTGACAGCTGTATCCAGTTTACCCGGCACGCTAGTGATGTTCTTCTCAACCTTAATCGCCT  74

Query   75  CCGGAGTCGAGACATCTTGACTGATGTTGTCATTGTTGTGAGCCGTGAGCAGTTTAGAGCCCATAAAACGGTCC  148
            |||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct   75  CCGGAGTCGGGACATCTTGACGGACGTTGTCATCGTGGTGAGCCGTGAGCAGTTTAGAGCCCATAAGACAGTGC  148

Query  149  TCATGGCCTGCAGTGGCCTGTTCTATAGCATCTTTACAGACCAGTTGAAATGCAACCTTAGTGTGATCAATCTA  222
            |||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  TCATGGCCTGCAGCGGCCTGTTCTACAGTATCTTCACTGACCAGTTGAAATGCAACCTTAGTGTAATCAATCTA  222

Query  223  GATCCTGAGATCAACCCTGAGGGATTCTGCATCCTCCTGGACTTCATGTACACATCTCGGCTCAATTTGCGGGA  296
            ||||||||.||||.|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.||||
Sbjct  223  GATCCTGAAATCAGCCCTGAGGGGTTTTGCATCCTCCTGGACTTCATGTACACATCTAGGCTCAACCTGAGGGA  296

Query  297  GGGCAACATCATGGCTGTGATGGCCACGGCTATGTACCTGCAGATGGAGCATGTTGTGGACACTTGCCGGAAGT  370
            .|||||.||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||||
Sbjct  297  AGGCAATATCATGGCGGTGATGACCACAGCCATGTACCTGCAGATGGAGCATGTTGTCGACACATGCAGGAAGT  370

Query  371  TTATTAAGGCCAGTGAAGCAGAGATGGTTTCTGCCATCAAGCCTCCTCGTGAAGAGTTCCTCAACAGCCGGATG  444
            |.||.|||||||||||||||||.||||...||||..|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  TCATCAAGGCCAGTGAAGCAGAAATGGCCCCTGCACTTAAACCTCCCCGTGAAGAGTTCCTGAACAGCCGGATG  444

Query  445  CTGATGCCCCAAGACATCATGGCCTATCGGGGTCGTGAGGTGGTGGAGAACAACCTGCCACTGAGGAGCGCCCC  518
            |||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||..||||||||||.|...|.||
Sbjct  445  CTGATGCCCCATGACATCATGGCCTACCGAGGTCGTGAGGTCGTGGAGAACAATATGCCACTGAGAAATACTCC  518

Query  519  TGGGTGTGAGAGCAGAGCCTTTGCCCCCAGCCTGTACAGTGGCCTGTCCGCACCGCCAGCCTCTTATTCCATGT  592
            .|||||||||||||||||.|||||.||....|||||||||||||||||..||||.||||||||||||.||||||
Sbjct  519  CGGGTGTGAGAGCAGAGCTTTTGCTCCTCCTCTGTACAGTGGCCTGTCAACACCACCAGCCTCTTATCCCATGT  592

Query  593  ACAGCCACCTCCCTGTCAGCAGCCTCCTCTTCTCCGATGAGGAGTTTCGGGATG---TCCGGATGCCTGTGGCC  663
            |||||||.|||||..||||||.|.||||||||||.|||||||||.|.||.||||   .|||.||||||||||||
Sbjct  593  ACAGCCATCTCCCGCTCAGCACCTTCCTCTTCTCTGATGAGGAGCTCCGAGATGCCCCCCGAATGCCTGTGGCC  666

Query  664  AACCCCTTCCCCAAGGAGCGGGCACTCCCATGTGATAGTGCCAGGCCAGTCCCTGGTGAGTACAGCCGGCCGAC  737
            |||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||.|||||||..||||||.|||.||||..|
Sbjct  667  AACCCTTTTCCCAAGGAGCGTGCCCTCCCCTGCGACAGTGCCAGGCAAGTCCCTAATGAGTATAGCAGGCCAGC  740

Query  738  TTTGGAGGTGTCCCCCAATGTGTGCCACAGCAATATCTATTCACCCAAGGAAACAATCCCAGAAGAGGCACGAA  811
            ..|||||||||||||||.|.||||.||||||||.|||||.||.||||||||..||.|||||||.|||||.||.|
Sbjct  741  CATGGAGGTGTCCCCCAGTTTGTGTCACAGCAACATCTACTCGCCCAAGGAGGCAGTCCCAGAGGAGGCTCGGA  814

Query  812  GTGATATGCACTACAGTGTGGCTGAGGGCCTCAAACCTGCTGCCCCCTCAGCCCGAAATGCCCCCTACTTCCCT  885
            ||||.||.||||||||||||.|||||||||.|||.|||||||.|||.||.||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct  815  GTGACATACACTACAGTGTGCCTGAGGGCCCCAAGCCTGCTGTCCCTTCTGCTCGGAATGCTCCATACTTCCCC  888

Query  886  TGTGACAAGGCCAGCAAAGAAGAAGAGAGACCCTCCTCGGAAGATGAGATTGCCATGCATTTCGAGCCCCCCAA  959
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGACAAAGCCAGCAAAGAAGAAGAGAGACCTTCTTCGGAGGATGAGATTGCCCTGCATTTCGAGCCCCCCAA  962

Query  960  TGCACCCCTGAACCGGAAGGGTCTGGTTAGTCCACAGAGCCCCCAGAAATCTGACTGCCAGCCCAACTCGCCCA  1033
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  TGCACCCTTGAACCGGAAGGGTCTGGTTAGTCCCCAGAGTCCCCAGAAATCCGACTGCCAGCCCAACTCACCCA  1036

