Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14670
• Subject: XM_005246516.4
• Aligned Length: 1758
• Identities: 1684
• Gaps: 72

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCAGCGCGAAGCGGAAGCAGGAGGAGAAGCACCTGAAGATGCTGCGGGACATGACCGGCCTCCCGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCCAGCGCGAAGCGGAAGCAGGAGGAGAAGCACCTGAAGATGCTGCGGGACATGACCGGCCTCCCGCA  74

Query   75  CAACCGAAAGTGCTTCGACTGCGGCCAGCGCGGCCCCACCTACGTTAACATGACGGTCGGCTCCTTCGTGTGTA  148
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAACCGAAAGTGCTTCGACTGCGACCAGCGCGGCCCCACCTACGTTAACATGACGGTCGGCTCCTTCGTGTGTA  148

Query  149  CCTCCTGCTCCGGCAGCCTGCGAGGATTAAATCCACCACACAGGGTGAAATCTATCTCCATGACAACATTCACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTCCTGCTCCGGCAGCCTGCGAGGATTAAATCCACCACACAGGGTGAAATCTATCTCCATGACAACATTCACA  222

Query  223  CAACAGGAAATTGAATTCTTACAAAAACATGGAAATGAAGTCTGTAAACAGATTTGGCTAGGATTATTTGATGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAACAGGAAATTGAATTCTTACAAAAACATGGAAATGAAGTCTGTAAACAGATTTGGCTAGGATTATTTGATGA  296

Query  297  TAGATCTTCAGCAATTCCAGACTTCAGGGATCCACAAAAAGTGAAAGAGTTTCTACAAGAAAAGTATGAAAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGATCTTCAGCAATTCCAGACTTCAGGGATCCACAAAAAGTGAAAGAGTTTCTACAAGAAAAGTATGAAAAGA  370

Query  371  AAAGATGGTATGTCCCGCCAGAACAAGCCAAAGTCGTGGCATCAGTTCATGCATCTATTTCAGGGTCCTCTGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAGATGGTATGTCCCGCCAGAACAAGCCAAAGTCGTGGCATCAGTTCATGCATCTATTTCAGGGTCCTCTGCC  444

Query  445  AGTAGCACAAGCAGCACACCTGAGGTCAAACCACTGAAATCTCTTTTAGGGGATTCTGCACCAACACTGCACTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTAGCACAAGCAGCACACCTGAGGTCAAACCACTGAAATCTCTTTTAGGGGATTCTGCACCAACACTGCACTT  518

Query  519  AAATAAGGGCACACCTAGTCAGTCCCCAGTTGTAGGTCGTTCTCAAGGGCAGCAGCAGGAGAAGAAGCAATTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAATAAGGGCACACCTAGTCAGTCCCCAGTTGTAGGTCGTTCTCAAGGGCAGCAGCAGGAGAAGAAGCAATTTG  592

Query  593  ACCTTTTAAGTGATCTCGGCTCAGACATCTTTGCTGCTCCAGCTCCTCAGTCAACAGCTACAGCCAATTTTGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTTTTAAGTGATCTCGGCTCAGACATCTTTGCTGCTCCAGCTCCTCAGTCAACAGCTACAGCCAATTTTGCT  666

Query  667  AACTTTGCACATTTCAACAGTCATGCAGCTCAGAATTCTGCAAATGCAGATTTTGCAAACTTTGATGCATTTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACTTTGCACATTTCAACAGTCATGCAGCTCAGAATTCTGCAAATGCAGATTTTGCAAACTTTGATGCATTTGG  740

Query  741  ACAGTCTAGTGGTTCGAGTAATTTTGGAGGTTTCCCCACAGCAAGTCACTCTCCTTTTCAGCCCCAAACTACAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGTCTAGTGGTTCGAGTAATTTTGGAGGTTTCCCCACAGCAAGTCACTCTCCTTTTCAGCCCCAAACTACAG  814

Query  815  ------------------------------------------------------------------------GT  816
                                                                                    ||
Sbjct  815  CATTTAGAATGCTTTCATCTAGCTGCAGTTTTGGTGAATTTACTTCAGCTTTTCCTCTTCAGGCTACCCACAGT  888

