Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14704
- Subject:
- XM_006537661.2
- Aligned Length:
- 2668
- Identities:
- 2272
- Gaps:
- 89
Alignment
Query 1 ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC 74
|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGAGAGCTTGTCAACATTCCACTGTTACAGATGCTCACCCTGGTTGCCTTCAGCGGGACTGAGAAACTTCC 74
Query 75 AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG 148
||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 AAAAGCCCCTGTCATCACCACGCCTCTTGAAACTGTAGATGCCTTGGTTGAAGAAGTAGCGACTTTCATGTGTG 148
Query 149 CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG 222
|.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 149 CCGTGGAATCCTACCCTCAGCCCGAGATTTCTTGGACCAGAAATAAAATTCTCATTAAGCTGTTTGACACCCGC 222
Query 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG 296
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGTCAGCTCCTCACCATTCTGAGCGTGGAAGACAGTGATGATGGCATCTACTGCTG 296
Query 297 CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATAGCCAACAATGGAGTGGGAGGAGCCGTGGAGAGTTGTGGTGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
Query 371 CTCGCCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAGGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC 444
||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 371 CTCGTCCTCCCATTAATGTAAAAATAATAGAGGGATTGAAGGCAGTTCTGCCGTGCACTACGATGGGTAACCCC 444
Query 445 AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG 518
||||||||.|||||.|||||.|||||.||||...|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 AAACCATCTGTGTCCTGGATCAAGGGGGACAATGCTCTCAGGGAAAATTCCAGAATCGCAGTTCTTGAATCTGG 518
Query 519 GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA 592
||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 519 GAGCTTAAGGATCCATAATGTGCAAAAGGAAGATGCAGGACAGTACCGCTGTGTGGCCAAAAACAGCCTGGGCA 592
Query 593 CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAG--------------------------------------- 627
||||.||.||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct 593 CAGCTTACTCCAAACTGGTGAAGCTGGAAGTGGAGGCTCTTAATATGACAAATGCCACAGAGAGAGAAGACAGA 666
Query 628 ---------------------GTTTTTGCCAGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGCTC 680
||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 GAACCTGAGCAGGACGCTAAAGTTTTTGCAAGAATCCTGCGTGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGTTC 740
Query 681 CTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGGCATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGAAAACGGAAATGCTG 754
||||||.|||||.|.|||.|||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTTTGTAACCCTACGCTGCACAGCAATAGGCATCCCTGTCCCCACCATCAGCTGGATTGAAAACGGAAATGCTG 814
Query 755 TTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGCTGTTTATCACCAAG 828
|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 815 TTTCTTCAGGTTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTCCAGCTCTTCATCACAAAG 888
Query 829 CCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAATAAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCAT 902
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||..|
Sbjct 889 CCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAATAAGCACGGAGAAAAGTTCAGTACCGCAAAGGCTGCAGCCACTGT 962
Query 903 CAGCATAGCAGAATGGAGTAAACCACAGAAAGATAACAAAGGCTACTGCGCCCAGTACAGAGGGGAGGTGTGTA 976
|||||||||||||||||||||..||||||||||.|.|.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 963 CAGCATAGCAGAATGGAGTAAGTCACAGAAAGACAGCCAAGGCTACTGTGCCCAGTACAGAGGGGAGGTGTGTG 1036
Query 977 ATGCAGTCCTGGCAAAAGATGCTCTTGTTTTTCTCAACACCTCCTATGCGGACCCTGAGGAGGCCCAAGAGCTA 1050
|||||||||||||.||||||||||||||.||..|||||||||||||...||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 1037 ATGCAGTCCTGGCGAAAGATGCTCTTGTCTTCTTCAACACCTCCTACCGGGACCCCGAGGACGCCCAGGAGCTG 1110
Query 1051 CTGGTCCACACGGCCTGGAATGAACTGAAAGTAGTGAGCCCAGTCTGCCGGCCAGCTGCTGAGGCTTTGTTGTG 1124
|||.|||||||.||.||||||||.|||||.|..|||||.|||.|.|||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1111 CTGATCCACACTGCGTGGAATGAGCTGAAGGCTGTGAGTCCACTGTGCCGGCCAGCTGCTGAGGCTCTGCTGTG 1184
Query 1125 TAACCACATCTTCCAGGAGTGCAGTCCTGGAGTAGTGCCTACTCCTATTCCCATTTGCAGAGAGTACTGCTTGG 1198
|||||||.|||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1185 TAACCACCTCTTCCAAGAGTGCAGCCCTGGAGTGGTACCTACTCCCATGCCCATTTGCAGAGAGTACTGCCTGG 1258
Query 1199 CAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAATGGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGAGGACTCTACAGATCC 1272
|.|||||||||||||||||.|||||.|||||||.||.||||||||..|||.|||||.|.||.|||||||||||.
