Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14630
- Subject:
- NM_001146351.1
- Aligned Length:
- 3075
- Identities:
- 2658
- Gaps:
- 45
Alignment
Query 1 ATGGCTACTGAAGG---GGCTGCCCAGTTAGGGAACAGA---GTGGCGGGCATGGTGTGTAGCCTATGGGTGCT 68
|||||||||||.|| |.|||.| |.|||||.|||| |||||||||||||||||.||.||.|||.|.||
Sbjct 1 ATGGCTACTGAGGGCACGACTGGC---TCAGGGAGCAGAGTGGTGGCGGGCATGGTGTGCAGTCTGTGGCTCCT 71
Query 69 GCTCCTGGTGTCTTCAGTTCTGGCTCTGGAAGAGGTATTGCTGGACACCACCGGAGAGACATCTGAGATTGGCT 142
|.|.||.|.|||.||||||||.||||||||||||||..|||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 72 GGTTCTAGGGTCATCAGTTCTAGCTCTGGAAGAGGTGCTGCTGGATACCACAGGAGAGACCTCTGAGATTGGCT 145
Query 143 GGCTCACCTACCCACCAGGGGGGTGGGACGAGGTGAGTGTTCTGGACGACCAGCGACGCCTGACTCGGACCTTT 216
|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 146 GGCTCACCTACCCGCCAGGTGGGTGGGATGAGGTGAGTGTTCTAGATGACCAGCGCCGTCTGACTCGGACCTTC 219
Query 217 GAGGCATGTCATGTGGCAGGGGCCCCTCCAGGCACCGGGCAGGACAATTGGTTGCAGACACACTTTGTGGAGCG 290
||.|||||.||.||.||||||..||||||.||..|.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct 220 GAAGCATGCCACGTTGCAGGGCTCCCTCCTGGTTCTGGCCAGGACAATTGGCTGCAGACACACTTTGTGGAACG 293
Query 291 GCGCGGGGCCCAGAGGGCGCACATTCGACTCCACTTCTCTGTGCGGGCATGCTCCAGCCTGGGTGTGAGCGGCG 364
|||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 294 GCGAGGGGCCCAGAGGGCACACATCCGCCTTCACTTCTCTGTACGAGCCTGTTCCAGCCTGGGTGTGAGTGGGG 367
Query 365 GCACCTGCCGGGAGACCTTCACCCTTTACTACCGTCAGGCTGAGGAGCCCGACAGCCCTGACAGCGTTTCCTCC 438
|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||.||||.|||||..||.|..||
Sbjct 368 GTACCTGCCGAGAGACCTTCACCCTTTACTACCGGCAGGCTGATGAGCCAGACGGCCCCGACAGTATTGCGGCC 441
Query 439 TGGCACCTCAAACGCTGGACCAAGGTGGACACAATTGCAGCAGACGAGAGCTTTCCCT-CCTCCTCCTCCTCCT 511
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||| |||||| |||||||.|||||.|
Sbjct 442 TGGCACCTCAAACGCTGGACCAAAGTGGACACAATTGCCGCAGATGAGAGC-TTCCCTGCCTCCTCTTCCTCTT 514
Query 512 CCTCCTCTTCTTCCTCTGCAGCGTGGGCTGTGGGACCCCACGGGGCTGGGCAGCGGGCTGGACTGCAACTGAAC 585
||| |.||||||||||||||||||.||.|.||.|||||||..||||||||.|||||.
