Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14704
• Subject: NM_010944.2
• Aligned Length: 2608
• Identities: 2293
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC  74
            |||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGAGAGCTTGTCAACATTCCACTGTTACAGATGCTCACCCTGGTTGCCTTCAGCGGGACTGAGAAACTTCC  74

Query   75  AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG  148
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  AAAAGCCCCTGTCATCACCACGCCTCTTGAAACTGTAGATGCCTTGGTTGAAGAAGTAGCGACTTTCATGTGTG  148

Query  149  CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG  222
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  149  CCGTGGAATCCTACCCTCAGCCCGAGATTTCTTGGACCAGAAATAAAATTCTCATTAAGCTGTTTGACACCCGC  222

Query  223  TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG  296
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  TACAGCATCCGGGAGAATGGTCAGCTCCTCACCATTCTGAGCGTGGAAGACAGTGATGATGGCATCTACTGCTG  296

Query  297  CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA  370
            ||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATAGCCAACAATGGAGTGGGAGGAGCCGTGGAGAGTTGTGGTGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA  370

Query  371  CTCGCCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAGGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC  444
            ||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  371  CTCGTCCTCCCATTAATGTAAAAATAATAGAGGGATTGAAGGCAGTTCTGCCGTGCACTACGATGGGTAACCCC  444

Query  445  AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG  518
            ||||||||.|||||.|||||.|||||.||||...|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACCATCTGTGTCCTGGATCAAGGGGGACAATGCTCTCAGGGAAAATTCCAGAATCGCAGTTCTTGAATCTGG  518

Query  519  GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA  592
            ||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  519  GAGCTTAAGGATCCATAATGTGCAAAAGGAAGATGCAGGACAGTACCGCTGTGTGGCCAAAAACAGCCTGGGCA  592

Query  593  CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAGGTTTTTGCCAGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAAT  666
            ||||.||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGCTTACTCCAAACTGGTGAAGCTGGAAGTGGAGGTTTTTGCAAGAATCCTGCGTGCTCCTGAATCCCACAAT  666

Query  667  GTCACCTTTGGCTCCTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGGCATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGA  740
            |||||||||||.||||||||.|||||.|.|||.|||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  667  GTCACCTTTGGTTCCTTTGTAACCCTACGCTGCACAGCAATAGGCATCCCTGTCCCCACCATCAGCTGGATTGA  740

Query  741  AAACGGAAATGCTGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGC  814
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  AAACGGAAATGCTGTTTCTTCAGGTTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTCCAGC  814

Query  815  TGTTTATCACCAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAATAAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAG  888
            |.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  815  TCTTCATCACAAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAATAAGCACGGAGAAAAGTTCAGTACCGCAAAG  888

Query  889  GCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGAATGGAGTAAACCACAGAAAGATAACAAAGGCTACTGCGCCCAGTACAG  962
            |||||||||||..||||||||||||||||||||||..||||||||||.|.|.||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  GCTGCAGCCACTGTCAGCATAGCAGAATGGAGTAAGTCACAGAAAGACAGCCAAGGCTACTGTGCCCAGTACAG  962

Query  963  AGGGGAGGTGTGTAATGCAGTCCTGGCAAAAGATGCTCTTGTTTTTCTCAACACCTCCTATGCGGACCCTGAGG  1036
            |||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||..|||||||||||||...||||||.||||
Sbjct  963  AGGGGAGGTGTGTGATGCAGTCCTGGCGAAAGATGCTCTTGTCTTCTTCAACACCTCCTACCGGGACCCCGAGG  1036

Query 1037  AGGCCCAAGAGCTACTGGTCCACACGGCCTGGAATGAACTGAAAGTAGTGAGCCCAGTCTGCCGGCCAGCTGCT  1110
            |.|||||.|||||.|||.|||||||.||.||||||||.|||||.|..|||||.|||.|.|||||||||||||||
Sbjct 1037  ACGCCCAGGAGCTGCTGATCCACACTGCGTGGAATGAGCTGAAGGCTGTGAGTCCACTGTGCCGGCCAGCTGCT  1110

Query 1111  GAGGCTTTGTTGTGTAACCACATCTTCCAGGAGTGCAGTCCTGGAGTAGTGCCTACTCCTATTCCCATTTGCAG  1184
            ||||||.||.|||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1111  GAGGCTCTGCTGTGTAACCACCTCTTCCAAGAGTGCAGCCCTGGAGTGGTACCTACTCCCATGCCCATTTGCAG  1184

Query 1185  AGAGTACTGCTTGGCAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAATGGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGAG  1258
            ||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||.||.||||||||..|||.|||||.|.|
Sbjct 1185  AGAGTACTGCCTGGCGGTAAAGGAGCTCTTCTGTGCAAAGGAATGGCAGGCAATGGAAGGAAAGGCCCACCGGG  1258

Query 1259  GACTCTACAGATCCGAGATGCATTTGCTGTCC-GTGCCAGAATGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACCC  1331
            |.|||||||||||.|.|||||||.|.|| ||| ||.|||||.|||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1259  GCCTCTACAGATCTGGGATGCATCTCCT-TCCGGTACCAGAGTGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCACCGGGACCC  1331

Query 1332  CACGGCCTGTGCCAGACTGCCACATCTAGATTATAACAAAGAAAACCTAAAAACATTCCCACCAATGACGTCCT  1405
            |||.|||||..|.|||||||||.||.||||||||||.|||||||||.|||.|||||||||..||||.|||||||
Sbjct 1332  CACAGCCTGCACAAGACTGCCATATTTAGATTATAAAAAAGAAAACATAACAACATTCCCGTCAATAACGTCCT  1405