Query  817  GGAAGTGCTGCATCAGTAAATGCTAATTTTGCTCATTTTGATAACTTCCCCAAATCCTCCAGTGCTGATTTTGG  890
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAAGTGCTGCATCAGTAAATGCTAATTTTGCTCATTTTGATAACTTCCCCAAATCCTCCAGTGCTGATTTTGG  962

Query  891  AACCTTCAATACTTCCCAGAGTCATCAAACAGCATCAGCTGTTAGTAAAGTTTCAACGAACAAAGCTGGTTTAC  964
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AACCTTCAATACTTCCCAGAGTCATCAAACAGCATCAGCTGTTAGTAAAGTTTCAACGAACAAAGCTGGTTTAC  1036

Query  965  AGACTGCAGACAAATATGCAGCACTTGCTAATTTAGACAATATCTTCAGTGCCGGGCAAGGTGGTGATCAGGGA  1038
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACTGCAGACAAATATGCAGCACTTGCTAATTTAGACAATATCTTCAGTGCCGGGCAAGGTGGTGATCAGGGA  1110

Query 1039  AGTGGCTTTGGGACCACAGGTAAAGCTCCTGTTGGTTCTGTGGTTTCAGTTCCCAGTCAGTCAAGTGCATCTTC  1112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTGGCTTTGGGACCACAGGTAAAGCTCCTGTTGGTTCTGTGGTTTCAGTTCCCAGTCAGTCAAGTGCATCTTC  1184

Query 1113  AGACAAGTATGCAGCTCTGGCAGAACTAGACAGCGTTTTCAGTTCTGCAGCCACCTCCAGTAATGCGTATACTT  1186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGACAAGTATGCAGCTCTGGCAGAACTAGACAGCGTTTTCAGTTCTGCAGCCACCTCCAGTAATGCGTATACTT  1258

Query 1187  CCACAAGTAATGCTAGCAGCAATGTTTTTGGAACAGTGCCAGTGGTTGCTTCTGCACAGACACAGCCTGCTTCA  1260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCACAAGTAATGCTAGCAGCAATGTTTTTGGAACAGTGCCAGTGGTTGCTTCTGCACAGACACAGCCTGCTTCA  1332

Query 1261  TCAAGTGTGCCTGCTCCATTTGGAGCTACGCCTTCCACAAATCCATTTGTTGCTGCTGCTGGTCCTTCTGTGGC  1334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCAAGTGTGCCTGCTCCATTTGGAGCTACGCCTTCCACAAATCCATTTGTTGCTGCTGCTGGTCCTTCTGTGGC  1406

Query 1335  ATCTTCTACAAACCCATTTCAGACCAATGCCAGAGGAGCAACAGCGGCAACCTTTGGCACTGCATCCATGAGCA  1408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATCTTCTACAAACCCATTTCAGACCAATGCCAGAGGAGCAACAGCGGCAACCTTTGGCACTGCATCCATGAGCA  1480

Query 1409  TGCCCACGGGATTCGGCACTCCTGCTCCCTACAGTCTTCCCACCAGCTTTAGTGGCAGCTTTCAGCAGCCTGCC  1482
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGCCCACAGGATTCGGCACTCCTGCTCCCTACAGTCTTCCCACCAGCTTTAGTGGCAGCTTTCAGCAGCCTGCC  1554

Query 1483  TTTCCAGCCCAAGCAGCTTTCCCTCAACAGACAGCTTTTTCTCAACAGCCCAATGGTGCAGGTTTTGCAGCATT  1556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTTCCAGCCCAAGCAGCTTTCCCTCAACAGACAGCTTTTTCTCAACAGCCCAATGGTGCAGGTTTTGCAGCATT  1628

Query 1557  TGGACAAACAAAGCCAGTAGTAACCCCTTTTGGTCAAGTTGCAGCTGCTGGAGTATCTAGTAATCCTTTTATGA  1630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGGACAAACAAAGCCAGTAGTAACCCCTTTTGGTCAAGTTGCAGCTGCTGGAGTATCTAGTAATCCTTTTATGA  1702

Query 1631  CTGGTGCACCAACAGGACAATTTCCAACAGGAAGCTCATCAACCAATCCTTTCTTA  1686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGGTGCACCAACAGGACAATTTCCAACAGGAAGCTCATCAACCAATCCTTTCTTA  1758