Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14704
• Subject: NM_001037129.1
• Aligned Length: 2638
• Identities: 2272
• Gaps: 59

Alignment

Query    1  ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC  74
            |||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGAGAGCTTGTCAACATTCCACTGTTACAGATGCTCACCCTGGTTGCCTTCAGCGGGACTGAGAAACTTCC  74

Query   75  AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG  148
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  AAAAGCCCCTGTCATCACCACGCCTCTTGAAACTGTAGATGCCTTGGTTGAAGAAGTAGCGACTTTCATGTGTG  148

Query  149  CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG  222
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  149  CCGTGGAATCCTACCCTCAGCCCGAGATTTCTTGGACCAGAAATAAAATTCTCATTAAGCTGTTTGACACCCGC  222

Query  223  TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG  296
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  TACAGCATCCGGGAGAATGGTCAGCTCCTCACCATTCTGAGCGTGGAAGACAGTGATGATGGCATCTACTGCTG  296

Query  297  CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA  370
            ||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATAGCCAACAATGGAGTGGGAGGAGCCGTGGAGAGTTGTGGTGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA  370

Query  371  CTCGCCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAGGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC  444
            ||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  371  CTCGTCCTCCCATTAATGTAAAAATAATAGAGGGATTGAAGGCAGTTCTGCCGTGCACTACGATGGGTAACCCC  444

Query  445  AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG  518
            ||||||||.|||||.|||||.|||||.||||...|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACCATCTGTGTCCTGGATCAAGGGGGACAATGCTCTCAGGGAAAATTCCAGAATCGCAGTTCTTGAATCTGG  518

Query  519  GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA  592
            ||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  519  GAGCTTAAGGATCCATAATGTGCAAAAGGAAGATGCAGGACAGTACCGCTGTGTGGCCAAAAACAGCCTGGGCA  592

Query  593  CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAG------------------------------GTTTTTGCC  636
            ||||.||.||||||.||||||||||||||||.|||                              ||||||||.
Sbjct  593  CAGCTTACTCCAAACTGGTGAAGCTGGAAGTGGAGGAAGACAGAGAACCTGAGCAGGACGCTAAAGTTTTTGCA  666

Query  637  AGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGCTCCTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGG  710
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|.|||.|||||||.|||
Sbjct  667  AGAATCCTGCGTGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGTTCCTTTGTAACCCTACGCTGCACAGCAATAGG  740

Query  711  CATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGAAAACGGAAATGCTGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGA  784
            |||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATCCCTGTCCCCACCATCAGCTGGATTGAAAACGGAAATGCTGTTTCTTCAGGTTCCATTCAAGAGAGTGTGA  814

Query  785  AAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGCTGTTTATCACCAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAAT  858
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTCCAGCTCTTCATCACAAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAAT  888

Query  859  AAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGAATGGAGTAAACCACAGAA  932
            |||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||..||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct  889  AAGCACGGAGAAAAGTTCAGTACCGCAAAGGCTGCAGCCACTGTCAGCATAGCAGAATGGAGTAAGTCACAGAA  962

Query  933  AGATAACAAAGGCTACTGCGCCCAGTACAGAGGGGAGGTGTGTAATGCAGTCCTGGCAAAAGATGCTCTTGTTT  1006
            |||.|.|.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  963  AGACAGCCAAGGCTACTGTGCCCAGTACAGAGGGGAGGTGTGTGATGCAGTCCTGGCGAAAGATGCTCTTGTCT  1036

Query 1007  TTCTCAACACCTCCTATGCGGACCCTGAGGAGGCCCAAGAGCTACTGGTCCACACGGCCTGGAATGAACTGAAA  1080
            |..|||||||||||||...||||||.|||||.|||||.|||||.|||.|||||||.||.||||||||.|||||.
Sbjct 1037  TCTTCAACACCTCCTACCGGGACCCCGAGGACGCCCAGGAGCTGCTGATCCACACTGCGTGGAATGAGCTGAAG  1110

Query 1081  GTAGTGAGCCCAGTCTGCCGGCCAGCTGCTGAGGCTTTGTTGTGTAACCACATCTTCCAGGAGTGCAGTCCTGG  1154
            |..|||||.|||.|.|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1111  GCTGTGAGTCCACTGTGCCGGCCAGCTGCTGAGGCTCTGCTGTGTAACCACCTCTTCCAAGAGTGCAGCCCTGG  1184

Query 1155  AGTAGTGCCTACTCCTATTCCCATTTGCAGAGAGTACTGCTTGGCAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAAT  1228
            |||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1185  AGTGGTACCTACTCCCATGCCCATTTGCAGAGAGTACTGCCTGGCGGTAAAGGAGCTCTTCTGTGCAAAGGAAT  1258

Query 1229  GGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGAGGACTCTACAGATCCGAGATGCATTTGCTGTCC-GTGCCAGAATG  1301
            |||.||.||||||||..|||.|||||.|.||.|||||||||||.|.|||||||.|.|| ||| ||.|||||.||
Sbjct 1259  GGCAGGCAATGGAAGGAAAGGCCCACCGGGGCCTCTACAGATCTGGGATGCATCTCCT-TCCGGTACCAGAGTG  1331

Query 1302  CAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACCCCACGGCCTGTGCCAGACTGCCACATCTAGATTATAACAAAGAAA  1375
            |||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||..|.|||||||||.||.|||               
Sbjct 1332  CAGCAAGCTTCCCAGCATGCACCGGGACCCCACAGCCTGCACAAGACTGCCATATTTAG---------------  1390

