Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14630
• Subject: NM_007680.4
• Aligned Length: 3075
• Identities: 2658
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGGCTACTGAAGG---GGCTGCCCAGTTAGGGAACAGA---GTGGCGGGCATGGTGTGTAGCCTATGGGTGCT  68
            |||||||||||.||   |.|||.|   |.|||||.||||   |||||||||||||||||.||.||.|||.|.||
Sbjct    1  ATGGCTACTGAGGGCACGACTGGC---TCAGGGAGCAGAGTGGTGGCGGGCATGGTGTGCAGTCTGTGGCTCCT  71

Query   69  GCTCCTGGTGTCTTCAGTTCTGGCTCTGGAAGAGGTATTGCTGGACACCACCGGAGAGACATCTGAGATTGGCT  142
            |.|.||.|.|||.||||||||.||||||||||||||..|||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct   72  GGTTCTAGGGTCATCAGTTCTAGCTCTGGAAGAGGTGCTGCTGGATACCACAGGAGAGACCTCTGAGATTGGCT  145

Query  143  GGCTCACCTACCCACCAGGGGGGTGGGACGAGGTGAGTGTTCTGGACGACCAGCGACGCCTGACTCGGACCTTT  216
            |||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct  146  GGCTCACCTACCCGCCAGGTGGGTGGGATGAGGTGAGTGTTCTAGATGACCAGCGCCGTCTGACTCGGACCTTC  219

Query  217  GAGGCATGTCATGTGGCAGGGGCCCCTCCAGGCACCGGGCAGGACAATTGGTTGCAGACACACTTTGTGGAGCG  290
            ||.|||||.||.||.||||||..||||||.||..|.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct  220  GAAGCATGCCACGTTGCAGGGCTCCCTCCTGGTTCTGGCCAGGACAATTGGCTGCAGACACACTTTGTGGAACG  293

Query  291  GCGCGGGGCCCAGAGGGCGCACATTCGACTCCACTTCTCTGTGCGGGCATGCTCCAGCCTGGGTGTGAGCGGCG  364
            |||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct  294  GCGAGGGGCCCAGAGGGCACACATCCGCCTTCACTTCTCTGTACGAGCCTGTTCCAGCCTGGGTGTGAGTGGGG  367

Query  365  GCACCTGCCGGGAGACCTTCACCCTTTACTACCGTCAGGCTGAGGAGCCCGACAGCCCTGACAGCGTTTCCTCC  438
            |.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||.||||.|||||..||.|..||
Sbjct  368  GTACCTGCCGAGAGACCTTCACCCTTTACTACCGGCAGGCTGATGAGCCAGACGGCCCCGACAGTATTGCGGCC  441

Query  439  TGGCACCTCAAACGCTGGACCAAGGTGGACACAATTGCAGCAGACGAGAGCTTTCCCT-CCTCCTCCTCCTCCT  511
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||| |||||| |||||||.|||||.|
Sbjct  442  TGGCACCTCAAACGCTGGACCAAAGTGGACACAATTGCCGCAGATGAGAGC-TTCCCTGCCTCCTCTTCCTCTT  514

Query  512  CCTCCTCTTCTTCCTCTGCAGCGTGGGCTGTGGGACCCCACGGGGCTGGGCAGCGGGCTGGACTGCAACTGAAC  585
            |||                  |.||||||||||||||||||.||.|.||.|||||||..||||||||.|||||.
Sbjct  515  CCT------------------CATGGGCTGTGGGACCCCACAGGACCGGTCAGCGGGTGGGACTGCAGCTGAAT  570

Query  586  GTCAAAGAGCGGAGCTTTGGGCCTCTCACCCAACGCGGCTTCTACGTGGCCTTCCAGGACACGGGGGCCTGCCT  659
            |||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  571  GTCAAAGAGCGCAGCTTTGGTCCTCTCACTCAGCGTGGCTTCTATGTGGCCTTCCAGGACACAGGGGCCTGCCT  644

Query  660  GGCCCTGGTCGCTGTCAGGCTCTTCTCCTACACCTG-CCCTGCCGTGCTCCGATCCTTTGCTTCCTTTCCAGAG  732
            ||||||.||.||.||||.|||||||||||||||||| |||| ||||.||.||..|||||||.||.|||||.|||
Sbjct  645  GGCCCTTGTGGCAGTCAAGCTCTTCTCCTACACCTGTCCCT-CCGTCCTGCGTGCCTTTGCCTCTTTTCCTGAG  717

