Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14625
• Subject: XM_006715880.3
• Aligned Length: 2928
• Identities: 2582
• Gaps: 345

Alignment

Query    1  ATGGAGCGGCGCTGGCCCCTGGGGCTAGGGCTGGTGCTGCTGCTCTGCGCCCCGCTGCCCCCGGGGGCGCGCGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCGGCGCTGGCCCCTGGGGCTAGGGCTGGTGCTGCTGCTCTGCGCCCCGCTGCCCCCGGGGGCGCGCGC  74

Query   75  CAAGGAAGTTACTCTGATGGACACAAGCAAGGCACAGGGAGAGCTGGGCTGGCTGCTGGATCCCCCAAAAGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAGGAAGTTACTCTGATGGACACAAGCAAGGCACAGGGAGAGCTGGGCTGGCTGCTGGATCCCCCAAAAGATG  148

Query  149  GGTGGAGTGAACAGCAACAGATACTGAATGGGACACCCCTGTACATGTACCAGGACTGCCCAATGCAAGGACGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGTGGAGTGAACAGCAACAGATACTGAATGGGACACCCCTGTACATGTACCAGGACTGCCCAATGCAAGGACGC  222

Query  223  AGAGACACTGACCACTGGCTTCGCTCCAATTGGATCTACCGCGGGGAGGAGGCTTCCCGCGTCCACGTGGAGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAGACACTGACCACTGGCTTCGCTCCAATTGGATCTACCGCGGGGAGGAGGCTTCCCGCGTCCACGTGGAGCT  296

Query  297  GCAGTTCACCGTGCGGGACTGCAAGAGTTTCCCTGGGGGAGCCGGGCCTCTGGGCTGCAAGGAGACCTTCAACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGTTCACCGTGCGGGACTGCAAGAGTTTCCCTGGGGGAGCCGGGCCTCTGGGCTGCAAGGAGACCTTCAACC  370

Query  371  TTCTGTACATGGAGAGTGACCAGGATGTGGGCATTCAGCTCCGACGGCCCTTGTTCCAGAAGGTAACCACGGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTGTACATGGAGAGTGACCAGGATGTGGGCATTCAGCTCCGACGGCCCTTGTTCCAGAAGGTAACCACGGTG  444

Query  445  GCTGCAGACCAGAGCTTCACCATTCGAGACCTTGCGTCTGGCTCCGTGAAGCTGAATGTGGAGCGCTGCTCTCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTGCAGACCAGAGCTTCACCATTCGAGACCTTGTGTCTGGCTCCGTGAAGCTGAATGTGGAGCGCTGCTCTCT  518

Query  519  GGGCCGCCTGACCCGCCGTGGCCTCTACCTCGCTTTCCACAACCCGGGTGCCTGTGTGGCCCTGGTGTCTGTCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGCCGCCTGACCCGCCGTGGCCTCTACCTCGCTTTCCACAACCCGGGTGCCTGTGTGGCCCTGGTGTCTGTCC  592

Query  593  GGGTCTTCTACCAGCGCTGTCCTGAGACCCTGAATGGCTTGGCCCAATTCCCAGACACTCTGCCTGGCCCCGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGTCTTCTACCAGCGCTGTCCTGAGACCCTGAATGGCTTGGCCCAATTCCCAGACACTCTGCCTGGCCCCGCT  666

Query  667  GGGTTGGTGGAAGTGGCGGGGACCTGCTTGCCCCACGCGCGGGCCAGCCCCAGGCCCTCAGGTGCACCCCGCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGTTGGTGGAAGTGGCGGGGACCTGCTTGCCCCACGCGCGGGCCAGCCCCAGGCCCTCAGGTGCACCCCGCAT  740

Query  741  GCACTGCAGCCCTGATGGCGAGTGGCTGGTGCCTGTAGGACGGTGCCACTGTGAGCCTGGCTATGAGGAAGGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCACTGCAGCCCTGATGGCGAGTGGCTGGTGCCTGTAGGACGGTGCCACTGTGAGCCTGGCTATGAGGAAGGTG  814

Query  815  GCAGTGGCGAAGCATGTGTTGCCTGCCCTAGCGGCTCCTACCGGATGGACATGGACACACCCCATTGTCTCACG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGTGGCGAAGCATGTGTTGCCTGCCCTAGCGGCTCCTACCGGATGGACATGGACACACCCCATTGTCTCACG  888

Query  889  TGCCCCCAGCAGAGCACTGCTGAGTCTGAGGGGGCCACCATCTGTACCTGTGAGAGCGGCCATTACAGAGCTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCCCCCAGCAGAGCACTGCTGAGTCTGAGGGGGCCACCATCTGTACCTGTGAGAGCGGCCATTACAGAGCTCC  962

