Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14554
- Subject:
- XM_006528483.3
- Aligned Length:
- 1977
- Identities:
- 1808
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGCCGCAGTGATTCTGGAGAGCATCTTTCTGAAGCGATCCCAACAGAAAAAGAAAACATCACCTCTAAACTT 74
|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1 ATGGCTGCAGTGATACTGGAGAGCATCTTTCTGAAGCGCTCCCAGCAGAAAAAGAAAACATCACCTTTAAACTT 74
Query 75 CAAGAAGCGCCTGTTTCTCTTGACCGTGCACAAACTCTCCTACTATGAGTATGACTTTGAACGTGGGAGAAGAG 148
||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAAGAAGCGCCTGTTTCTCTTGACTGTACACAAACTTTCATACTATGAATATGACTTTGAACGTGGGAGAAGAG 148
Query 149 GCAGTAAGAAGGGTTCAATAGATGTTGAGAAGATCACTTGTGTTGAAACAGTGGTTCCTGAAAAAAATCCTCCT 222
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||||||||.||.
Sbjct 149 GCAGTAAGAAAGGTTCAATAGATGTTGAGAAGATCACCTGTGTTGAAACAGTAATTCCTGAAAAAAATCCCCCA 222
Query 223 CCAGAAAGACAGATTCCGAGAAGAGGTGAAGAGTCCAGTGAAATGGAGCAAATTTCAATCATTGAAAGGTTCCC 296
||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCAGAAAGACAGATTCCGAGGAGAGGTGAGGAGTCTAGTGAAATGGAACAGATTTCAATCATTGAAAGGTTCCC 296
Query 297 TTATCCCTTCCAGGTTGTATATGATGAAGGGCCTCTCTACGTCTTCTCCCCAACTGAAGAACTAAGGAAGCGGT 370
.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct 297 GTACCCATTCCAGGTTGTATATGATGAAGGACCTCTCTATGTTTTCTCCCCAACTGAAGAGCTGAGAAAGCGCT 370
Query 371 GGATTCACCAGCTCAAAAACGTAATCCGGTACAACAGTGATCTGGTTCAGAAATATCACCCTTGCTTCTGGATC 444
|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 371 GGATTCACCAGCTCAAAAATGTAATCCGGTACAATAGTGACCTGGTACAGAAATACCATCCTTGCTTCTGGATT 444
Query 445 GATGGGCAGTATCTCTGCTGCTCTCAGACAGCCAAAAATGCTATGGGCTGCCAAATTTTGGAGAACAGGAATGG 518
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GATGGACAGTATCTCTGCTGCTCTCAGACAGCCAAGAATGCTATGGGCTGCCAAATTTTGGAGAACAGGAATGG 518
Query 519 AAGCTTAAAACCTGGGAGTTCTCACCGGAAGACAAAAAAGCCTCTTCCCCCAACGCCTGAGGAGGACCAGATCT 592
||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 519 AAGCTTAAAACCTGGGAGTTCTCATCGAAAAACGAAAAAGCCTCTTCCCCCTACCCCAGAGGAAGATCAGATCT 592
Query 593 TGAAAAAGCCACTACCGCCTGAGCCAGCAGCAGCACCAGTCTCCACAAGTGAGCTGAAAAAGGTTGTGGCCCTT 666
|||||||.||.||.||.||.||||||.|||||||||||.|||||||||..||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 593 TGAAAAAACCGCTTCCCCCGGAGCCAACAGCAGCACCAATCTCCACAACCGAGCTGAAAAAGGTCGTGGCCCTT 666
Query 667 TATGATTACATGCCAATGAATGCAAATGATCTACAGCTGCGGAAGGGTGATGAATATTTTATCTTGGAGGAAAG 740
||||||||||||||||||||.||||||||..||||..||||.|||||.||.||.|||||||||.|||||||.||
Sbjct 667 TATGATTACATGCCAATGAACGCAAATGACTTACAATTGCGAAAGGGCGAGGAGTATTTTATCCTGGAGGAGAG 740
Query 741 CAACTTACCATGGTGGAGAGCACGAGATAAAAATGGGCAGGAAGGCTACATTCCTAGTAACTATGTCACTGAAG 814
||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||||
Sbjct 741 CAACCTACCGTGGTGGCGAGCACGAGATAAAAATGGGCAGGAAGGCTACATCCCAAGTAACTATATCACTGAAG 814
Query 815 CAGAAGACTCCATAGAAATGTATGAGTGGTATTCCAAACACATGACTCGGAGTCAGGCTGAGCAACTGCTAAAG 888
|.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGAGGACTCCATAGAGATGTATGAGTGGTATTCCAAGCACATGACTCGAAGTCAAGCTGAGCAACTGCTAAAG 888
Query 889 CAAGAGGGGAAAGAAGGAGGTTTCATTGTCAGAGACTCCAGCAAAGCTGGCAAATATACAGTGTCTGTGTTTGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 889 CAAGAGGGGAAAGAAGGAGGTTTCATTGTCAGAGACTCCAGCAAAGCTGGAAAATACACCGTGTCTGTGTTTGC 962