Query 1034  CAGAGTCCTGCAGCAGTAAGAATGCCTGCATCCTCCAGGCTTCTGGCTCCCCTCCAGCCAAGAGCCCCACTGAC  1107
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGAGTCCTGCAGCAGCAAGAACGCCTGCATCCTTCAGGCCTCTGGCTCTCCGCCAGCCAAGAGCCCCACTGAC  1110

Query 1108  CCCAAAGCCTGCTACTGGAAGAAATACAAGTTCATCGTGCTCAACAGCCTCAACCAGAATGCCAAACCAGAGGG  1181
            ||.|||||||||.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  CCGAAAGCCTGCAACTGGAAGAAGTATAAGTTCATCGTTCTCAACAGCCTCAATCAGAATGCCAAACCCGAGGG  1184

Query 1182  GCCTGAGCAGGCTGAGCTGGGCCGCCTTTCCCCACGAGCCTACACGGCCCCACCTGCCTGCCAGCCACCCATGG  1255
            ..||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||.|.||.||.||.||.||||||||.||.||||
Sbjct 1185  CTCTGAGCAGGCAGAGCTGGGTCGCCTCTCCCCTCGAGCCTACCCTGCACCGCCCGCTTGCCAGCCGCCTATGG  1258

Query 1256  AGCCTGAGAACCTTGACCTCCAGTCCCCAACCAAGCTGAGTGCCAGCGGGGAGGACTCCACCATCCCACAAGCC  1329
            ||||.|.|||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1259  AGCCCGCGAACCTTGATCTCCAGTCCCCGACCAAGCTCAGTGCCAGTGGGGAGGACTCTACCATCCCCCAAGCC  1332

Query 1330  AGCCGGCTCAATAACATCGTTAACAGGTCCATGACGGGCTCTCCCCGCAGCAGCAGCGAGAGCCACTCACCACT  1403
            ||||||||||||||..||||.|||||||||.||.|.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1333  AGCCGGCTCAATAATCTCGTGAACAGGTCCCTGGCAGGCTCCCCCCGAAGCAGCAGTGAGAGTCACTCACCACT  1406

Query 1404  CTACATGCACCCCCCGAAGTGCACGTCCTGCGGCTCTCAGTCCCCACAGCATGCAGAGATGTGCCTCCACACCG  1477
            |||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1407  CTACATGCACCCCCCAAAGTGCACATCCTGCGGCTCTCAGTCCCCACAGCATACAGAGATGTGCCTCCATACTG  1480

Query 1478  CTGGCCCCACGTTCCCTGAGGAGATGGGAGAGACCCAGTCTGAGTACTCAGATTCTAGCTGTGAGAACGGGGCC  1551
            ||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 1481  CTGGGCCCACGTTCCCGGAGGAGATGGGGGAAACCCAGTCAGAGTATTCGGATTCTAGCTGTGAGAATGGGACC  1554

Query 1552  TTCTTCTGCAATGAGTGTGACTGCCGCTTCTCTGAGGAGGCCTCACTCAAGAGGCACACGCTGCAGACCCACAG  1625
            |||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1555  TTCTTCTGCAACGAATGTGACTGCCGTTTCTCTGAGGAGGCCTCGCTCAAGAGGCACACGCTGCAGACGCACAG  1628

Query 1626  TGACAAACCCTACAAGTGTGACCGCTGCCAGGCCTCCTTCCGCTACAAGGGCAACCTCGCCAGCCACAAGACCG  1699
            |||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1629  TGACAAACCATACAAATGTGATCGCTGCCAGGCCTCCTTCCGCTACAAGGGCAACCTCGCCAGCCACAAGACTG  1702

Query 1700  TCCATACCGGTGAGAAACCCTATCGTTGCAACATCTGTGGGGCCCAGTTCAACCGGCCAGCCAACCTGAAAACC  1773
            ||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703  TCCACACGGGTGAGAAACCCTATCGCTGTAACATTTGTGGAGCGCAGTTCAATCGGCCAGCCAACCTGAAGACC  1776

Query 1774  CACACTCGAATTCACTCTGGAGAGAAGCCCTACAAATGCGAAACCTGCGGAGCCAGATTTGTACAGGTGGCCCA  1847
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1777  CACACTCGAATTCACTCTGGAGAAAAGCCCTACAAATGTGAAACCTGTGGGGCCAGGTTTGTTCAGGTGGCCCA  1850

Query 1848  CCTCCGTGCCCATGTGCTTATCCACACTGGTGAGAAGCCCTATCCCTGTGAAATCTGTGGCACCCGTTTCCGGC  1921
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1851  CCTCCGTGCCCACGTGCTCATCCACACTGGAGAGAAGCCGTACCCCTGTGAAATCTGTGGCACTCGCTTCCGGC  1924

Query 1922  ACCTTCAGACTCTGAAGAGCCACCTGCGAATCCACACAGGAGAGAAACCTTACCATTGTGAGAAGTGTAACCTG  1995
            ||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACCTTCAGACTCTGAAGAGCCATCTGCGCATCCACACAGGAGAGAAACCTTACCATTGTGAGAAGTGTAACCTG  1998

Query 1996  CATTTCCGTCACAAAAGCCAGCTGCGACTTCACTTGCGCCAGAAGCATGGCGCCATCACCAACACCAAGGTGCA  2069
            ||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CACTTTCGTCACAAAAGCCAACTGCGACTTCATTTGCGCCAGAAGCACGGCGCCATCACCAACACCAAGGTGCA  2072

Query 2070  ATACCGCGTGTCAGCCACTGACCTGCCTCCGGAGCTCCCCAAAGCCTGC  2118
            ||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATACCGCGTGTCGGCCGCTGACCTGCCTCCGGAGCTCCCCAAAGCCTGC  2121