Query  963  CGGGGAGGGCCCCCAGGTGGCATGCACAGGTCCCCCCTCGGCCCCCCGAAACCTGAGCTTCTCTGCCTCAGGGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct  963  CGGGGAGGGCCCCCAGGTGGCATGCA------------------------------------------------  988

Query 1037  CTCAGCTCTCCCTGCGTTGGGAACCCCCAGCAGATACGGGGGGACGCCAGGATGTCAGATACAGTGTGAGGTGT  1110
                                                                                      
Sbjct  989  --------------------------------------------------------------------------  988

Query 1111  TCCCAGTGTCAGGGCACAGCACAGGACGGGGGGCCCTGCCAGCCCTGTGGGGTGGGCGTGCACTTCTCGCCGGG  1184
                                                                                      
Sbjct  989  --------------------------------------------------------------------------  988

Query 1185  GGCCCGGGGGCTCACCACACCTGCAGTGCATGTCAATGGCCTTGAACCTTATGCCAACTACACCTTTAATGTGG  1258
                                                                                      
Sbjct  989  --------------------------------------------------------------------------  988

Query 1259  AAGCCCAAAATGGAGTGTCAGGGCTGGGCAGCTCTGGCCATGCCAGCACCTCAGTCAGCATCAGCATGGGGCAT  1332
                                                                                      
Sbjct  989  --------------------------------------------------------------------------  988

Query 1333  GCAGAGTCACTGTCAGGCCTGTCTCTGAGACTGGTGAAGAAAGAACCGAGGCAACTAGAGCTGACCTGGGCGGG  1406
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  989  -CAGAGTCACTGTCAGGCCTGTCTCTGAGACTGGTGAAGAAAGAACCGAGGCAACTAGAGCTGACCTGGGCGGG  1061

Query 1407  GTCCCGGCCCCGAAGCCCTGGGGCGAACCTGACCTATGAGCTGCACGTGCTGAACCAGGATGAAGAACGGTACC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062  GTCCCGGCCCCGAAGCCCTGGGGCGAACCTGACCTATGAGCTGCACGTGCTGAACCAGGATGAAGAACGGTACC  1135

Query 1481  AGATGGTTCTAGAACCCAGGGTCTTGCTGACAGAGCTGCAGCCTGACACCACATACATCGTCAGAGTCCGAATG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136  AGATGGTTCTAGAACCCAGGGTCTTGCTGACAGAGCTGCAGCCTGACACCACATACATCGTCAGAGTCCGAATG  1209

Query 1555  CTGACCCCACTGGGTCCTGGCCCTTTCTCCCCTGATCATGAGTTTCGGACCAGCCCACCAGTGTCCAGGGGCCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210  CTGACCCCACTGGGTCCTGGCCCTTTCTCCCCTGATCATGAGTTTCGGACCAGCCCACCAGTGTCCAGGGGCCT  1283

Query 1629  GACTGGAGGAGAGATTGTAGCCGTCATCTTTGGGCTGCTGCTTGGTGCAGCCTTGCTGCTTGGGATTCTCGTTT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284  GACTGGAGGAGAGATTGTAGCCGTCATCTTTGGGCTGCTGCTTGGTGCAGCCTTGCTGCTTGGGATTCTCGTTT  1357

Query 1703  TCCGGTCCAGGAGAGCCCAGCGGCAGAGGCAGCAGAGGCAGCGTGACCGCGCCACCGATGTGGATCGAGAGGAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358  TCCGGTCCAGGAGAGCCCAGCGGCAGAGGCAGCAGAGGCAGCGTGACCGCGCCACCGATGTGGATCGAGAGGAC  1431

Query 1777  AAGCTGTGGCTGAAGCCTTATGTGGACCTCCAGGCATACGAGGACCCTGCACAGGGAGCCCTGGACTTTACCCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1432  AAGCTGTGGCTGAAGCCTTATGTGGACCTCCAGGCATACGAGGACCCTGCACAGGGAGCCCTGGACTTTACCCG  1505

Query 1851  GGAGCTTGATCCAGCGTGGCTGATGGTGGACACTGTCATAGGAGAAGGAGAGTTTGGGGAAGTGTATCGAGGGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506  GGAGCTTGATCCAGCGTGGCTGATGGTGGACACTGTCATAGGAGAAGGAGAGTTTGGGGAAGTGTATCGAGGGA  1579

Query 1925  CCCTGAGGCTCCCCAGCCAGGACTGCAAGACTGTGGCCATTAAGACCTTAAAAGACACATCCCCAGGTGGCCAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1580  CCCTGAGGCTCCCCAGCCAGGACTGCAAGACTGTGGCCATTAAGACCTTAAAAGACACATCCCCAGGTGGCCAG  1653

