Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_14549
Subject:
NM_004329.2
Aligned Length:
1596
Identities:
1596
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGCCTCAGCTATACATTTACATCAGATTATTGGGAGCCTATTTGTTCATCATTTCTCGTGTTCAAGGACAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTCAGCTATACATTTACATCAGATTATTGGGAGCCTATTTGTTCATCATTTCTCGTGTTCAAGGACAGAA  74

Query   75  TCTGGATAGTATGCTTCATGGCACTGGGATGAAATCAGACTCCGACCAGAAAAAGTCAGAAAATGGAGTAACCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTGGATAGTATGCTTCATGGCACTGGGATGAAATCAGACTCCGACCAGAAAAAGTCAGAAAATGGAGTAACCT  148

Query  149  TAGCACCAGAGGATACCTTGCCTTTTTTAAAGTGCTATTGCTCAGGGCACTGTCCAGATGATGCTATTAATAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGCACCAGAGGATACCTTGCCTTTTTTAAAGTGCTATTGCTCAGGGCACTGTCCAGATGATGCTATTAATAAC  222

Query  223  ACATGCATAACTAATGGACATTGCTTTGCCATCATAGAAGAAGATGACCAGGGAGAAACCACATTAGCTTCAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACATGCATAACTAATGGACATTGCTTTGCCATCATAGAAGAAGATGACCAGGGAGAAACCACATTAGCTTCAGG  296

Query  297  GTGTATGAAATATGAAGGATCTGATTTTCAGTGCAAAGATTCTCCAAAAGCCCAGCTACGCCGGACAATAGAAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTGTATGAAATATGAAGGATCTGATTTTCAGTGCAAAGATTCTCCAAAAGCCCAGCTACGCCGGACAATAGAAT  370

Query  371  GTTGTCGGACCAATTTATGTAACCAGTATTTGCAACCCACACTGCCCCCTGTTGTCATAGGTCCGTTTTTTGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTTGTCGGACCAATTTATGTAACCAGTATTTGCAACCCACACTGCCCCCTGTTGTCATAGGTCCGTTTTTTGAT  444

Query  445  GGCAGCATTCGATGGCTGGTTTTGCTCATTTCTATGGCTGTCTGCATAATTGCTATGATCATCTTCTCCAGCTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCAGCATTCGATGGCTGGTTTTGCTCATTTCTATGGCTGTCTGCATAATTGCTATGATCATCTTCTCCAGCTG  518

Query  519  CTTTTGTTACAAACATTATTGCAAGAGCATCTCAAGCAGACGTCGTTACAATCGTGATTTGGAACAGGATGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTTTGTTACAAACATTATTGCAAGAGCATCTCAAGCAGACGTCGTTACAATCGTGATTTGGAACAGGATGAAG  592

Query  593  CATTTATTCCAGTTGGAGAATCACTAAAAGACCTTATTGACCAGTCACAAAGTTCTGGTAGTGGGTCTGGACTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CATTTATTCCAGTTGGAGAATCACTAAAAGACCTTATTGACCAGTCACAAAGTTCTGGTAGTGGGTCTGGACTA  666

Query  667  CCTTTATTGGTTCAGCGAACTATTGCCAAACAGATTCAGATGGTCCGGCAAGTTGGTAAAGGCCGATATGGAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCTTTATTGGTTCAGCGAACTATTGCCAAACAGATTCAGATGGTCCGGCAAGTTGGTAAAGGCCGATATGGAGA  740

Query  741  AGTATGGATGGGCAAATGGCGTGGCGAAAAAGTGGCGGTGAAAGTATTCTTTACCACTGAAGAAGCCAGCTGGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTATGGATGGGCAAATGGCGTGGCGAAAAAGTGGCGGTGAAAGTATTCTTTACCACTGAAGAAGCCAGCTGGT  814

Query  815  TTCGAGAAACAGAAATCTACCAAACTGTGCTAATGCGCCATGAAAACATACTTGGTTTCATAGCGGCAGACATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCGAGAAACAGAAATCTACCAAACTGTGCTAATGCGCCATGAAAACATACTTGGTTTCATAGCGGCAGACATT  888

Query  889  AAAGGTACAGGTTCCTGGACTCAGCTCTATTTGATTACTGATTACCATGAAAATGGATCTCTCTATGACTTCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAGGTACAGGTTCCTGGACTCAGCTCTATTTGATTACTGATTACCATGAAAATGGATCTCTCTATGACTTCCT  962

Query  963  GAAATGTGCTACACTGGACACCAGAGCCCTGCTTAAATTGGCTTATTCAGCTGCCTGTGGTCTGTGCCACCTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAATGTGCTACACTGGACACCAGAGCCCTGCTTAAATTGGCTTATTCAGCTGCCTGTGGTCTGTGCCACCTGC  1036

Query 1037  ACACAGAAATTTATGGCACCCAAGGAAAGCCCGCAATTGCTCATCGAGACCTAAAGAGCAAAAACATCCTCATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACACAGAAATTTATGGCACCCAAGGAAAGCCCGCAATTGCTCATCGAGACCTAAAGAGCAAAAACATCCTCATC  1110

Query 1111  AAGAAAAATGGGAGTTGCTGCATTGCTGACCTGGGCCTTGCTGTTAAATTCAACAGTGACACAAATGAAGTTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGAAAAATGGGAGTTGCTGCATTGCTGACCTGGGCCTTGCTGTTAAATTCAACAGTGACACAAATGAAGTTGA  1184

Query 1185  TGTGCCCTTGAATACCAGGGTGGGCACCAAACGCTACATGGCTCCCGAAGTGCTGGACGAAAGCCTGAACAAAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGTGCCCTTGAATACCAGGGTGGGCACCAAACGCTACATGGCTCCCGAAGTGCTGGACGAAAGCCTGAACAAAA  1258

Query 1259  ACCACTTCCAGCCCTACATCATGGCTGACATCTACAGCTTCGGCCTAATCATTTGGGAGATGGCTCGTCGTTGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCACTTCCAGCCCTACATCATGGCTGACATCTACAGCTTCGGCCTAATCATTTGGGAGATGGCTCGTCGTTGT  1332

Query 1333  ATCACAGGAGGGATCGTGGAAGAATACCAATTGCCATATTACAACATGGTACCGAGTGATCCGTCATACGAAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCACAGGAGGGATCGTGGAAGAATACCAATTGCCATATTACAACATGGTACCGAGTGATCCGTCATACGAAGA  1406

Query 1407  TATGCGTGAGGTTGTGTGTGTCAAACGTTTGCGGCCAATTGTGTCTAATCGGTGGAACAGTGATGAATGTCTAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TATGCGTGAGGTTGTGTGTGTCAAACGTTTGCGGCCAATTGTGTCTAATCGGTGGAACAGTGATGAATGTCTAC  1480

Query 1481  GAGCAGTTTTGAAGCTAATGTCAGAATGCTGGGCCCACAATCCAGCCTCCAGACTCACAGCATTGAGAATTAAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAGCAGTTTTGAAGCTAATGTCAGAATGCTGGGCCCACAATCCAGCCTCCAGACTCACAGCATTGAGAATTAAG  1554

Query 1555  AAGACGCTTGCCAAGATGGTTGAATCCCAAGATGTAAAAATC  1596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGACGCTTGCCAAGATGGTTGAATCCCAAGATGTAAAAATC  1596