Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14712
• Subject: XM_006502843.2
• Aligned Length: 1494
• Identities: 1398
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCAGGATGAATTTCATCCTTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct    1  ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCAGGATGAGTTTCATCCTTTCATTGAAGCACTTCTGCCCCATGTCCGCGC  74

Query   75  CTTTGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGTATGTCAA  148
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct   75  CTTCGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAGCGGAAATACTTCAAAAAACATGAGAAGCGCATGTCGA  148

Query  149  AAGAAGAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAAACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCGA  222
            |||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  149  AAGAAGAGGAGAGGGCCGTGAAGGATGAACTGCTAAGCGAGAAGCCCGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCTTCCCGA  222

Query  223  CTTCTGGCAAAGTTGCGGAAAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAAA  296
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCTGGCCAAGTTACGGAAAGATATCCGACCCGAGTACCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAAA  296

Query  297  ACCTCCATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGATGCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAG  370
            |||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCTCCATGCTGTGTTCTTTCCAACCCTGATCAGAAAGGCAAGATGCGGAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAG  370

Query  371  ATAAAGTCTGGAGGTTGGACCTTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGAG  444
            |||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATAAAGTATGGAGGTTGGACCTCGTCATGGTGATCTTGTTCAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGAG  444

Query  445  CGCCTTGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTAA  518
            ||||||||||||...|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  CGCCTTGTAAAGAGTCCACAGTGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAGCCCCATCACATAGGGGTTTCTGTAAA  518

Query  519  GGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTGCATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTACATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCAA  592

Query  593  GTGACGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGTT  666
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGAAGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGCTTTGTCACATCAGGTGTT  666

Query  667  TTTAGTGTCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGACACCAATAGCTGCAGGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCTC  740
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  667  TTCAGTGTGACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAAACACCAATAGCTGCAGGAACCGGCCCCAATTTTTCTCTCTC  740

Query  741  AGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCTA  814
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTCTGCCCAGCACATCCTCTA  814

Query  815  CGAGCTCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGGC  888
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct  815  CCAGCTCTACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAAGAACCATTTTACACAGGC  888

Query  889  CAAGGGCGCTCCCCAGGAAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGAATGCCATCTCCAAC  962
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||..||||||||||||.
Sbjct  889  CAAGGGCGCTCCCCAGGGAGTGGCAGCCAGTCCAGTGGATGGCATGAAGTAGAGCCAGGCTTGCCATCTCCAAG  962

Query  963  CACACTGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCTCAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCGT  1036
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  963  CACACTGAAGAAGTCTGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCGCAGACCTCCTCCCTGGGAACAGCAT  1036

Query 1037  TCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGCAAGTCCGCATGCAACACCATCGACTCTTCATTTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 1037  TCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGCAAGTCCACATGCGACGCCATCGACTCTCCACTTT  1110

Query 1111  CCGACATCACCCATTATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGAC  1184
            ||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1111  CCAACGTCACCCATCATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGTTACCACCCTCAGGAGAC  1184

Query 1185  GCTGAAAGAATTTGTCCAACTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCA  1258
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTGAAAGAGTTTGTCCAACTTGTCTGTCCTGATGCTGGTCAGCAAGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCA  1258

Query 1259  ATGGGAGCAGCCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACCACCG  1332
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1259  ATGGAAGCAGTCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTCCCCACCCCAATGTTGCCGCCGCCGCCACCACCACCG  1332

Query 1333  ATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAACCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTC  1406
            |||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCCATGCCAGACACCAAGCCTCCAACCACATCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTC  1406

Query 1407  CCCCACGTCACCAATCCTGGTACCTGGGATAAAAGTTGCAGCGTCCCACCATCCACCAGACAGACCACCCCTCC  1480
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||...||
Sbjct 1407  CCCCACCTCACCGATCCTGGTACCTGGGATAAAAGTTGCAGCATCCCACCATCCTCCAGACAGACCACCTGACC  1480

Query 1481  CCTTCTCAACTCTG  1494
            ||||||||||||||
Sbjct 1481  CCTTCTCAACTCTG  1494