Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14712
• Subject: XM_006502842.3
• Aligned Length: 1549
• Identities: 1346
• Gaps: 101

Alignment

Query    1  ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCA-GGATGAATTTCATCCTTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAG  73
                                     | ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct    1  -------------------------ATGGATGAGTTTCATCCTTTCATTGAAGCACTTCTGCCCCATGTCCGCG  49

Query   74  CCTTTGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGTATGTCA  147
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct   50  CCTTCGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAGCGGAAATACTTCAAAAAACATGAGAAGCGCATGTCG  123

Query  148  AAAGAAGAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAAACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCG  221
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  124  AAAGAAGAGGAGAGGGCCGTGAAGGATGAACTGCTAAGCGAGAAGCCCGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCTTCCCG  197

Query  222  ACTTCTGGCAAAGTTGCGGAAAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAA  295
            |||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  198  ACTTCTGGCCAAGTTACGGAAAGATATCCGACCCGAGTACCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAA  271

Query  296  AACCTCCATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGATGCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCA  369
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  272  AACCTCCATGCTGTGTTCTTTCCAACCCTGATCAGAAAGGCAAGATGCGGAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCA  345

Query  370  GATAAAGTCTGGAGGTTGGACCTTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGA  443
            ||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  346  GATAAAGTATGGAGGTTGGACCTCGTCATGGTGATCTTGTTCAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGA  419

Query  444  GCGCCTTGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTA  517
            |||||||||||||...|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  420  GCGCCTTGTAAAGAGTCCACAGTGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAGCCCCATCACATAGGGGTTTCTGTAA  493

Query  518  AGGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTGCATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCA  591
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  494  AGGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTACATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCA  567

Query  592  AGTGACGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGT  665
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  568  AGTGAAGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGCTTTGTCACATCAGGTGT  641

Query  666  TTTTAGTGTCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGACACCAATAGCTGCAGGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCT  739
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  642  TTTCAGTGTGACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAAACACCAATAGCTGCAGGAACCGGCCCCAATTTTTCTCTCT  715

Query  740  CAGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCT  813
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct  716  CTGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTCTGCCCAGCACATCCTCT  789

Query  814  ACGAGCTCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGG  887
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  790  ACCAGCTCTACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAAGAACCATTTTACACAGG  863

Query  888  CCAAGGGCGCTCCCCAGGAAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGAATGCCATCTCCAA  961
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||..||||||||||||
Sbjct  864  CCAAGGGCGCTCCCCAGGGAGTGGCAGCCAGTCCAGTGGATGGCATGAAGTAGAGCCAGGCTTGCCATCTCCAA  937

Query  962  CCACACTGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCTCAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCG  1035
            .|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  938  GCACACTGAAGAAGTCTGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCGCAGACCTCCTCCCTGGGAACAGCA  1011

Query 1036  TTCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGCAAGTCCGCATGCAACACCATCGACTCTTCATTT  1109
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1012  TTCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGCAAGTCCACATGCGACGCCATCGACTCTCCACTT  1085

Query 1110  CCCGACATCACCCATTATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGA  1183
            .||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1086  TCCAACGTCACCCATCATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGTTACCACCCTCAGGAGA  1159

Query 1184  CGCTGAAAGAATTTGTCCAACTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCC  1257
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1160  CGCTGAAAGAGTTTGTCCAACTTGTCTGTCCTGATGCTGGTCAGCAAGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCC  1233

Query 1258  AATGGGAGCAGCCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACCACC  1331
            |||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1234  AATGGAAGCAGTCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTCCCCACCCCAATGTTGCCGCCGCCGCCACCACCACC  1307

Query 1332  GATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAACCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCT  1405
            ||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1308  GATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCCATGCCAGACACCAAGCCTCCAACCACATCAACAGAAGGAGGTGCAGCCT  1381

Query 1406  CCCCCACGTCACCAATCCT-----------GGTACCT---------------------------------GGGA  1435
            |||||||.|||||.| |||           .|.||||                                 ||||
Sbjct 1382  CCCCCACCTCACCGA-CCTACTCGACACCCAGCACCTCCCCCGCAAACCGATTCGTCAGTGTTGGACCACGGGA  1454

Query 1436  TAAAAG--TTGCAGCGTCCCACCATCCACCAGACAGAC-CACCCCT----CCCCTTCTCAACTCTG---  1494
            |..|||  |||.|       |..||||..|| |||||| ||..|||    |            |||   
Sbjct 1455  TCCAAGCTTTGTA-------AATATCCCTCA-ACAGACACAGTCCTGGTAC------------CTGGGA  1503