Sbjct 1259 CGGTAAAGGAGCTCTTCTGTGCAAAGGAATGGCAGGCAATGGAAGGAAAGGCCCACCGGGGCCTCTACAGATCT 1332
Query 1273 GAGATGCATTTGCTGTCC-GTGCCAGAATGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACCCCACGGCCTGTGCCA 1345
|.|||||||.|.|| ||| ||.|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||..|.|
Sbjct 1333 GGGATGCATCTCCT-TCCGGTACCAGAGTGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCACCGGGACCCCACAGCCTGCACAA 1405
Query 1346 GACTGCCACATCTAGATTATAACAAAGAAAACCTAAAAACATTCCCACCAATGACGTCCTCAAAGCCAAGTGTG 1419
||||||||.||.||| |||||||..||||.||||||||.|.|||.||.|.|
Sbjct 1406 GACTGCCATATTTAG------------------------CATTCCCGTCAATAACGTCCTCCAGGCCGAGCGCG 1455
Query 1420 GACATTCCAAATCTGCCTTCCTCCTCCTCTTCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACATACTCCATGACTGTAATAAT 1493
|||||||||||.||||||.|||||.|| ||||||||..|.|||||.|||.|.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 1456 GACATTCCAAACCTGCCTGCCTCCACC---TCTTCCTTTGCCGTCTCGCCTGCGTACTCCATGACCGTCATCAT 1526
Query 1494 CTCCATCATGTCCAGCTTTGCAATATTTGTGCTTCTTACCATAACTACTCTCTATTGCTGCCGAAGAAGAAAAC 1567
|||||||.|||||||||||||..|.||||..|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||.|||.
Sbjct 1527 CTCCATCGTGTCCAGCTTTGCCCTGTTTGCTCTTCTCACCATCGCTACTCTCTATTGCTGCCGAAGGAGGAAAG 1600
Query 1568 AATGGAAAAATAAGAAAAGAGAATCAGCAGCAGTAACCCTCACCACACTGCCTTCTGAGCTCTTACTAGATAGA 1641
||||||||||||||||||||||.||..|.||.||.|||||||||||..|||||||.||||||.|.||.|||||.