Sbjct 515 CCT------------------CATGGGCTGTGGGACCCCACAGGACCGGTCAGCGGGTGGGACTGCAGCTGAAT 570
Query 586 GTCAAAGAGCGGAGCTTTGGGCCTCTCACCCAACGCGGCTTCTACGTGGCCTTCCAGGACACGGGGGCCTGCCT 659
|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 571 GTCAAAGAGCGCAGCTTTGGTCCTCTCACTCAGCGTGGCTTCTATGTGGCCTTCCAGGACACAGGGGCCTGCCT 644
Query 660 GGCCCTGGTCGCTGTCAGGCTCTTCTCCTACACCTG-CCCTGCCGTGCTCCGATCCTTTGCTTCCTTTCCAGAG 732
||||||.||.||.||||.|||||||||||||||||| |||| ||||.||.||..|||||||.||.|||||.|||
Sbjct 645 GGCCCTTGTGGCAGTCAAGCTCTTCTCCTACACCTGTCCCT-CCGTCCTGCGTGCCTTTGCCTCTTTTCCTGAG 717
Query 733 ACGCAGGCCAGTGGGGCTGGGGGGGCCTCCCTGGTGGCAGCTGTGGGCACCTGTGTGGCTCATGCAGAGCCAGA 806
||.|||||||||||.|||||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 718 ACACAGGCCAGTGGAGCTGGAGGGGCTTCCTTAGTGGCAGCTGTGGGCACCTGTGTAGCTCATGCAGAACCAGA 791
Query 807 GGAGGATGGAGTAGGGGGCCAGGCAGGAGGCAGCCCCCCCAGGCTGCACTGCAACGGGGAGGGCAAGTGGATGG 880
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.||.||.||||.||||||||
Sbjct 792 GGAGGATGGAGTAGGAGGCCAGGCAGGGGGCAGCCCCCCAAGGTTACACTGTAATGGCGAAGGCAGGTGGATGG 865
Query 881 TAGCTGTCGGGGGCTGCCGCTGCCAGCCTGGATACCAACCAGCACGAGGAGACAAGGCCTGCCAAGCCTGCCCA 954
|||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||..|||||||||||||||
Sbjct 866 TAGCTGTGGGAGGCTGCCGCTGCCAGCCTGGACACCAGCCTGCTCGTGGAGACAAGCTCTGCCAAGCCTGCCC- 938
Query 955 CGGGGGCT-CTATAAGTCTTCT-GCTGGGAATGCTCCCTGCTCACCATGCCCTGCCCGCAGTCACGCTCCCAAC 1026
.|.|||.| |||||||.| .|| ||||||||||.||||||.|||||.||.||.||||||||.|||.|.||..||
Sbjct 939 TGAGGGATCCTATAAGGC-CCTGGCTGGGAATGTTCCCTGTTCACCGTGTCCAGCCCGCAGCCACTCCCCTGAC 1011
Query 1027 CCAGCAGCCCCCGTTTGCCCCTGCCTGGAGGGCTTCTACCGGGCCAGTTCCGACCCACCAGAGGCCCCCTGCAC 1100
||.||||||||.||||||||.||.||..|.|||||||||.||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1012 CCTGCAGCCCCAGTTTGCCCATGTCTCCAAGGCTTCTACAGGGCCAGTTCGGACCCACCAGAGGCTCCCTGCAC 1085
Query 1101 TGGTCCTCCATCGGCTCCCCAGGAGCTTTGGTTTGAGGTGCAAGGCTCAGCACTCATGCTACACTGGCGCCTGC 1174
||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1086 TGGTCCTCCATCGGCTCCCCGGGAGCTATGGTTTGAGGTGCAAGGCTCGGCACTCATGCTGCACTGGCGTCTGC 1159
Query 1175 CTCGGGAGCTGGGGGGTCGAGGGGACCTGCTCTTCAATGTCGTGTGCAAGGAGTGTGAAGGCCGCCAGGA-ACC 1247
|||.|||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.|.| ||| |.|
Sbjct 1160 CTCAGGAGCTGGGTGGACGAGGGGATCTGCTCTTCAATGTTGTGTGCAAGGAGTGTGGAGGTCAC--GGAGAGC 1231
Query 1248 TGCCAGCGGTGGTGGGGGCACTTGTCACCGCTGCAGGGATGAGGTCCACTTCGACCCTCGCCAGAGAGGCCTGA 1321
||||| .|||||||.|..||||.||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1232 --CCAGC---AGTGGGGGGATGTGTCGCCGCTGCAGGGACGAGGTGCATTTCGACCCCCGCCAGAGGGGACTGA 1300
Query 1322 CTGAGAGCCGAGTGTTAGTGGGGGGACTCCGGGCACACGTACCCTACATCTTAGAGGTGCAGGCTGTTAATGGG 1395
|||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1301 CTGAGAGTCGAGTGTTAGTTGGGGGGCTCCGAGCACACGTGCCATACATCTTGGAAGTGCAGGCTGTCAATGGG 1374
