Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14712
• Subject: XM_006502844.3
• Aligned Length: 1617
• Identities: 1240
• Gaps: 273

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------ATGTATTCTCCGCTCTG--------T  18
                                                            ||..|.|..|.|||.||        |
Sbjct    1  ATGAAGCTTGCTGACAGCGTAATGGCAGGGAAAGCTTCCGACGGCTCCATCAAATGGCAGCTTTGCTACGACAT  74

Query   19  CTCACCCA-------------GGATGAATTTCATCCTTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAGCCTTTG  79
            |||..|||             ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct   75  CTCGGCCAGAACTTGGTGGATGGATGAGTTTCATCCTTTCATTGAAGCACTTCTGCCCCATGTCCGCGCCTTCG  148

Query   80  CCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGTATGTCAAAAGAA  153
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  149  CCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAGCGGAAATACTTCAAAAAACATGAGAAGCGCATGTCGAAAGAA  222

Query  154  GAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAAACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCGACTTCT  227
            ||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  223  GAGGAGAGGGCCGTGAAGGATGAACTGCTAAGCGAGAAGCCCGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCTTCCCGACTTCT  296

Query  228  GGCAAAGTTGCGGAAAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAAAACCTC  301
            |||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCCAAGTTACGGAAAGATATCCGACCCGAGTACCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAAAACCTC  370

Query  302  CATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGATGCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAGATAAA  375
            ||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CATGCTGTGTTCTTTCCAACCCTGATCAGAAAGGCAAGATGCGGAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAGATAAA  444

Query  376  GTCTGGAGGTTGGACCTTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGAGCGCCT  449
            ||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTATGGAGGTTGGACCTCGTCATGGTGATCTTGTTCAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGAGCGCCT  518

Query  450  TGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTAAGGAAC  523
            |||||||...|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  TGTAAAGAGTCCACAGTGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAGCCCCATCACATAGGGGTTTCTGTAAAGGAAC  592

Query  524  TCGATTTATATTTGGCATACTTTGTGCATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCAAGTGAC  597
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  TCGATTTATATTTGGCATACTTTGTACATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCAAGTGAA  666

Query  598  GCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGTTTTTAG  671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGCTTTGTCACATCAGGTGTTTTCAG  740

Query  672  TGTCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGACACCAATAGCTGCAGGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCTCAGATT  745
            |||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  741  TGTGACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAAACACCAATAGCTGCAGGAACCGGCCCCAATTTTTCTCTCTCTGATT  814

Query  746  TGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCTACGAGC  819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  TGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTCTGCCCAGCACATCCTCTACCAGC  888

Query  820  TCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGGCCAAGG  893
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  TCTACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAAGAACCATTTTACACAGGCCAAGG  962

Query  894  GCGCTCCCCAGGAAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGAATGCCATCTCCAACCACAC  967
            ||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||                       
Sbjct  963  GCGCTCCCCAGGGAGTGGCAGCCAGTCCAGTGGATGGCATGAAGTAGAGCC-----------------------  1013

Query  968  TGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCTCAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCGTTCACA  1041
                                                                                      
Sbjct 1014  --------------------------------------------------------------------------  1013

Query 1042  CAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGCAAGTCCGCATGCAACACCATCGACTCTTCATTTCCCGAC  1115
                                            |||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 1014  --------------------------------AGCAAGTCCACATGCGACGCCATCGACTCTCCACTTTCCAAC  1055

Query 1116  ATCACCCATTATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGACGCTGA  1189
            .||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1056  GTCACCCATCATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGTTACCACCCTCAGGAGACGCTGA  1129

Query 1190  AAGAATTTGTCCAACTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCAATGGG  1263
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1130  AAGAGTTTGTCCAACTTGTCTGTCCTGATGCTGGTCAGCAAGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCAATGGA  1203

Query 1264  AGCAGCCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACCACCGATGGC  1337
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1204  AGCAGTCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTCCCCACCCCAATGTTGCCGCCGCCGCCACCACCACCGATGGC  1277

Query 1338  CAGGCCTGTGCCTCTGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAACCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTCCCCCA  1411
            ||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278  CAGGCCTGTGCCTCTGCCCATGCCAGACACCAAGCCTCCAACCACATCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTCCCCCA  1351

Query 1412  CGTCACCAATCCT-----------GGTACCT---------------------------------GGGATAAAAG  1441
            |.|||||.| |||           .|.||||                                 |||||..|||
Sbjct 1352  CCTCACCGA-CCTACTCGACACCCAGCACCTCCCCCGCAAACCGATTCGTCAGTGTTGGACCACGGGATCCAAG  1424

Query 1442  --TTGCAGCGTCCCACCATCCACCAGACAGAC-CACCCCT----CCCCTTCTCAACTCTG---  1494
              |||.|       |..||||..|| |||||| ||..|||    |            |||   
Sbjct 1425  CTTTGTA-------AATATCCCTCA-ACAGACACAGTCCTGGTAC------------CTGGGA  1467