Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14584
• Subject: NM_021273.4
• Aligned Length: 1146
• Identities: 1037
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGCCCTTCTCCAACAGCCACA--ACGCACTGAAGCTGCGCTTCCCGGCCGAGGACGAGTTCCCCGACCTGAGC  72
            ||||||||||||||||||||.|  |||||  ||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct    1  ATGCCCTTCTCCAACAGCCATAATACGCA--GAAGCTGCGCTTCCCGGCCGAGGATGAGTTCCCTGATCTGAGC  72

Query   73  GCCCACAACAACCACATGGCCAAGGTGCTGACCCCCGAGCTGTACGCGGAGCTGCGCGCCAAGAGCACGCCGAG  146
            ..||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||.||||||||||
Sbjct   73  AGCCACAACAACCATATGGCCAAGGTGCTGACCCCGGAGCTGTACGCCGAGCTCCGTGCCAAGTGCACGCCGAG  146

Query  147  CGGCTTCACGCTGGACGACGTCATCCAGACAGGCGTGGACAACCCGGGCCACCCGTACATCATGACCGTGGGCT  220
            ||||||.||..|||||||||.|||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||| |
Sbjct  147  CGGCTTTACTTTGGACGACGCCATTCAGACTGGCGTAGACAATCCGGGCCACCCGTACATCATGACTGTGGG-T  219

Query  221  GC-GTGGCGGGCGACGAGGAGTCCTACGAAGTGTTCAAGGATCTCTTCGACCCCATCATCGAGGACCGGCACGG  293
            || ||||||||||||||||||...|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  220  GCAGTGGCGGGCGACGAGGAGAGTTACGACGTATTCAAGGACCTCTTCGACCCCATTATTGAGGAGCGGCACGG  293

Query  294  CGGCTACAAGCCCAGCGATGAGCACAAGACCGACCTCAACCCCGACAACCTGCAGGGCGGCGACGACCTGGACC  367
            |||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  294  CGGCTACCAGCCCAGTGATGAGCACAAGACCGACCTCAACCCAGACAACCTGCAGGGTGGCGATGACCTGGACC  367

Query  368  CCAACTACGTGCTGAGCTCGCGGGTGCGCACGGGCCGCAGCATCCGTGGCTTCTGCCTCCCCCCGCACTGCAGC  441
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  368  CCAACTACGTGCTGAGCTCGCGAGTGCGCACAGGCCGCAGCATCCGCGGCTTCTGTCTCCCCCCGCACTGCAGC  441

Query  442  CGCGGGGAGCGCCGAGCCATCGAGAAGCTCGCGGTGGAAGCCCTGTCCAGCCTGGACGGCGACCTGGCGGGCCG  515
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||.|.|||.|
Sbjct  442  CGCGGGGAGCGCCGCGCCATCGAGAAGCTGGCAGTAGAAGCTCTGTCCAGCCTAGATGGCGACCTGTCTGGCAG  515

Query  516  ATACTACGCGCTCAAGAGCATGACGGAGGCGGAGCAGCAGCAGCTCATCGACGACCACTTCCTCTTCGACAAGC  589
            .|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  516  GTACTACGCGCTCAAGAGCATGACTGAGGCGGAGCAGCAGCAGCTCATTGACGACCACTTCCTCTTCGATAAGC  589

Query  590  CCGTGTCGCCCCTGCTGCTGGCCTCGGGCATGGCCCGCGACTGGCCCGACGCCCGCGGTATCTGGCACAATGAC  663
            |.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct  590  CTGTGTCGCCTCTGCTGCTGGCCTCCGGCATGGCCCGGGACTGGCCGGATGCTCGTGGCATATGGCACAATGAC  663

Query  664  AATAAGACCTTCCTGGTGTGGGTCAACGAGGAGGACCACCTGCGGGTCATCTCCATGCAGAAGGGGGGCAACAT  737
            ||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  AATAAGACTTTCCTGGTGTGGATTAACGAGGAGGACCACCTGCGAGTCATCTCCATGCAGAAGGGGGGCAACAT  737

Query  738  GAAGGAGGTGTTCACCCGCTTCTGCACCGGCCTCACCCAGATTGAAACTCTCTTCAAGTCTAAGGACTATGAGT  811
            ||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct  738  GAAGGAAGTGTTCACCCGATTCTGCACCGGCCTCACTCAGATCGAAACTCTCTTCAAGTCCAAGAACTATGAGT  811

Query  812  TCATGTGGAACCCTCACCTGGGCTACATCCTCACCTGCCCATCCAACCTGGGCACCGGGCTGCGGGCAGGTGTG  885
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  812  TCATGTGGAATCCTCACCTGGGCTACATCCTCACATGCCCATCCAACCTGGGCACCGGACTGCGGGCAGGTGTG  885

Query  886  CATATCAAGCTGCCCAACCTGGGCAAGCATGAGAAGTTCTCGGAGGTGCTTAAGCGGCTGCGACTTCAGAAGCG  959
            ||.||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  886  CACATCAAGCTGCCCCACCTGGGGAAGCACGAGAAGTTCTCGGAGGTGCTCAAGCGGCTGCGGCTTCAGAAGCG  959

Query  960  AGGCACAGGCGGTGTGGACACGGCTGCGGTGGGCGGGGTCTTCGACGTCTCCAACGCTGACCGCCTGGGCTTCT  1033
            |||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  AGGCACAGGTGGCGTGGACACCGCTGCTGTCGGTGGGGTGTTTGATGTCTCCAACGCTGACCGCCTGGGCTTCT  1033

Query 1034  CAGAGGTGGAGCTGGTGCAGATGGTGGTGGACGGAGTGAAGCTGCTCATCGAGATGGAACAGCGGCTGGAGCAG  1107
            |.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1034  CGGAGGTGGAACTGGTGCAGATGGTGGTGGACGGAGTGAAACTACTCATTGAGATGGAGCAACGGCTGGAGCAG  1107

Query 1108  GGCCAGGCCATCGACGACCTCATGCCTGCCCAGAAA  1143
            ||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1108  GGTCAGGCAATCGATGACCTCATGCCGGCCCAGAAG  1143