Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14704
- Subject:
- XM_006537659.2
- Aligned Length:
- 2668
- Identities:
- 2293
- Gaps:
- 65
Alignment
Query 1 ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC 74
|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGAGAGCTTGTCAACATTCCACTGTTACAGATGCTCACCCTGGTTGCCTTCAGCGGGACTGAGAAACTTCC 74
Query 75 AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG 148
||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 AAAAGCCCCTGTCATCACCACGCCTCTTGAAACTGTAGATGCCTTGGTTGAAGAAGTAGCGACTTTCATGTGTG 148
Query 149 CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG 222
|.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 149 CCGTGGAATCCTACCCTCAGCCCGAGATTTCTTGGACCAGAAATAAAATTCTCATTAAGCTGTTTGACACCCGC 222
Query 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG 296
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGTCAGCTCCTCACCATTCTGAGCGTGGAAGACAGTGATGATGGCATCTACTGCTG 296
Query 297 CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATAGCCAACAATGGAGTGGGAGGAGCCGTGGAGAGTTGTGGTGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
Query 371 CTCGCCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAGGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC 444
||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 371 CTCGTCCTCCCATTAATGTAAAAATAATAGAGGGATTGAAGGCAGTTCTGCCGTGCACTACGATGGGTAACCCC 444
Query 445 AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG 518
||||||||.|||||.|||||.|||||.||||...|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 AAACCATCTGTGTCCTGGATCAAGGGGGACAATGCTCTCAGGGAAAATTCCAGAATCGCAGTTCTTGAATCTGG 518
Query 519 GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA 592
||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 519 GAGCTTAAGGATCCATAATGTGCAAAAGGAAGATGCAGGACAGTACCGCTGTGTGGCCAAAAACAGCCTGGGCA 592
Query 593 CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAG--------------------------------------- 627
||||.||.||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct 593 CAGCTTACTCCAAACTGGTGAAGCTGGAAGTGGAGGCTCTTAATATGACAAATGCCACAGAGAGAGAAGACAGA 666
Query 628 ---------------------GTTTTTGCCAGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGCTC 680
||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 GAACCTGAGCAGGACGCTAAAGTTTTTGCAAGAATCCTGCGTGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGTTC 740
Query 681 CTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGGCATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGAAAACGGAAATGCTG 754
||||||.|||||.|.|||.|||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTTTGTAACCCTACGCTGCACAGCAATAGGCATCCCTGTCCCCACCATCAGCTGGATTGAAAACGGAAATGCTG 814
Query 755 TTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGCTGTTTATCACCAAG 828
|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 815 TTTCTTCAGGTTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTCCAGCTCTTCATCACAAAG 888
Query 829 CCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAATAAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCAT 902
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||..|
Sbjct 889 CCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAATAAGCACGGAGAAAAGTTCAGTACCGCAAAGGCTGCAGCCACTGT 962
Query 903 CAGCATAGCAGAATGGAGTAAACCACAGAAAGATAACAAAGGCTACTGCGCCCAGTACAGAGGGGAGGTGTGTA 976
|||||||||||||||||||||..||||||||||.|.|.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 963 CAGCATAGCAGAATGGAGTAAGTCACAGAAAGACAGCCAAGGCTACTGTGCCCAGTACAGAGGGGAGGTGTGTG 1036
Query 977 ATGCAGTCCTGGCAAAAGATGCTCTTGTTTTTCTCAACACCTCCTATGCGGACCCTGAGGAGGCCCAAGAGCTA 1050
|||||||||||||.||||||||||||||.||..|||||||||||||...||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 1037 ATGCAGTCCTGGCGAAAGATGCTCTTGTCTTCTTCAACACCTCCTACCGGGACCCCGAGGACGCCCAGGAGCTG 1110
Query 1051 CTGGTCCACACGGCCTGGAATGAACTGAAAGTAGTGAGCCCAGTCTGCCGGCCAGCTGCTGAGGCTTTGTTGTG 1124
|||.|||||||.||.||||||||.|||||.|..|||||.|||.|.|||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1111 CTGATCCACACTGCGTGGAATGAGCTGAAGGCTGTGAGTCCACTGTGCCGGCCAGCTGCTGAGGCTCTGCTGTG 1184
Query 1125 TAACCACATCTTCCAGGAGTGCAGTCCTGGAGTAGTGCCTACTCCTATTCCCATTTGCAGAGAGTACTGCTTGG 1198
|||||||.|||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1185 TAACCACCTCTTCCAAGAGTGCAGCCCTGGAGTGGTACCTACTCCCATGCCCATTTGCAGAGAGTACTGCCTGG 1258
Query 1199 CAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAATGGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGAGGACTCTACAGATCC 1272
|.|||||||||||||||||.|||||.|||||||.||.||||||||..|||.|||||.|.||.|||||||||||.