Query 1376  ACCTAAAAACATTCCCACCAATGACGTCCTCAAAGCCAAGTGTGGACATTCCAAATCTGCCTTCCTCCTCCTCT  1449
                     |||||||..||||.||||||||.|.|||.||.|.||||||||||||.||||||.|||||.||   
Sbjct 1391  ---------CATTCCCGTCAATAACGTCCTCCAGGCCGAGCGCGGACATTCCAAACCTGCCTGCCTCCACC---  1452

Query 1450  TCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACATACTCCATGACTGTAATAATCTCCATCATGTCCAGCTTTGCAATATTTGT  1523
            ||||||||..|.|||||.|||.|.|||||||||||.||.||.|||||||||.|||||||||||||..|.||||.
Sbjct 1453  TCTTCCTTTGCCGTCTCGCCTGCGTACTCCATGACCGTCATCATCTCCATCGTGTCCAGCTTTGCCCTGTTTGC  1526

Query 1524  GCTTCTTACCATAACTACTCTCTATTGCTGCCGAAGAAGAAAACAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAATCAGCAG  1597
            .|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||..|.|
Sbjct 1527  TCTTCTCACCATCGCTACTCTCTATTGCTGCCGAAGGAGGAAAGAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAGTCGACCG  1600

Query 1598  CAGTAACCCTCACCACACTGCCTTCTGAGCTCTTACTAGATAGACTTCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATG  1671
            |.||.|||||||||||..|||||||.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601  CGGTGACCCTCACCACGTTGCCTTCCGAGCTCCTGCTGGATAGGCTCCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATG  1674

Query 1672  CCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTGCTCAGCCTGGAGTATCCAAGGAATAACATTGAATATGTGAGAGACATCGG  1745
            ||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct 1675  CCACTCCTTCTGAATCCTAAGTTGCTCAGCCTGGAGTATCCGAGGAATAACATTGAGTATGTCCGAGACATCGG  1748

Query 1746  AGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTTTCAAGCAAGGGCACCAGGCTTACTTCCCTATGAACCTTTCACTATGGTGG  1819
            ||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1749  AGAGGGGGCGTTTGGAAGAGTCTTCCAAGCAAGGGCCCCTGGCTTGCTGCCTTATGAACCTTTCACTATGGTGG  1822

Query 1820  CAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAGCCTCGGCAGATATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCTCATGGCA  1893
            |.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1823  CCGTGAAGATGCTTAAGGAAGAGGCCTCTGCAGACATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCGGCCCTCATGGCA  1896

Query 1894  GAATTTGACAACCCTAACATTGTGAAGCTATTAGGAGTGTGTGCTGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGCTCTTTGA  1967
            ||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1897  GAGTTTGACAACCCCAACATTGTGAAACTCTTAGGTGTGTGTGCCGTTGGGAAGCCGATGTGTCTGCTCTTTGA  1970

Query 1968  ATACATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGCAGCATGTCCCCTCACACCGTGTGCAGCCTCAGTCACA  2041
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1971  ATATATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGAAGTATGTCCCCGCACACTGTTTGCAGCCTCAGCCACA  2044

Query 2042  GTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGGTCTCCAGCCCTGGGCCCCCACCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCTTTGCATT  2115
            |||||.||||.|.||||||||.|||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 2045  GTGACCTGTCCACGAGGGCTCGGGTGTCTAGCCCTGGTCCTCCACCACTGTCCTGTGCAGAACAGCTCTGCATT  2118

Query 2116  GCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCTTACCTCTCAGAACGTAAGTTTGTTCACCGAGATTTAGCCACCAGGAA  2189
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 2119  GCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCCTACCTTTCAGAGCGCAAGTTTGTCCACCGGGACTTAGCTACCAGGAA  2192

Query 2190  CTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGTGGTGAAAATTGCCGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTACTCAGCAGACT  2263
            |||||||||.||.||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2193  CTGCCTGGTTGGGGAGACCATGGTGGTGAAAATTGCAGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTATTCCGCAGACT  2266

Query 2264  ACTACAAAGCTAATGAAAACGACGCTATCCCTATCCGTTGGATGCCACCAGAGTCCATTTTTTATAACCGCTAC  2337
            |||||||||||.|||.|||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 2267  ACTACAAAGCTGATGGAAATGACGCCATCCCTATCCGCTGGATGCCGCCCGAGTCTATCTTCTACAACCGCTAC  2340

Query 2338  ACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCCTATGGCGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGCCTGCAGCCCTACTA  2411
            ||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2341  ACCACTGAGTCGGATGTATGGGCCTATGGTGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGGCTGCAGCCCTACTA  2414

Query 2412  TGGGATGGCCCATGAGGAGGTCATTTACTACGTGCGAGATGGCAACATCCTCTCCTGCCCTGAGAACTGCCCCG  2485
            |||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2415  TGGAATGGCCCACGAGGAGGTCATTTACTATGTGAGAGATGGCAACATCCTCGCCTGCCCTGAGAACTGCCCCT  2488

Query 2486  TGGAGCTGTACAATCTCATGCGTCTATGTTGGAGCAAGCTGCCTGCAGACAGACCCAGTTTCACCAGTATTCAC  2559
            ||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||..||||||.|||
Sbjct 2489  TGGAACTGTACAACCTCATGCGCCTGTGTTGGAGCAAGCTGCCTGCTGATAGACCCAGCTTCTGCAGTATCCAC  2562

Query 2560  CGAATTCTGGAACGCATGTGTGAGAGGGCAGAGGGAACTGTGAGTGTC  2607
            .|.||.|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||
Sbjct 2563  AGGATCCTGCAGCGCATGTGCGAGAGAGCAGAGGGAACGGTGGGTGTC  2610