Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14712
- Subject:
- XM_011541514.3
- Aligned Length:
- 1603
- Identities:
- 1436
- Gaps:
- 155
Alignment
Query 1 ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCA-GGATGAATTTCATCCTTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAG 73
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------ATGGATGAATTTCATCCTTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAG 49
Query 74 CCTTTGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGTATGTCA 147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 CCTTTGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGTATGTCA 123
Query 148 AAAGAAGAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAAACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCG 221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 124 AAAGAAGAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAAACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCG 197
Query 222 ACTTCTGGCAAAGTTGCGGAAAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAA 295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 198 ACTTCTGGCAAAGTTGCGGAAAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAA 271
Query 296 AACCTCCATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGATGCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCA 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 AACCTCCATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGATGCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCA 345
Query 370 GATAAAGTCTGGAGGTTGGACCTTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGA 443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 346 GATAAAGTCTGGAGGTTGGACCTTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGA 419
Query 444 GCGCCTTGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTA 517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 GCGCCTTGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTA 493
Query 518 AGGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTGCATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCA 591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494 AGGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTGCATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCA 567
Query 592 AGTGACGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGT 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 568 AGTGACGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGT 641
Query 666 TTTTAGTGTCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGACACCAATAGCTGCAGGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCT 739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 642 TTTTAGTGTCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGACACCAATAGCTGCAGGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCT 715
Query 740 CAGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCT 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 716 CAGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCT 789
Query 814 ACGAGCTCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGG 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 790 ACGAGCTCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGG 863
Query 888 CCAAGGGCGCTCCCCAGGAAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGAATGCCATCTCCAA 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 864 CCAAGGGCGCTCCCCAGGAAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGAATGCCATCTCCAA 937
Query 962 CCACACTGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCTCAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCG 1035
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 938 CCACACTGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCACAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCG 1011
Query 1036 TTCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAG------------------------------------ 1073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012 TTCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGAATTCAAGATGGCTCCCAGCATCCTCGGCTCTCC 1085
Query 1074 ------------------AGCAAGTCCGCATGCAACACCATCGACTCTTCATTTCCCGACATCACCCATTATCC 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1086 TTTCTGGAAAGTCTACTCAGCAAGTCCGCATGCAACACCATCGACTCTTCATTTCCCGACATCACCCATTATCC 1159
Query 1130 AGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGACGCTGAAAGAATTTGTCCAA 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1160 AGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGACGCTGAAAGAATTTGTCCAA 1233
Query 1204 CTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCAATGGGAGCAGCCAAGGCAA 1277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1234 CTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCAATGGGAGCAGCCAAGGCAA 1307
Query 1278 GGTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACCACCGATGGCCAGGCCTGTGCCTC 1351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1308 GGTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACCACCGATGGCCAGGCCTGTGCCTC 1381
Query 1352 TGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAACCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTCCCCCACGTCACCAATCCT- 1424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1382 TGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAACCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTCCCCCACGTCACCAA-CCTA 1454
Query 1425 ----------GGTACCT---------------------------------GGGATAAAAG--TTGCAGCGTCCC 1453
.|.|||| |||||..||| |||.|
Sbjct 1455 CTCGACACCCAGCACCTCCCCCGCAAACCGATTCGTCAGTGTTGGACCACGGGATCCAAGCTTTGTA------- 1521
Query 1454 ACCATCCACCAGACAGAC-CACCCCT----CCCCTTCTCAACTCTG--- 1494
|..||||..|| |||||| ||..||| | |||
Sbjct 1522 AATATCCCTCA-ACAGACACAGTCCTGGTAC------------CTGGGA 1557