Query  733  ACGCAGGCCAGTGGGGCTGGGGGGGCCTCCCTGGTGGCAGCTGTGGGCACCTGTGTGGCTCATGCAGAGCCAGA  806
            ||.|||||||||||.|||||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  718  ACACAGGCCAGTGGAGCTGGAGGGGCTTCCTTAGTGGCAGCTGTGGGCACCTGTGTAGCTCATGCAGAACCAGA  791

Query  807  GGAGGATGGAGTAGGGGGCCAGGCAGGAGGCAGCCCCCCCAGGCTGCACTGCAACGGGGAGGGCAAGTGGATGG  880
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.||.||.||||.||||||||
Sbjct  792  GGAGGATGGAGTAGGAGGCCAGGCAGGGGGCAGCCCCCCAAGGTTACACTGTAATGGCGAAGGCAGGTGGATGG  865

Query  881  TAGCTGTCGGGGGCTGCCGCTGCCAGCCTGGATACCAACCAGCACGAGGAGACAAGGCCTGCCAAGCCTGCCCA  954
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||..||||||||||||||| 
Sbjct  866  TAGCTGTGGGAGGCTGCCGCTGCCAGCCTGGACACCAGCCTGCTCGTGGAGACAAGCTCTGCCAAGCCTGCCC-  938

Query  955  CGGGGGCT-CTATAAGTCTTCT-GCTGGGAATGCTCCCTGCTCACCATGCCCTGCCCGCAGTCACGCTCCCAAC  1026
            .|.|||.| |||||||.| .|| ||||||||||.||||||.|||||.||.||.||||||||.|||.|.||..||
Sbjct  939  TGAGGGATCCTATAAGGC-CCTGGCTGGGAATGTTCCCTGTTCACCGTGTCCAGCCCGCAGCCACTCCCCTGAC  1011

Query 1027  CCAGCAGCCCCCGTTTGCCCCTGCCTGGAGGGCTTCTACCGGGCCAGTTCCGACCCACCAGAGGCCCCCTGCAC  1100
            ||.||||||||.||||||||.||.||..|.|||||||||.||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1012  CCTGCAGCCCCAGTTTGCCCATGTCTCCAAGGCTTCTACAGGGCCAGTTCGGACCCACCAGAGGCTCCCTGCAC  1085

Query 1101  TGGTCCTCCATCGGCTCCCCAGGAGCTTTGGTTTGAGGTGCAAGGCTCAGCACTCATGCTACACTGGCGCCTGC  1174
            ||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1086  TGGTCCTCCATCGGCTCCCCGGGAGCTATGGTTTGAGGTGCAAGGCTCGGCACTCATGCTGCACTGGCGTCTGC  1159

Query 1175  CTCGGGAGCTGGGGGGTCGAGGGGACCTGCTCTTCAATGTCGTGTGCAAGGAGTGTGAAGGCCGCCAGGA-ACC  1247
            |||.|||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.|.|  ||| |.|
Sbjct 1160  CTCAGGAGCTGGGTGGACGAGGGGATCTGCTCTTCAATGTTGTGTGCAAGGAGTGTGGAGGTCAC--GGAGAGC  1231

Query 1248  TGCCAGCGGTGGTGGGGGCACTTGTCACCGCTGCAGGGATGAGGTCCACTTCGACCCTCGCCAGAGAGGCCTGA  1321
              |||||   .|||||||.|..||||.||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1232  --CCAGC---AGTGGGGGGATGTGTCGCCGCTGCAGGGACGAGGTGCATTTCGACCCCCGCCAGAGGGGACTGA  1300

Query 1322  CTGAGAGCCGAGTGTTAGTGGGGGGACTCCGGGCACACGTACCCTACATCTTAGAGGTGCAGGCTGTTAATGGG  1395
            |||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1301  CTGAGAGTCGAGTGTTAGTTGGGGGGCTCCGAGCACACGTGCCATACATCTTGGAAGTGCAGGCTGTCAATGGG  1374

Query 1396  GTGTCTGAGCTCAGCCCTGACCCTCCTCAGGCTGCAGCCATCAATGTCAGCACCAGCCATGAAGTGCCCTCTGC  1469
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1375  GTGTCTGAGCTCAGCCCTGACCCTCCCCAGGCAGCAGCCATCAATGTCAGCACCAGCCACGAAGTCCCTTCTGC  1448

