Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14633
- Subject:
- XM_006495695.3
- Aligned Length:
- 3928
- Identities:
- 2260
- Gaps:
- 1406
Alignment
Query 1 ATGAAGCCGGCGACAGGACTTTGGGTCTGGGTGAGCCTTCTCGTGGCGGCGGGGACCGTCCAGCCCAGCGATTC 74
|||||||.||||||.|||||.||||||||||.|||||||||..||||.||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1 ATGAAGCTGGCGACGGGACTCTGGGTCTGGGGGAGCCTTCTGATGGCAGCGGGGACCGTCCAGCCCAGCGCTTC 74
Query 75 TCAGTCAGTGTGTGCAGGAACGGAGAATAAACTGAGCTCTCTCTCTGACCTGGAACAGCAGTACCGAGCCTTGC 148
||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGTCAGTGTGCGCAGGAACAGAGAACAAACTGAGCTCTCTCTCTGACCTGGAACAGCAGTACCGAGCCTTGC 148
Query 149 GCAAGTACTATGAAAACTGTGAGGTTGTCATGGGCAACCTGGAGATAACCAGCATTGAGCACAACCGGGACCTC 222
||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAAATACTATGAAAACTGCGAGGTAGTCATGGGCAACCTGGAGATCACCAGCATCGAGCACAACCGGGACCTC 222
Query 223 TCCTTCCTGCGGTCTGTTCGAGAAGTCACAGGCTACGTGTTAGTGGCTCTTAATCAGTTTCGTTACCTGCCTCT 296
|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||..|.|||||.||.||.||||||||||||.|||||||
Sbjct 223 TCCTTCCTGCGGTCTATCCGAGAAGTCACAGGCTACGTCCTGGTGGCCCTCAACCAGTTTCGTTACTTGCCTCT 296
Query 297 GGAGAATTTACGCATTATTCGTGGGACAAAACTTTATGAGGATCGATATGCCTTGGCAATATTTTTAAACTACA 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 297 GGAGAATTTACGCATTATTCGTGGGACAAAACTATATGAAGATCGCTATGCCTTAGCGATATTCTTAAACTACA 370
Query 371 GAAAAGATGGAAACTTTGGACTTCAAGAACTTGGATTAAAGAACTTGACAGAAATCCTAAATGGTGGAGTCTAT 444
|.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGAAAGATGGCAACTTTGGACTCCAAGAACTTGGATTAAAGAACCTGACCGAAATACTAAATGGTGGAGTCTAT 444
Query 445 GTAGACCAGAACAAATTCCTTTGTTATGCAGACACCATTCATTGGCAAGATATTGTTCGGAACCCATGGCCTTC 518
||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 GTAGACCAGAACAAATTCCTATGTTATGCTGACACTATACACTGGCAAGATATTGTTCGGAATCCATGGCCTTC 518
Query 519 CAACTTGACTCTTGTGTCAACAAATGGTAGTTCAGGATGTGGACGTTGCCATAAGTCCTGTACTGGCCGTTGCT 592
||||.|||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.|||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 519 CAACATGACTCTGGTGTCAACAAATGGAAGTTCTGGATGTGGAAGATGCCATAAGTCTTGCACTGGCCGATGCT 592
Query 593 GGGGACCCACAGAAAATCATTGCCAGACTTTGACAAGGACGGTGTGTGCAGAACAATGTGACGGCAGATGCTAC 666
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 593 GGGGACCCACAGAAAATCACTGCCAGACCTTGACCAGAACTGTGTGTGCTGAACAATGTGATGGCAGGTGCTAT 666
Query 667 GGACCTTACGTCAGTGACTGCTGCCATCGAGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCTAAGGACACAGACTGCTT 740
|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 667 GGACCCTACGTTAGTGACTGCTGCCATCGAGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCAAAGGACACTGACTGCTT 740
Query 741 TGCCTGCATGAATTTCAATGACAGTGGAGCATGTGTTACTCAGTGTCCCCAAACCTTTGTCTACAATCCAACCA 814
||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCCTGCATGAACTTCAATGACAGTGGAGCCTGCGTTACTCAATGTCCCCAAACATTTGTCTACAATCCAACCA 814
Query 815 CCTTTCAACTGGAGCACAATTTCAATGCAAAGTACACATATGGAGCATTCTGTGTCAAGAAATGTCCACATAAC 888
|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCTTTCAACTGGAACACAACTTCAATGCAAAGTACACGTATGGAGCATTCTGTGTTAAGAAATGTCCACATAAC 888
Query 889 TTTGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTGCGTGCCTGCCCTAGTTCCAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGATTAA 962
||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTCGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTACGAGCCTGCCCTAGTTCTAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGATTAA 962
Query 963 AATGTGTAAACCTTGCACTGACATTTGCCCAAAAGCTTGTGATGGCATTGGCACAGGATCATTGATGTCAGCTC 1036
|||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||||
Sbjct 963 AATGTGTAAGCCTTGCACCGATATTTGCCCCAAAGCATGTGATGGAATCGGCACGGGATCACTGATGTCTGCTC 1036
Query 1037 AGACTGTGGATTCCAGTAACATTGACAAATTCATAAACTGTACCAAGATCAATGGGAATTTGATCTTTCTAGTC 1110
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|.||||||||.|||
Sbjct 1037 AGACTGTGGATTCAAGTAACATTGACAAATTCATAAACTGCACAAAGATCAATGGCAATCTCATCTTTCTTGTC 1110
Query 1111 ACTGGTATTCATGGGGACCCTTACAATGCAATTGAAGCCATAGACCCAGAGAAACTGAACGTCTTTCGGACAGT 1184
|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1111 ACTGGCATTCATGGAGACCCTTACAATGCTATTGACGCCATAGATCCAGAGAAACTGAATGTCTTTCGGACTGT 1184
Query 1185 CAGAGAGATAACAGGTTTCCTGAACATACAGTCATGGCCACCAAACATGACTGACTTCAGTGTTTTTTCTAACC 1258