Query 1999  TGGTGGAACTTCCTTCGAGAGGCAACTATCATGGGCCAGTTTAGCCACCCGCATATTCTGCATCTGGAAGGCGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1654  TGGTGGAACTTCCTTCGAGAGGCAACTATCATGGGCCAGTTTAGCCACCCGCATATTCTGCATCTGGAAGGCGT  1727

Query 2073  CGTCACAAAGCGAAAGCCGATCATGATCATCACAGAATTTATGGAGAATGGAGCCCTGGATGCCTTCCTGAGGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1728  CGTCACAAAGCGAAAGCCGATCATGATCATCACAGAATTTATGGAGAATGGAGCCCTGGATGCCTTCCTGAGGG  1801

Query 2147  AGCGGGAGGACCAGCTGGTCCCTGGGCAGCTAGTGGCCATGCTGCAGGGCATAGCATCTGGCATGAACTACCTC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1802  AGCGGGAGGACCAGCTGGTCCCTGGGCAGCTAGTGGCCATGCTGCAGGGCATAGCATCTGGCATGAACTACCTC  1875

Query 2221  AGTAATCACAATTATGTCCACCGGGACCTGGCTGCCAGAAACATCTTGGTGAATCAAAACCTGTGCTGCAAGGT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1876  AGTAATCACAATTATGTCCACCGGGACCTGGCTGCCAGAAACATCTTGGTGAATCAAAACCTGTGCTGCAAGGT  1949

Query 2295  GTCTGACTTTGGCCTGACTCGCCTCCTGGATGACTTTGATGGCACATACGAAACCCAGGGAGGAAAGATCCCTA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1950  GTCTGACTTTGGCCTGACTCGCCTCCTGGATGACTTTGATGGCACATACGAAACCCAGGGAGGAAAGATCCCTA  2023

Query 2369  TCCGTTGGACAGCCCCTGAAGCCATTGCCCATCGGATCTTCACCACAGCCAGCGATGTGTGGAGCTTTGGGATT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2024  TCCGTTGGACAGCCCCTGAAGCCATTGCCCATCGGATCTTCACCACAGCCAGCGATGTGTGGAGCTTTGGGATT  2097

Query 2443  GTGATGTGGGAGGTGCTGAGCTTTGGGGACAAGCCTTATGGGGAGATGAGCAATCAGGAGGTTATGAAGAGCAT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2098  GTGATGTGGGAGGTGCTGAGCTTTGGGGACAAGCCTTATGGGGAGATGAGCAATCAGGAGGTTATGAAGAGCAT  2171

Query 2517  TGAGGATGGGTACCGGTTGCCCCCTCCTGTGGACTGCCCTGCCCCTCTGTATGAGCTCATGAAGAACTGCTGGG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2172  TGAGGATGGGTACCGGTTGCCCCCTCCTGTGGACTGCCCTGCCCCTCTGTATGAGCTCATGAAGAACTGCTGGG  2245

Query 2591  CATATGACCGTGCCCGCCGGCCACACTTCCAGAAGCTTCAGGCACATCTGGAGCAACTGCTTGCCAACCCCCAC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2246  CATATGACCGTGCCCGCCGGCCACACTTCCAGAAGCTTCAGGCACATCTGGAGCAACTGCTTGCCAACCCCCAC  2319

Query 2665  TCCCTGCGGACCATTGCCAACTTTGACCCCAGGATGACTCTTCGCCTGCCCAGCCTGAGTGGCTCAGATGGGAT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2320  TCCCTGCGGACCATTGCCAACTTTGACCCCAGGATGACTCTTCGCCTGCCCAGCCTGAGTGGCTCAGATGGGAT  2393

Query 2739  CCCATATCGAACCGTCTCTGAGTGGCTCGAGTCCATACGCATGAAACGCTACATCCTGCACTTCCACTCGGCTG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2394  CCCATATCGAACCGTCTCTGAGTGGCTCGAGTCCATACGCATGAAACGCTACATCCTGCACTTCCACTCGGCTG  2467

Query 2813  GGCTGGACACCATGGAGTGTGTGCTGGAGCTGACCGCTGAGGACCTGACGCAGATGGGAATCACACTGCCCGGG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2468  GGCTGGACACCATGGAGTGTGTGCTGGAGCTGACCGCTGAGGACCTGACGCAGATGGGAATCACACTGCCCGGG  2541

Query 2887  CACCAGAAGCGCATTCTTTGCAGTATTCAGGGATTCAAGGAC  2928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2542  CACCAGAAGCGCATTCTTTGCAGTATTCAGGGATTCAAGGAC  2583