Query 1470  TGTCCCTGTGGTGCACCAGGTGAGCCGGGCATCCAACAGCATCACGGTGTCCTGGCCGCAGCCCGACCAGACCA  1543
            .|||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 1449  AGTCCCTGTGATGCACCAGGTGAGCCGGGCAGCCAACAGCATCACAGTATCCTGGCCACAGCCTGAGCAAACAA  1522

Query 1544  ATGGGAACATCCTGGACTATCAGCTCCGCTACTATGACCAGGCAGAAGACGAATCCCACTCCTTCACCCTGACC  1617
            |||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1523  ATGGGAACATCCTCGACTACCAGCTGCGCTACTATGACCAGGCAGAAGATGAATCCCACTCCTTCACCATGACC  1596

Query 1618  AGCGAGACCAACACTGCCACCGTGACACAGCTGAGCCCTGGCCACATCTATGGTTTCCAGGTGCGGGCCCGGAC  1691
            ||.|||||||||||||||||.|||||||.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1597  AGTGAGACCAACACTGCCACTGTGACACGGTTGAGCCCTGGCCACATCTATGGCTTCCAGGTGCGGGCACGGAC  1670

Query 1692  TGCTGCCGGCCACGGCCCCTACGGGGGCAAAGTCTATTTCCAGACACTTCCTCAAGGGGAGCTGTCTTCCCAGC  1765
            |||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1671  TGCAGCTGGCCACGGCCCCTATGGGGGCAAAGTCTATTTTCAGACATTGCCTCAAGGTGAGCTGTCCTCCCAGC  1744

Query 1766  TTCCGGA-AAGACTCTCCTTGGTGATCGGCTCCATCCTGGGGGCTTTGGCCTTCCTCCTGCTGGCAGCCATCAC  1838
            ||||.|| ||| ||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1745  TTCCAGAGAAG-CTGTCCTTGGTGATTGGTTCCATCCTGGGGGCCTTGGCCTTCCTTCTACTGGCAGCCATCAC  1817

Query 1839  CGTGCTGGCGGTCGTCTTCCAGCGGAAGCGGCGTGGGACTGGCTACACGGAGCAGCTGCAGCAATACAGCAGCC  1912
            .||.|||||.|||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1818  TGTACTGGCTGTCATCTTCCAGCGGAAGCGCCGTGGGACCGGCTACACAGAACAACTGCAACAATACAGCAGCC  1891

Query 1913  CAGGACTCGGGGTGAAGTATTACATCGACCCCTCCACCTACGAGGACCCCTGTCAGGCCATCCGAGAACTTGCC  1986
            |||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||.||||.|||||.
Sbjct 1892  CAGGACTTGGAGTGAAGTATTACATTGACCCTTCTACATACGATGACCCCTGCCAGGCCATCAGAGAGCTTGCT  1965

Query 1987  CGGGAAGTCGATCCTGCTTATATCAAGATTGAGGAGGTCATTGGGACAGGCTCTTTTGGAGAAGTGCGCCAGGG  2060
            ||.||.||.||.|||.|.||||||||||||||.||.|||||||||.||||.||.||||||||||||||.|.|||
Sbjct 1966  CGAGAGGTTGACCCTACATATATCAAGATTGAAGAAGTCATTGGGGCAGGTTCCTTTGGAGAAGTGCGTCGGGG  2039

Query 2061  CCGCCTGCAGCCACGGGGACGGAGGGAGCAGACTGTGGCCATCCAGGCCCTGTGGGCCGGGGGCGCCGAAAGCC  2134
            |||.|||||.||.||||||.|||||||.||..|||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct 2040  CCGACTGCAACCCCGGGGAAGGAGGGAACAAGCTGTGGCTATCCAGGCCTTGTGGGCAGGGGGTGCTGAGAGCC  2113

Query 2135  TGCAGATGACCTTCCTGGGCCGGGCCGCAGTGCTGGGTCAGTTCCAGCACCCCAACATCCTGCGGCTGGAGGGC  2208
            ||.||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 2114  TGAAGATGACCTTTCTGGGTCGGGCAGCACTGCTGGGCCAGTTCCAGCACCCCAATATCCTGCGGCTGGAAGGT  2187

Query 2209  GTGGTCACCAAGAGCCGACCCCTCATGGTGCTGACGGAGTTCATGGAGCTTGGCCCCCTGGACAGCTTCCTCAG  2282
            ||.|||||.|||||.||.||..|||||||||||||.||..|||||||.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 2188  GTAGTCACTAAGAGTCGGCCTGTCATGGTGCTGACAGAACTCATGGAACTTGGTCCCCTGGACAGCTTTCTTAG  2261