Sbjct 1601 AATGGAAAAATAAGAAAAGAGAGTCGACCGCGGTGACCCTCACCACGTTGCCTTCCGAGCTCCTGCTGGATAGG 1674
Query 1642 CTTCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTGCTCAGCCTGGAGTATCCAAG 1715
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1675 CTCCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCACTCCTTCTGAATCCTAAGTTGCTCAGCCTGGAGTATCCGAG 1748
Query 1716 GAATAACATTGAATATGTGAGAGACATCGGAGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTTTCAAGCAAGGGCACCAGGCT 1789
||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1749 GAATAACATTGAGTATGTCCGAGACATCGGAGAGGGGGCGTTTGGAAGAGTCTTCCAAGCAAGGGCCCCTGGCT 1822
Query 1790 TACTTCCCTATGAACCTTTCACTATGGTGGCAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAGCCTCGGCAGATATGCAAGCG 1863
|.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1823 TGCTGCCTTATGAACCTTTCACTATGGTGGCCGTGAAGATGCTTAAGGAAGAGGCCTCTGCAGACATGCAAGCG 1896
Query 1864 GACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCTCATGGCAGAATTTGACAACCCTAACATTGTGAAGCTATTAGGAGTGTGTGC 1937
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1897 GACTTTCAGAGGGAGGCGGCCCTCATGGCAGAGTTTGACAACCCCAACATTGTGAAACTCTTAGGTGTGTGTGC 1970
Query 1938 TGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGCTCTTTGAATACATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGCAGCATGT 2011
.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1971 CGTTGGGAAGCCGATGTGTCTGCTCTTTGAATATATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGAAGTATGT 2044
Query 2012 CCCCTCACACCGTGTGCAGCCTCAGTCACAGTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGGTCTCCAGCCCTGGGCCCCCA 2085
||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||.||||.|.||||||||.|||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 2045 CCCCGCACACTGTTTGCAGCCTCAGCCACAGTGACCTGTCCACGAGGGCTCGGGTGTCTAGCCCTGGTCCTCCA 2118
Query 2086 CCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCTTTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCTTACCTCTCAGAACGTAA 2159
||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||
Sbjct 2119 CCACTGTCCTGTGCAGAACAGCTCTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCCTACCTTTCAGAGCGCAA 2192
Query 2160 GTTTGTTCACCGAGATTTAGCCACCAGGAACTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGTGGTGAAAATTGCCGACTTTG 2233
||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||.||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2193 GTTTGTCCACCGGGACTTAGCTACCAGGAACTGCCTGGTTGGGGAGACCATGGTGGTGAAAATTGCAGACTTTG 2266
Query 2234 GCCTCTCCAGGAACATCTACTCAGCAGACTACTACAAAGCTAATGAAAACGACGCTATCCCTATCCGTTGGATG 2307
|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|||.|||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 2267 GCCTCTCCAGGAACATCTATTCCGCAGACTACTACAAAGCTGATGGAAATGACGCCATCCCTATCCGCTGGATG 2340
Query 2308 CCACCAGAGTCCATTTTTTATAACCGCTACACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCCTATGGCGTGGTCCTCTGGGA 2381
||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2341 CCGCCCGAGTCTATCTTCTACAACCGCTACACCACTGAGTCGGATGTATGGGCCTATGGTGTGGTCCTCTGGGA 2414
Query 2382 GATCTTCTCCTATGGCCTGCAGCCCTACTATGGGATGGCCCATGAGGAGGTCATTTACTACGTGCGAGATGGCA 2455
|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 2415 GATCTTCTCCTATGGGCTGCAGCCCTACTATGGAATGGCCCACGAGGAGGTCATTTACTATGTGAGAGATGGCA 2488
Query 2456 ACATCCTCTCCTGCCCTGAGAACTGCCCCGTGGAGCTGTACAATCTCATGCGTCTATGTTGGAGCAAGCTGCCT 2529
||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 2489 ACATCCTCGCCTGCCCTGAGAACTGCCCCTTGGAACTGTACAACCTCATGCGCCTGTGTTGGAGCAAGCTGCCT 2562
Query 2530 GCAGACAGACCCAGTTTCACCAGTATTCACCGAATTCTGGAACGCATGTGTGAGAGGGCAGAGGGAACTGTGAG 2603
||.||.||||||||.|||..||||||.|||.|.||.|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|
Sbjct 2563 GCTGATAGACCCAGCTTCTGCAGTATCCACAGGATCCTGCAGCGCATGTGCGAGAGAGCAGAGGGAACGGTGGG 2636
Query 2604 TGTC 2607
||||
Sbjct 2637 TGTC 2640