Query 963 TAAATCCACAGGGGACCCTCAAGGGGTGATACGTCATTATGTTGTGTGTTCCACACCTCAGAGCCAGTATTACC 1036
||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 963 TAAATCTACTGGGGAGCCTCAAGGGGTGATCCGCCATTACGTTGTGTGTTCCACGCCACAGAGCCAGTATTACC 1036
Query 1037 TGGCTGAGAAGCACCTTTTCAGCACCATCCCTGAGCTCATTAACTACCATCAGCACAACTCTGCAGGACTCATA 1110
||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037 TGGCTGAGAAACACCTCTTCAGCACCATCCCTGAGCTCATTAACTACCATCAACACAACTCTGCAGGCCTCATA 1110
Query 1111 TCCAGGCTCAAATATCCAGTGTCTCAACAAAACAAGAATGCACCTTCCACTGCAGGCCTGGGATACGGATCATG 1184
||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1111 TCCAGGCTGAAATATCCTGTGTCTAAACAAAACAAAAACGCGCCTTCTACTGCAGGCCTGGGCTATGGATCATG 1184
Query 1185 GGAAATTGATCCAAAGGACCTGACCTTCTTGAAGGAGCTGGGGACTGGACAATTTGGGGTAGTGAAGTATGGGA 1258
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1185 GGAAATTGATCCAAAGGACCTCACCTTCTTGAAGGAGCTTGGGACTGGACAATTCGGTGTCGTGAAATATGGGA 1258
Query 1259 AATGGAGAGGCCAGTACGACGTGGCCATCAAGATGATCAAAGAAGGCTCCATGTCTGAAGATGAATTCATTGAA 1332
|.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||.||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1259 AGTGGAGGGGCCAATATGATGTGGCCATCAAGATGATCAGAGAAGGTTCCATGTCGGAGGATGAATTCATTGAA 1332
Query 1333 GAAGCCAAAGTCATGATGAATCTTTCCCATGAGAAGCTGGTGCAGTTGTATGGCGTCTGCACCAAGCAGCGCCC 1406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1333 GAAGCCAAAGTCATGATGAATCTTTCCCATGAGAAGCTGGTGCAGTTGTATGGCGTCTGCACCAAACAACGCCC 1406
Query 1407 CATCTTCATCATCACTGAGTACATGGCCAATGGCTGCCTCCTGAACTACCTGAGGGAGATGCGCCACCGCTTCC 1480
|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1407 CATCTTCATCATCACCGAGTACATGGCTAATGGCTGCCTCTTGAACTACCTGAGGGAGATGCGGCACCGCTTCC 1480
Query 1481 AGACTCAGCAGCTGCTAGAGATGTGCAAGGATGTCTGTGAAGCCATGGAATACCTGGAGTCAAAGCAGTTCCTT 1554
||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 1481 AGACACAGCAGCTGCTTGAGATGTGCAAAGATGTCTGTGAAGCAATGGAATACTTGGAGTCGAAGCAGTTCCTT 1554
Query 1555 CACCGAGACCTGGCAGCTCGAAACTGTTTGGTAAACGATCAAGGAGTTGTTAAAGTATCTGATTTCGGCCTGTC 1628
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1555 CACAGAGACCTGGCAGCTCGAAACTGTTTGGTAAACGATCAAGGAGTTGTGAAAGTATCTGACTTTGGCCTGTC 1628
Query 1629 CAGGTATGTCCTGGATGATGAATACACAAGCTCAGTAGGCTCCAAATTTCCAGTCCGGTGGTCCCCACCGGAAG 1702
.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1629 TAGGTATGTCCTTGATGATGAGTACACCAGCTCTGTAGGCTCCAAGTTTCCAGTCCGGTGGTCTCCACCAGAAG 1702
Query 1703 TCCTGATGTATAGCAAGTTCAGCAGCAAATCTGACATTTGGGCTTTTGGGGTTTTGATGTGGGAAATTTACTCC 1776
|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 1703 TGCTTATGTATAGCAAGTTCAGCAGCAAATCTGACATCTGGGCTTTTGGGGTTTTAATGTGGGAGATCTACTCC 1776
Query 1777 CTGGGGAAGATGCCATATGAGAGATTTACTAACAGTGAGACTGCTGAACACATTGCCCAAGGCCTACGTCTCTA 1850
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||||||||
Sbjct 1777 CTGGGGAAGATGCCGTATGAGAGATTTACTAACAGTGAGACAGCAGAACACATTGCTCAAGGCTTACGTCTCTA 1850
Query 1851 CAGGCCTCATCTGGCTTCAGAGAAGGTATATACCATCATGTACAGTTGTTGGCATGAGAAAGCAGATGAGCGTC 1924
|||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1851 CAGGCCTCATCTGGCATCAGAGAGGGTATATACCATCATGTACAGCTGCTGGCACGAGAAAGCAGATGAACGTC 1924
Query 1925 CCACTTTCAAAATTCTTCTGAGCAATATTCTAGATGTCATGGATGAAGAATCC 1977
|.|.||||||||||||..||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1925 CTAGTTTCAAAATTCTCTTGAGTAACATTCTAGATGTGATGGATGAAGAATCC 1977