Sbjct 1259 CGGTAAAGGAGCTCTTCTGTGCAAAGGAATGGCAGGCAATGGAAGGAAAGGCCCACCGGGGCCTCTACAGATCT 1332
Query 1273 GAGATGCATTTGCTGTCC-GTGCCAGAATGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACCCCACGGCCTGTGCCA 1345
|.|||||||.|.|| ||| ||.|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||..|.|
Sbjct 1333 GGGATGCATCTCCT-TCCGGTACCAGAGTGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCACCGGGACCCCACAGCCTGCACAA 1405
Query 1346 GACTGCCACATCTAGATTATAACAAAGAAAACCTAAAAACATTCCCACCAATGACGTCCTCAAAGCCAAGTGTG 1419
||||||||.||.||||||||||.|||||||||.|||.|||||||||..||||.||||||||.|.|||.||.|.|
Sbjct 1406 GACTGCCATATTTAGATTATAAAAAAGAAAACATAACAACATTCCCGTCAATAACGTCCTCCAGGCCGAGCGCG 1479
Query 1420 GACATTCCAAATCTGCCTTCCTCCTCCTCTTCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACATACTCCATGACTGTAATAAT 1493
|||||||||||.||||||.|||||.|| ||||||||..|.|||||.|||.|.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 1480 GACATTCCAAACCTGCCTGCCTCCACC---TCTTCCTTTGCCGTCTCGCCTGCGTACTCCATGACCGTCATCAT 1550
Query 1494 CTCCATCATGTCCAGCTTTGCAATATTTGTGCTTCTTACCATAACTACTCTCTATTGCTGCCGAAGAAGAAAAC 1567
|||||||.|||||||||||||..|.||||..|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||.|||.
Sbjct 1551 CTCCATCGTGTCCAGCTTTGCCCTGTTTGCTCTTCTCACCATCGCTACTCTCTATTGCTGCCGAAGGAGGAAAG 1624
Query 1568 AATGGAAAAATAAGAAAAGAGAATCAGCAGCAGTAACCCTCACCACACTGCCTTCTGAGCTCTTACTAGATAGA 1641
||||||||||||||||||||||.||..|.||.||.|||||||||||..|||||||.||||||.|.||.|||||.