Query 1406  CAAAGCCAAGTGTGGACATTCCAAATCTGCCTTCCTCCTCCTCTTCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACATACTCC  1479
            |.|.|||.||.|.||||||||||||.||||||.|||||.||   ||||||||..|.|||||.|||.|.||||||
Sbjct 1406  CCAGGCCGAGCGCGGACATTCCAAACCTGCCTGCCTCCACC---TCTTCCTTTGCCGTCTCGCCTGCGTACTCC  1476

Query 1480  ATGACTGTAATAATCTCCATCATGTCCAGCTTTGCAATATTTGTGCTTCTTACCATAACTACTCTCTATTGCTG  1553
            |||||.||.||.|||||||||.|||||||||||||..|.||||..|||||.|||||..||||||||||||||||
Sbjct 1477  ATGACCGTCATCATCTCCATCGTGTCCAGCTTTGCCCTGTTTGCTCTTCTCACCATCGCTACTCTCTATTGCTG  1550

Query 1554  CCGAAGAAGAAAACAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAATCAGCAGCAGTAACCCTCACCACACTGCCTTCTGAGC  1627
            ||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||..|.||.||.|||||||||||..|||||||.||||
Sbjct 1551  CCGAAGGAGGAAAGAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAGTCGACCGCGGTGACCCTCACCACGTTGCCTTCCGAGC  1624

Query 1628  TCTTACTAGATAGACTTCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTGCTCAGC  1701
            ||.|.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1625  TCCTGCTGGATAGGCTCCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCACTCCTTCTGAATCCTAAGTTGCTCAGC  1698

Query 1702  CTGGAGTATCCAAGGAATAACATTGAATATGTGAGAGACATCGGAGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTTTCAAGC  1775
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1699  CTGGAGTATCCGAGGAATAACATTGAGTATGTCCGAGACATCGGAGAGGGGGCGTTTGGAAGAGTCTTCCAAGC  1772

Query 1776  AAGGGCACCAGGCTTACTTCCCTATGAACCTTTCACTATGGTGGCAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAGCCTCGG  1849
            ||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 1773  AAGGGCCCCTGGCTTGCTGCCTTATGAACCTTTCACTATGGTGGCCGTGAAGATGCTTAAGGAAGAGGCCTCTG  1846

Query 1850  CAGATATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCTCATGGCAGAATTTGACAACCCTAACATTGTGAAGCTA  1923
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1847  CAGACATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCGGCCCTCATGGCAGAGTTTGACAACCCCAACATTGTGAAACTC  1920

Query 1924  TTAGGAGTGTGTGCTGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGCTCTTTGAATACATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTT  1997
            |||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  TTAGGTGTGTGTGCCGTTGGGAAGCCGATGTGTCTGCTCTTTGAATATATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTT  1994

Query 1998  CCTCCGCAGCATGTCCCCTCACACCGTGTGCAGCCTCAGTCACAGTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGGTCTCCA  2071
            ||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||.||||.|.||||||||.|||.||.|
Sbjct 1995  CCTCCGAAGTATGTCCCCGCACACTGTTTGCAGCCTCAGCCACAGTGACCTGTCCACGAGGGCTCGGGTGTCTA  2068

Query 2072  GCCCTGGGCCCCCACCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCTTTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCTTAC  2145
            |||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2069  GCCCTGGTCCTCCACCACTGTCCTGTGCAGAACAGCTCTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCCTAC  2142

Query 2146  CTCTCAGAACGTAAGTTTGTTCACCGAGATTTAGCCACCAGGAACTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGTGGTGAA  2219
            ||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||.||||||||||||
Sbjct 2143  CTTTCAGAGCGCAAGTTTGTCCACCGGGACTTAGCTACCAGGAACTGCCTGGTTGGGGAGACCATGGTGGTGAA  2216

Query 2220  AATTGCCGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTACTCAGCAGACTACTACAAAGCTAATGAAAACGACGCTATCC  2293
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|||.|||.|||||.||||
Sbjct 2217  AATTGCAGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTATTCCGCAGACTACTACAAAGCTGATGGAAATGACGCCATCC  2290

Query 2294  CTATCCGTTGGATGCCACCAGAGTCCATTTTTTATAACCGCTACACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCCTATGGC  2367
            |||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 2291  CTATCCGCTGGATGCCGCCCGAGTCTATCTTCTACAACCGCTACACCACTGAGTCGGATGTATGGGCCTATGGT  2364

Query 2368  GTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGCCTGCAGCCCTACTATGGGATGGCCCATGAGGAGGTCATTTACTA  2441
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2365  GTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGGCTGCAGCCCTACTATGGAATGGCCCACGAGGAGGTCATTTACTA  2438

Query 2442  CGTGCGAGATGGCAACATCCTCTCCTGCCCTGAGAACTGCCCCGTGGAGCTGTACAATCTCATGCGTCTATGTT  2515
            .|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 2439  TGTGAGAGATGGCAACATCCTCGCCTGCCCTGAGAACTGCCCCTTGGAACTGTACAACCTCATGCGCCTGTGTT  2512

Query 2516  GGAGCAAGCTGCCTGCAGACAGACCCAGTTTCACCAGTATTCACCGAATTCTGGAACGCATGTGTGAGAGGGCA  2589
            ||||||||||||||||.||.||||||||.|||..||||||.|||.|.||.|||.|.||||||||.|||||.|||
Sbjct 2513  GGAGCAAGCTGCCTGCTGATAGACCCAGCTTCTGCAGTATCCACAGGATCCTGCAGCGCATGTGCGAGAGAGCA  2586

Query 2590  GAGGGAACTGTGAGTGTC  2607
            ||||||||.|||.|||||
Sbjct 2587  GAGGGAACGGTGGGTGTC  2604