Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14712
- Subject:
- NM_001122953.1
- Aligned Length:
- 1548
- Identities:
- 1249
- Gaps:
- 204
Alignment
Query 1 ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCAGGATGAATTTCATCCTTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1 ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCAGGATGAGTTTCATCCTTTCATTGAAGCACTTCTGCCCCATGTCCGCGC 74
Query 75 CTTTGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGTATGTCAA 148
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 75 CTTCGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAGCGGAAATACTTCAAAAAACATGAGAAGCGCATGTCGA 148
Query 149 AAGAAGAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAAACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCGA 222
|||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 149 AAGAAGAGGAGAGGGCCGTGAAGGATGAACTGCTAAGCGAGAAGCCCGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCTTCCCGA 222
Query 223 CTTCTGGCAAAGTTGCGGAAAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAAA 296
||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTCTGGCCAAGTTACGGAAAGATATCCGACCCGAGTACCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAAA 296
Query 297 ACCTCCATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGATGCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAG 370
|||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACCTCCATGCTGTGTTCTTTCCAACCCTGATCAGAAAGGCAAGATGCGGAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAG 370
Query 371 ATAAAGTCTGGAGGTTGGACCTTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGAG 444
|||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATAAAGTATGGAGGTTGGACCTCGTCATGGTGATCTTGTTCAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGAG 444
Query 445 CGCCTTGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTAA 518
||||||||||||...|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 445 CGCCTTGTAAAGAGTCCACAGTGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAGCCCCATCACATAGGGGTTTCTGTAAA 518
Query 519 GGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTGCATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTACATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCAA 592
Query 593 GTGACGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGTT 666
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGAAGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGCTTTGTCACATCAGGTGTT 666
Query 667 TTTAGTGTCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGACACCAATAGCTGCAGGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCTC 740
||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 667 TTCAGTGTGACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAAACACCAATAGCTGCAGGAACCGGCCCCAATTTTTCTCTCTC 740
Query 741 AGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCTA 814
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct 741 TGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTCTGCCCAGCACATCCTCTA 814
Query 815 CGAGCTCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGGC 888
|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 815 CCAGCTCTACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAAGAACCATTTTACACAGGC 888
Query 889 CAAGGGCGCTCCCCAGGAAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGAATGCCATCTCCAAC 962
|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 CAAGGGCGCTCCCCAGGGAGTGGCAGCCAGTCCAGTGGATGGCATGAAGTAGAGCC------------------ 944
Query 963 CACACTGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCTCAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCGT 1036
Sbjct 945 -------------------------------------------------------------------------- 944
Query 1037 TCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGCAAGTCCGCATGCAACACCATCGACTCTTCATTTC 1110
|||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 945 -------------------------------------AGCAAGTCCACATGCGACGCCATCGACTCTCCACTTT 981
Query 1111 CCGACATCACCCATTATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGAC 1184
||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 982 CCAACGTCACCCATCATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGTTACCACCCTCAGGAGAC 1055
Query 1185 GCTGAAAGAATTTGTCCAACTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCA 1258
|||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056 GCTGAAAGAGTTTGTCCAACTTGTCTGTCCTGATGCTGGTCAGCAAGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCA 1129
Query 1259 ATGGGAGCAGCCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACCACCG 1332
||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1130 ATGGAAGCAGTCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTCCCCACCCCAATGTTGCCGCCGCCGCCACCACCACCG 1203
Query 1333 ATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAACCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTC 1406
|||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204 ATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCCATGCCAGACACCAAGCCTCCAACCACATCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTC 1277
Query 1407 CCCCACGTCACCAATCCT-----------GGTACCT---------------------------------GGGAT 1436
||||||.|||||.| ||| .|.|||| |||||
Sbjct 1278 CCCCACCTCACCGA-CCTACTCGACACCCAGCACCTCCCCCGCAAACCGATTCGTCAGTGTTGGACCACGGGAT 1350
Query 1437 AAAAG--TTGCAGCGTCCCACCATCCACCAGACAGAC-CACCCCT----CCCCTTCTCAACTCTG--- 1494
..||| |||.| |..||||..|| |||||| ||..||| | |||
Sbjct 1351 CCAAGCTTTGTA-------AATATCCCTCA-ACAGACACAGTCCTGGTAC------------CTGGGA 1398