Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14649
- Subject:
- XM_006512539.3
- Aligned Length:
- 1611
- Identities:
- 1338
- Gaps:
- 165
Alignment
Query 1 ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAACAAAACTGACGGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAGCGAAACTGACAGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG 74
Query 75 CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGTGTGACCTCCATCCCCAACT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 75 CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGCGTGACCTCCATCCCGAACT 148
Query 149 ACAACAACTTCCACGCAGCCGGGGGCCAAGGACTCACCGTCTTTGGAGGTGTGAACTCTTCGTCTCATACGGGG 222
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 149 ACAACAACTTCCACGCAGCTGGGGGCCAGGGACTCACCGTCTTTGGGGGTGTGAACTCCTCCTCTCACACTGGG 222
Query 223 ACCTTGCGTACGAGAGGAGGAACAGGAGTGACACTCTTTGTGGCCCTTTATGACTATGAAGCACGGACAGAAGA 296
|||.|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 223 ACCCTACGCACGAGAGGAGGGACAGGAGTGACACTGTTTGTGGCGCTTTATGACTATGAAGCACGGACGGAAGA 296
Query 297 TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGATTGGTGGGAAGCCCGCT 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 297 TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGACTGGTGGGAAGCCCGCT 370
Query 371 CCTTGACAACTGGAGAGACAGGTTACATTCCCAGCAATTATGTGGCTCCAGTTGACTCTATCCAGGCAGAAGAG 444
||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 CCTTGACAACCGGGGAAACTGGTTACATTCCCAGCAATTACGTGGCTCCAGTTGACTCCATCCAGGCAGAAGAG 444
Query 445 TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGAAAAGATGCTGAGCGACAGCTATTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT 518
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGCAAAGATGCTGAGAGACAGCTCCTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT 518
Query 519 TCTTATCCGCGAGAGTGAAACCACCAAAGGTGCCTATTCACTTTCTATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGAG 592
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 TCTTATCCGCGAGAGCGAAACCACCAAAGGTGCCTACTCACTTTCCATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGGG 592
Query 593 ACCATGTCAAACATTATAAAATTCGCAAACTTGACAATGGTGGATACTACATTACCACCCGGGCCCAGTTTGAA 666
||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 593 ACCACGTCAAACATTATAAAATCCGCAAGCTTGACAATGGTGGATACTATATCACAACGCGGGCCCAGTTTGAA 666
Query 667 ACACTTCAGCAGCTTGTACAACATTACTCA-------------------------------------------- 696
|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 667 ACACTTCAGCAACTGGTACAGCATTACTCAGAGAGAGCCGCAGGTCTCTGCTGCCGCCTAGTAGTTCCCTGTCA 740
Query 697 -------------------------------------------------------------------------- 696
Sbjct 741 CAAAGGGATGCCAAGGCTTACCGATCTGTCTGTCAAAACCAAAGATGTCTGGGAAATCCCTCGAGAATCCCTGC 814
Query 697 -----------------------------------------------GGTACCTGGAATGGAAACACAAAAGTA 723
|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 815 AGTTGATCAAGAGACTGGGAAATGGGCAGTTTGGGGAAGTATGGATGGGTACCTGGAATGGAAATACAAAAGTA 888
Query 724 GCCATAAAGACTCTTAAACCAGGCACAATGTCCCCCGAATCATTCCTTGAGGAAGCGCAGATCATGAAGAAGCT 797
|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCCATAAAGACCCTTAAGCCAGGCACCATGTCTCCGGAGTCCTTCCTGGAGGAGGCGCAGATCATGAAGAAGCT 962
Query 798 GAAGCACGACAAGCTGGTCCAGCTCTATGCAGTGGTGTCTGAGGAGCCCATCTACATCGTCACCGAGTATATGA 871
||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 963 GAAGCATGACAAGCTGGTGCAGCTCTACGCGGTCGTGTCTGAGGAGCCCATTTACATCGTCACGGAGTACATGA 1036
Query 872 ACAAAGGAAGTTTACTGGATTTCTTAAAAGATGGAGAAGGAAGAGCTCTGAAATTACCAAATCTTGTGGACATG 945
.||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1037 GCAAAGGAAGTTTGCTTGACTTCTTAAAAGATGGTGAAGGAAGAGCTCTGAAGTTGCCAAACCTTGTGGACATG 1110
Query 946 GCAGCACAGGTGGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGAATTATATCCATAGAGATCTGCGATCAGCAAA 1019
||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCGGCACAGGTTGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGAATTATATCCACAGAGATCTGCGATCAGCAAA 1184
Query 1020 CATTCTAGTGGGGAATGGACTCATATGCAAGATTGCTGACTTCGGATTGGCCCGATTGATAGAAGACAATGAGT 1093
|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1185 CATTCTAGTGGGGAATGGACTAATTTGCAAGATTGCTGACTTTGGATTGGCTCGGTTGATTGAAGACAATGAAT 1258
Query 1094 ACACAGCAAGACAAGGTGCAAAGTTCCCCATCAAGTGGACGGCCCCCGAGGCAGCCCTGTACGGGAGGTTCACA 1167
|||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1259 ACACAGCAAGACAAGGTGCGAAGTTTCCCATTAAGTGGACAGCCCCCGAAGCGGCCCTGTATGGAAGGTTCACA 1332
Query 1168 ATCAAGTCTGACGTGTGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGCTGGTCACCAAAGGAAGAGTGCCATACCCAGG 1241
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATCAAGTCTGACGTATGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGCTGGTCACCAAAGGAAGAGTGCCATACCCAGG 1406
Query 1242 CATGAACAACCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGCGAGGCTACAGGATGCCCTGCCCGCAGGACTGCCCCATCT 1315
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1407 CATGAACAACCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGAGAGGCTATAGGATGCCCTGCCCACAGGACTGCCCGATCT 1480
Query 1316 CTCTGCATGAGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGACCCTGAAGAACGCCCCACTTTTGAGTACTTGCAGAGC 1389
|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||.||
Sbjct 1481 CCCTGCACGAGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGATCCGGAAGAGCGCCCGACCTTCGAGTACTTGCAGGGC 1554
Query 1390 TTCCTGGAAGACTACTTTACCGCGACAGAGCCCCAGTACCAACCTGGTGAAAACCTG 1446
||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1555 TTCCTGGAGGACTACTTTACGGCCACAGAGCCCCAGTATCAGCCCGGTGAAAACCTG 1611