Query 1396 GTGTCTGAGCTCAGCCCTGACCCTCCTCAGGCTGCAGCCATCAATGTCAGCACCAGCCATGAAGTGCCCTCTGC 1469
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1375 GTGTCTGAGCTCAGCCCTGACCCTCCCCAGGCAGCAGCCATCAATGTCAGCACCAGCCACGAAGTCCCTTCTGC 1448
Query 1470 TGTCCCTGTGGTGCACCAGGTGAGCCGGGCATCCAACAGCATCACGGTGTCCTGGCCGCAGCCCGACCAGACCA 1543
.|||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 1449 AGTCCCTGTGATGCACCAGGTGAGCCGGGCAGCCAACAGCATCACAGTATCCTGGCCACAGCCTGAGCAAACAA 1522
Query 1544 ATGGGAACATCCTGGACTATCAGCTCCGCTACTATGACCAGGCAGAAGACGAATCCCACTCCTTCACCCTGACC 1617
|||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1523 ATGGGAACATCCTCGACTACCAGCTGCGCTACTATGACCAGGCAGAAGATGAATCCCACTCCTTCACCATGACC 1596
Query 1618 AGCGAGACCAACACTGCCACCGTGACACAGCTGAGCCCTGGCCACATCTATGGTTTCCAGGTGCGGGCCCGGAC 1691
||.|||||||||||||||||.|||||||.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1597 AGTGAGACCAACACTGCCACTGTGACACGGTTGAGCCCTGGCCACATCTATGGCTTCCAGGTGCGGGCACGGAC 1670
Query 1692 TGCTGCCGGCCACGGCCCCTACGGGGGCAAAGTCTATTTCCAGACACTTCCTCAAGGGGAGCTGTCTTCCCAGC 1765
|||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1671 TGCAGCTGGCCACGGCCCCTATGGGGGCAAAGTCTATTTTCAGACATTGCCTCAAGGTGAGCTGTCCTCCCAGC 1744
Query 1766 TTCCGGA-AAGACTCTCCTTGGTGATCGGCTCCATCCTGGGGGCTTTGGCCTTCCTCCTGCTGGCAGCCATCAC 1838
||||.|| ||| ||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1745 TTCCAGAGAAG-CTGTCCTTGGTGATTGGTTCCATCCTGGGGGCCTTGGCCTTCCTTCTACTGGCAGCCATCAC 1817
Query 1839 CGTGCTGGCGGTCGTCTTCCAGCGGAAGCGGCGTGGGACTGGCTACACGGAGCAGCTGCAGCAATACAGCAGCC 1912
.||.|||||.|||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1818 TGTACTGGCTGTCATCTTCCAGCGGAAGCGCCGTGGGACCGGCTACACAGAACAACTGCAACAATACAGCAGCC 1891
Query 1913 CAGGACTCGGGGTGAAGTATTACATCGACCCCTCCACCTACGAGGACCCCTGTCAGGCCATCCGAGAACTTGCC 1986
|||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||.||||.|||||.
Sbjct 1892 CAGGACTTGGAGTGAAGTATTACATTGACCCTTCTACATACGATGACCCCTGCCAGGCCATCAGAGAGCTTGCT 1965
Query 1987 CGGGAAGTCGATCCTGCTTATATCAAGATTGAGGAGGTCATTGGGACAGGCTCTTTTGGAGAAGTGCGCCAGGG 2060
||.||.||.||.|||.|.||||||||||||||.||.|||||||||.||||.||.||||||||||||||.|.|||
Sbjct 1966 CGAGAGGTTGACCCTACATATATCAAGATTGAAGAAGTCATTGGGGCAGGTTCCTTTGGAGAAGTGCGTCGGGG 2039
Query 2061 CCGCCTGCAGCCACGGGGACGGAGGGAGCAGACTGTGGCCATCCAGGCCCTGTGGGCCGGGGGCGCCGAAAGCC 2134
|||.|||||.||.||||||.|||||||.||..|||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct 2040 CCGACTGCAACCCCGGGGAAGGAGGGAACAAGCTGTGGCTATCCAGGCCTTGTGGGCAGGGGGTGCTGAGAGCC 2113
Query 2135 TGCAGATGACCTTCCTGGGCCGGGCCGCAGTGCTGGGTCAGTTCCAGCACCCCAACATCCTGCGGCTGGAGGGC 2208
||.||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 2114 TGAAGATGACCTTTCTGGGTCGGGCAGCACTGCTGGGCCAGTTCCAGCACCCCAATATCCTGCGGCTGGAAGGT 2187
Query 2209 GTGGTCACCAAGAGCCGACCCCTCATGGTGCTGACGGAGTTCATGGAGCTTGGCCCCCTGGACAGCTTCCTCAG 2282