Query 2283  GCAGCGGGAGGGCCAGTTCAGCAGCCTGCAGCTGGTGGCCATGCAGCGGGGAGTGGCTGCTGCCATGCAGTACC  2356
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct 2262  GCAGCGAGAGGGCCAGTTCAGTAGCCTGCAGCTGGTGGCCATGCAGCGGGGTGTGGCTGCTGCCATGCAGTACT  2335

Query 2357  TGTCCAGCTTTGCCTTCGTCCATCGCTCGCTGTCTGCCCACAGCGTGCTGGTGAATAGCCACTTGGTGTGCAAG  2430
            ||||||||||||||||.||.||.||..|.||.||.||||..||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 2336  TGTCCAGCTTTGCCTTTGTTCACCGAGCACTCTCGGCCCGAAGTGTGCTAGTGAATAGCCACCTGGTGTGTAAG  2409

Query 2431  GTGGCCCGTCTTGGCCACAGTCCTCAGGGCCCAAGTTGTTTGCTTCGCTGGGCAGCCCCAGAGGTCATTGCACA  2504
            |||||.|||||.|||||||||||||||||..||||||..||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2410  GTGGCACGTCTCGGCCACAGTCCTCAGGGTTCAAGTTCCTTGCTTCGCTGGGCAGCCCCAGAGGTCATTACACA  2483

Query 2505  TGGAAAGCATACAACATCCAGTGATGTCTGGAGCTTTGGGATACTCATGTGGGAAGTGATGAGTTATGGAGAAC  2578
            |||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2484  TGGAAAGTATACAACATCTAGCGATGTCTGGAGCTTTGGCATACTCATGTGGGAAGTGATGAGCTATGGAGAAC  2557

Query 2579  GGCCTTACTGGGACATGAGTGAGCAGGAGGTACTAAATGCAATAGAGCAGGAGTTCCGGCTGCCCCCGCCTCCA  2652
            ||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2558  GGCCCTACTGGGACATGAACGAGCAGGAGGTACTAAATGCAATAGAGCAAGAGTTCCGGCTGCCCCCACCTCCA  2631

Query 2653  GGCTGTCCTCCTGGATTACATCTACTTATGTTGGACACTTGGCAGAAGGACCGTGCCCGGCGGCCTCATTTTGA  2726
            ||.||.||.||||||.||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2632  GGGTGCCCCCCTGGACTACATCTACTGATGCTAGACACTTGGCAGAAGGACCGTGCCCGTCGGCCTCATTTTGA  2705

Query 2727  CCAGCTGGTGGCTGCATTTGACAAGATGATCCGCAAGCCAGATACCCTGCAGGCTGGCGGGGACCCAGGGGAAA  2800
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||..||||.|.|.|||||.|
Sbjct 2706  CCAGCTGGTAGCTGCATTTGACAAGATGATTCGCAAGCCTGATACTCTCCAGGCTGAAGGGGGCTCCGGGGACA  2779

Query 2801  GGCCTTCCCAGGCCCTTCTGACCCCTGTGGCCCTGGACTTTCCTTGTCTGGACTCACCCCAGGCCTGGCTTTCA  2874
            |||||||||||||.|||||||.||||||||||.|||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2780  GGCCTTCCCAGGCTCTTCTGAACCCTGTGGCCTTGGACTTCCCTTGCCTGGACTCTCCCCAGGCCTGGCTTTCA  2853

Query 2875  GCCATTGGACTGGAGTGCTACCAGGACAACTTCTCCAAGTTTGGCCTCTGTACCTTCAGTGATGTGGCTCAGCT  2948
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2854  GCCATTGGACTAGAGTGCTACCAGGACAACTTCTCCAAGTTTGGTCTTTCCACCTTCAGTGATGTGGCTCAGCT  2927

Query 2949  CAGCCTAGAAGACCTGCCTGCCCTGGGCATCACCCTGGCTGGCCACCAGAAGAAGCTGCTGCACCACATCCAGC  3022
            ||||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||.||||.||||
Sbjct 2928  CAGCCTGGAAGACCTGCCAGGCCTGGGCATCACCCTAGCTGGCCACCAGAAGAAACTTCTGCACAACATTCAGC  3001

Query 3023  TCCTTCAGCAACACCTGAGGCAGCAGGGCTCAGTGGAGGTC  3063
            ||||.|||||.|||||||||||||..|||||||||||.||.
Sbjct 3002  TCCTCCAGCAGCACCTGAGGCAGCCAGGCTCAGTGGAAGTG  3042