Sbjct 1625 AATGGAAAAATAAGAAAAGAGAGTCGACCGCGGTGACCCTCACCACGTTGCCTTCCGAGCTCCTGCTGGATAGG 1698
Query 1642 CTTCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTGCTCAGCCTGGAGTATCCAAG 1715
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1699 CTCCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCACTCCTTCTGAATCCTAAGTTGCTCAGCCTGGAGTATCCGAG 1772
Query 1716 GAATAACATTGAATATGTGAGAGACATCGGAGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTTTCAAGCAAGGGCACCAGGCT 1789
||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1773 GAATAACATTGAGTATGTCCGAGACATCGGAGAGGGGGCGTTTGGAAGAGTCTTCCAAGCAAGGGCCCCTGGCT 1846
Query 1790 TACTTCCCTATGAACCTTTCACTATGGTGGCAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAGCCTCGGCAGATATGCAAGCG 1863
|.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1847 TGCTGCCTTATGAACCTTTCACTATGGTGGCCGTGAAGATGCTTAAGGAAGAGGCCTCTGCAGACATGCAAGCG 1920
Query 1864 GACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCTCATGGCAGAATTTGACAACCCTAACATTGTGAAGCTATTAGGAGTGTGTGC 1937
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1921 GACTTTCAGAGGGAGGCGGCCCTCATGGCAGAGTTTGACAACCCCAACATTGTGAAACTCTTAGGTGTGTGTGC 1994
Query 1938 TGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGCTCTTTGAATACATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGCAGCATGT 2011
.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1995 CGTTGGGAAGCCGATGTGTCTGCTCTTTGAATATATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGAAGTATGT 2068
Query 2012 CCCCTCACACCGTGTGCAGCCTCAGTCACAGTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGGTCTCCAGCCCTGGGCCCCCA 2085
||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||.||||.|.||||||||.|||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 2069 CCCCGCACACTGTTTGCAGCCTCAGCCACAGTGACCTGTCCACGAGGGCTCGGGTGTCTAGCCCTGGTCCTCCA 2142
Query 2086 CCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCTTTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCTTACCTCTCAGAACGTAA 2159
||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||
Sbjct 2143 CCACTGTCCTGTGCAGAACAGCTCTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCCTACCTTTCAGAGCGCAA 2216
Query 2160 GTTTGTTCACCGAGATTTAGCCACCAGGAACTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGTGGTGAAAATTGCCGACTTTG 2233
||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||.||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2217 GTTTGTCCACCGGGACTTAGCTACCAGGAACTGCCTGGTTGGGGAGACCATGGTGGTGAAAATTGCAGACTTTG 2290
Query 2234 GCCTCTCCAGGAACATCTACTCAGCAGACTACTACAAAGCTAATGAAAACGACGCTATCCCTATCCGTTGGATG 2307
|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|||.|||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 2291 GCCTCTCCAGGAACATCTATTCCGCAGACTACTACAAAGCTGATGGAAATGACGCCATCCCTATCCGCTGGATG 2364
Query 2308 CCACCAGAGTCCATTTTTTATAACCGCTACACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCCTATGGCGTGGTCCTCTGGGA 2381
||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2365 CCGCCCGAGTCTATCTTCTACAACCGCTACACCACTGAGTCGGATGTATGGGCCTATGGTGTGGTCCTCTGGGA 2438
Query 2382 GATCTTCTCCTATGGCCTGCAGCCCTACTATGGGATGGCCCATGAGGAGGTCATTTACTACGTGCGAGATGGCA 2455
|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 2439 GATCTTCTCCTATGGGCTGCAGCCCTACTATGGAATGGCCCACGAGGAGGTCATTTACTATGTGAGAGATGGCA 2512
Query 2456 ACATCCTCTCCTGCCCTGAGAACTGCCCCGTGGAGCTGTACAATCTCATGCGTCTATGTTGGAGCAAGCTGCCT 2529
||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 2513 ACATCCTCGCCTGCCCTGAGAACTGCCCCTTGGAACTGTACAACCTCATGCGCCTGTGTTGGAGCAAGCTGCCT 2586
Query 2530 GCAGACAGACCCAGTTTCACCAGTATTCACCGAATTCTGGAACGCATGTGTGAGAGGGCAGAGGGAACTGTGAG 2603
||.||.||||||||.|||..||||||.|||.|.||.|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|
Sbjct 2587 GCTGATAGACCCAGCTTCTGCAGTATCCACAGGATCCTGCAGCGCATGTGCGAGAGAGCAGAGGGAACGGTGGG 2660
Query 2604 TGTC 2607
||||
Sbjct 2661 TGTC 2664