||.|||||.|||||.||.||..|||||||||||||.||..|||||||.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 2188 GTAGTCACTAAGAGTCGGCCTGTCATGGTGCTGACAGAACTCATGGAACTTGGTCCCCTGGACAGCTTTCTTAG 2261
Query 2283 GCAGCGGGAGGGCCAGTTCAGCAGCCTGCAGCTGGTGGCCATGCAGCGGGGAGTGGCTGCTGCCATGCAGTACC 2356
||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct 2262 GCAGCGAGAGGGCCAGTTCAGTAGCCTGCAGCTGGTGGCCATGCAGCGGGGTGTGGCTGCTGCCATGCAGTACT 2335
Query 2357 TGTCCAGCTTTGCCTTCGTCCATCGCTCGCTGTCTGCCCACAGCGTGCTGGTGAATAGCCACTTGGTGTGCAAG 2430
||||||||||||||||.||.||.||..|.||.||.||||..||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 2336 TGTCCAGCTTTGCCTTTGTTCACCGAGCACTCTCGGCCCGAAGTGTGCTAGTGAATAGCCACCTGGTGTGTAAG 2409
Query 2431 GTGGCCCGTCTTGGCCACAGTCCTCAGGGCCCAAGTTGTTTGCTTCGCTGGGCAGCCCCAGAGGTCATTGCACA 2504
|||||.|||||.|||||||||||||||||..||||||..||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2410 GTGGCACGTCTCGGCCACAGTCCTCAGGGTTCAAGTTCCTTGCTTCGCTGGGCAGCCCCAGAGGTCATTACACA 2483
Query 2505 TGGAAAGCATACAACATCCAGTGATGTCTGGAGCTTTGGGATACTCATGTGGGAAGTGATGAGTTATGGAGAAC 2578
|||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2484 TGGAAAGTATACAACATCTAGCGATGTCTGGAGCTTTGGCATACTCATGTGGGAAGTGATGAGCTATGGAGAAC 2557
Query 2579 GGCCTTACTGGGACATGAGTGAGCAGGAGGTACTAAATGCAATAGAGCAGGAGTTCCGGCTGCCCCCGCCTCCA 2652
||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2558 GGCCCTACTGGGACATGAACGAGCAGGAGGTACTAAATGCAATAGAGCAAGAGTTCCGGCTGCCCCCACCTCCA 2631
Query 2653 GGCTGTCCTCCTGGATTACATCTACTTATGTTGGACACTTGGCAGAAGGACCGTGCCCGGCGGCCTCATTTTGA 2726
||.||.||.||||||.||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2632 GGGTGCCCCCCTGGACTACATCTACTGATGCTAGACACTTGGCAGAAGGACCGTGCCCGTCGGCCTCATTTTGA 2705
Query 2727 CCAGCTGGTGGCTGCATTTGACAAGATGATCCGCAAGCCAGATACCCTGCAGGCTGGCGGGGACCCAGGGGAAA 2800
|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||..||||.|.|.|||||.|
Sbjct 2706 CCAGCTGGTAGCTGCATTTGACAAGATGATTCGCAAGCCTGATACTCTCCAGGCTGAAGGGGGCTCCGGGGACA 2779
Query 2801 GGCCTTCCCAGGCCCTTCTGACCCCTGTGGCCCTGGACTTTCCTTGTCTGGACTCACCCCAGGCCTGGCTTTCA 2874
|||||||||||||.|||||||.||||||||||.|||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2780 GGCCTTCCCAGGCTCTTCTGAACCCTGTGGCCTTGGACTTCCCTTGCCTGGACTCTCCCCAGGCCTGGCTTTCA 2853
Query 2875 GCCATTGGACTGGAGTGCTACCAGGACAACTTCTCCAAGTTTGGCCTCTGTACCTTCAGTGATGTGGCTCAGCT 2948
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2854 GCCATTGGACTAGAGTGCTACCAGGACAACTTCTCCAAGTTTGGTCTTTCCACCTTCAGTGATGTGGCTCAGCT 2927
Query 2949 CAGCCTAGAAGACCTGCCTGCCCTGGGCATCACCCTGGCTGGCCACCAGAAGAAGCTGCTGCACCACATCCAGC 3022
||||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||.||||.||||
Sbjct 2928 CAGCCTGGAAGACCTGCCAGGCCTGGGCATCACCCTAGCTGGCCACCAGAAGAAACTTCTGCACAACATTCAGC 3001
Query 3023 TCCTTCAGCAACACCTGAGGCAGCAGGGCTCAGTGGAGGTC 3063
||||.|||||.|||||||||||||..|||||||||||.||.
Sbjct 3002 TCCTCCAGCAGCACCTGAGGCAGCCAGGCTCAGTGGAAGTG 3042