||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1185 CAGAGAAATAACAGGTTTCCTGAACATACAGTCTTGGCCCCCAAATATGACAGATTTCAGTGTTTTCTCCAACC 1258
Query 1259 TGGTGACCATTGGTGGAAGAGTACTCTATAGTGGCCTGTCCTTGCTTATCCTCAAGCAACAGGGCATCACCTCT 1332
|.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.
Sbjct 1259 TCGTCACAATTGGAGGAAGAGTCCTCTACAGTGGTCTCTCATTGCTGATCCTCAAACAACAAGGTATCACTTCC 1332
Query 1333 CTACAGTTCCAGTCCCTGAAGGAAATCAGCGCAGGAAACATCTATATTACTGACAACAGCAACCTGTGTTATTA 1406
||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTACAGTTCCAGTCTCTGAAGGAAATCAGTGCGGGCAATATCTACATCACTGACAACAGCAACCTGTGTTATTA 1406
Query 1407 TCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCAGCACAATCAACCAGAGAATAGTAATCCGGGACAACAGAAAAGCTG 1480
.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||.|||||
Sbjct 1407 CCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCAGCACCATTAACCAGAGAATAGTGATCCGAGATAACAGAAGAGCTG 1480
Query 1481 AAAATTGTACTGCTGAAGGAATGGTGTGCAACCATCTGTGTTCCAGTGATGGCTGTTGGGGACCTGGGCCAGAC 1554
|.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|.||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1481 AGAATTGTACTGCTGAAGGCATGGTATGCAACCACCTGTGTTCAAATGATGGTTGTTGGGGACCTGGGCCGGAC 1554
Query 1555 CAATGTCTGTCGTGTCGCCGCTTCAGTAGAGGAAGGATCTGCATAGAGTCTTGTAACCTCTATGATGGTGAATT 1628
||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||||.||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1555 CAGTGCCTGTCATGTCGGCGCTTCAGCAGGGGAAAGATCTGCATAGAGTCTTGCAACCTTTATGATGGGGAATT 1628
Query 1629 TCGGGAGTTTGAGAATGGCTCCATCTGTGTGGAGTGTGACCCCCAGTGTGAGAAGATGGAAGATGGCCTCCTCA 1702
|||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1629 TCGAGAGTTTGAAAACGGCTCCATCTGTGTTGAGTGTGACTCCCAGTGTGAGAAAATGGAAGATGGACTCCTCA 1702
Query 1703 CATGCCATGGACCGGGTCCTGACAACTGTACAAAGTGCTCTCATTTTAAAGATGGCCCAAACTGTGTGGAAAAA 1776
||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1703 CATGCCATGGACCGGGACCTGACAACTGCACAAAGTGCTCTCATTTTAAGGATGGTCCAAACTGTGTGGAGAAA 1776
Query 1777 TGTCCAGATGGCTTACAGGGGGCAAACAGTTTCATTTTCAAGTATGCTGATCCAGATCGGGAGTGCCACCCATG 1850
||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||..|||||||||||||||||.||
Sbjct 1777 TGTCCAGATGGCCTACAGGGAGCAAACAGTTTCATTTTTAAGTATGCAGATCAGGATCGGGAGTGCCACCCTTG 1850
Query 1851 CCATCCAAACTGCACCCAAGGGTGTAACGGTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTACCCATGGACGGGCCATT 1924
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CCATCCAAACTGCACCCAGGGGTGTAACGGTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTACCCATGGACGGGCCATT 1924
Query 1925 CCACTTTACCACAACATGCTAGAACTCCCCTGATTGCAGCTGGAGTAATTGGTGGGCTCTTCATTCTGGTCATT 1998
||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 1925 CCACTTTACCACAACACGCTAGAACTCCACTGATTGCAGCCGGAGTCATTGGAGGCCTCTTCATCCTGGTGATC 1998
Query 1999 GTGGGTCTGACATTTGCTGTTTATGTTAGAAGGAAGAGCATCAAAAAGAAAAGAGCCTTGAGAAGATTCTTGGA 2072
.|||.|.|||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||.||||||.||||
Sbjct 1999 ATGGCTTTGACATTTGCTGTCTATGTCAGAAGAAAGAGCATCAAAAAGAAACGTGCTTTGAGGAGATTCCTGGA 2072
Query 2073 AACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCAGTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTTCGTATTTTGAAAGAAA 2146
.||||||.||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 2073 GACAGAGCTGGTAGAGCCCTTAACTCCCAGTGGCACGGCACCCAATCAAGCTCAACTTCGCATTTTGAAGGAAA 2146
Query 2147 CTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGCTCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGGTATTTGGGTACCTGAA 2220
|.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2147 CCGAACTAAAGAGGGTAAAGGTCCTTGGCTCGGGAGCTTTTGGAACCGTTTATAAAGGTATTTGGGTGCCTGAA 2220
Query 2221 GGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTATTAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCAAGGCAAATGTGGAGTT 2294
||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 2221 GGTGAAACAGTGAAAATCCCTGTGGCTATAAAGATCCTCAATGAAACAACTGGCCCCAAAGCCAACGTGGAGTT 2294
Query 2295 CATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTATGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTGGGTGTGTGTCTGAGCC 2368
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..|..||||.|||||||||||.|
Sbjct 2295 CATGGATGAGGCTCTGATCATGGCAAGTATGGATCACCCACACCTAGTTCGCCTATTGGGAGTGTGTCTGAGTC 2368
Query 2369 CAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATGCCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCACGAGCACAAGGATAAC 2442
|.||.||||||.|||||||.||.||.|||||.|||||||||||..||||.|||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 2369 CCACTATCCAGTTGGTTACGCAGCTGATGCCGCATGGCTGCCTACTGGACTATGTTCATGAACACAAGGATAAC 2442
Query 2443 ATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTGTGTCCAGATAGCTAAGGGAATG----ATGTACCTGGAAGAAAGAC 2512
|||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||.||||| ||||| .|||.|.|||...||||..
Sbjct 2443 ATTGGATCACAGCTGCTGTTGAACTGGTGTGTCCAGATTGCTAA--GAATGGCCACTGTCCTTGGTGCAAAGCT 2514
Query 2513 GACTCGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATGTCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAAATCACAGATTTT 2586
||.|| ||.|.||
Sbjct 2515 GAGTC-----TCCGAAT--------------------------------------------------------- 2526
Query 2587 GGGCTAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAAGAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCCAATTAAATGGAT 2660
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 2661 GGCTCTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCACCCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAGTTACTATATGGG 2734
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 2735 AACTGATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATGGAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTATTAGAGAAAGGA 2808
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 2809 GAACGTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATTGACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTGGATGATTGATGC 2882
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 2883 TGACAGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGCTGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTCAAAGATACCTAG 2956
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 2957 TTATTCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCAGTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAATCTCTTGGATGAA 3030
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 3031 GAGGATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAGTACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCCACCTCCCATCTA 3104
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 3105 TACTTCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGGAGTGAAATTGGACACAGCCCTCCTCCTGCCTACACCCCCATGT 3178
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 3179 CAGGAAACCAGTTTGTATACCGAGATGGAGGTTTTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCCTACAGAGCCCCA 3252
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 3253 ACTAGCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAGGGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTCCTGCTGTAATGG 3326
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 3327 CACCCTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCAAGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTGCTGACCCCACCG 3400
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 3401 TGTTTGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGCTGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATGCGAGACAAACCC 3474
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 3475 AAACAAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAACCCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGACCTTCAAGCATT 3548
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 3549 GGATAATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGGTCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGAATGAGCCACTGT 3622
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 3623 ACCTCAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAGCTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCAATGCCAGAGAAG 3696
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 3697 GCCAAGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGGAACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCTTCAGCACCCAGA 3770
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 3771 CTACCTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTATAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTGTGGCAGAGAATC 3844
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 3845 CTGAATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAGGCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGACACCGGAATACT 3918
Sbjct 2527 -------------------------------------------------------------------------- 2526
Query 3919 GTGGTG 3924
Sbjct 2527 ------ 2526
