Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14720
- Subject:
- NM_001033124.1
- Aligned Length:
- 2410
- Identities:
- 2028
- Gaps:
- 53
Alignment
Query 1 ATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGCGGGGCCGGGCAGCCTGCTGGCTTG 74
||||||||||||...||||.|||||||||.||||||||..||..|||.|||||||..|||||.|||.||.|||.
Sbjct 1 ATGCTGCGAGGCCAGCGGCTCGGGCAGCTGGGCTGGCATCGCCCGGCCGCGGGGCTAGGCAGTCTGATGACTTC 74
Query 75 GCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCGCACCCTGCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGGCTCCTCGGGACTGCGAT 148
|.||||.|||||.|.|||...|||||||.||||.|.|||.|.||||||.|||...|||.|||||||.|||||.|
Sbjct 75 GTTGATGCTGGCCTGTGCCTCCGCCGCATCCTGTCGCGAGGTCTGCTGTCCCGTGGGCCCCTCGGGGCTGCGCT 148
Query 149 GCACCCGGGATGGGGCCCTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAACCTGACTGAGCTCTACATCGAG 222
|||||.|||..|||.|||||||||.|||||.|..|||||..|||||.|.|||||||||.|||||||||.|.||.
Sbjct 149 GCACCAGGGCAGGGTCCCTGGATACCCTCCGCGGCCTGCGGGGCGCCGGGAACCTGACGGAGCTCTACGTGGAA 222
Query 223 AACCAGCAGCATCTGCAGCATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGCTGAGAAACCTCACCATCGT 296
|||||||||||.|||||.|...|||||.|....||.|||..|||||||||||||.||||||.|||.||||||||
Sbjct 223 AACCAGCAGCACCTGCAACGCTTGGAGTTTGAGGACCTGCAGGGCCTGGGGGAGTTGAGAAGCCTAACCATCGT 296
Query 297 GAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTTCCATTTCACTCCTCGGCTCAGTCGCCTGAATCTCTCCT 370
|||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 297 GAAGAGTGGCCTCCGCTTTGTGGCCCCAGATGCCTTCCGTTTCACCCCTCGGCTCAGTCACCTGAATCTGTCCT 370
Query 371 TCAACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAGGAACTGGTCCTGTCGGGGAAC 444
.|||.||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||..||||||.||||||
Sbjct 371 CCAATGCGTTGGAGTCCCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCCTACAGGACCTGACCCTGTCAGGGAAC 444
Query 445 CCTCTGCACTGTTCTTGTGCCCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGACTGGGCGGAGTGCCTGAACA 518
||.|||||.|||||.|||||||||..||||||.|||||.||||||.||||.||.|||.|.||.||||.|..|||
Sbjct 445 CCACTGCATTGTTCCTGTGCCCTGTTCTGGCTCCAGCGTTGGGAGCAGGAAGGGCTGTGTGGTGTGCATACACA 518
Query 519 GAAGCTGCAGTG--TCATGGGCAAGGGCCCCTGG------------CCCACATG---CCCAATGCCAGCTGTGG 575
||.|||.|| || || |||| ||||| ||||| || |.|||..||||.|||||
Sbjct 519 GACGCTTCA-TGACTC-TGGG--------CCTGGAGACCAGTTCCTCCCAC-TGGGACACAACACCAGTTGTGG 581
Query 576 TGTGCCCACGCTGAAGGTCCAGGTGCCCAATGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGCCAGG 649
|||.|||||..|||||.|||||.|||||||||.|||.|||||.|||||.||.||||||.|.||||.||||||||
Sbjct 582 TGTACCCACAGTGAAGATCCAGATGCCCAATGACTCTGTGGAAGTGGGCGATGACGTGTTTCTGCAGTGCCAGG 655
Query 650 TGGAGGGGCGGGGCCTGGAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCAGCCACGGTGATGAAATCT 723
|||||||||.||.|||..|||||||.|.|||||||||||||||||||||...|.|||||||.||||.|||||.|
Sbjct 656 TGGAGGGGCTGGCCCTACAGCAGGCTGACTGGATCCTCACAGAGCTGGAAGGGGCAGCCACCGTGAAGAAATTT 729
Query 724 GGGGGTCTGCCATCCCTGGGGCTGACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACGTGACGTGCTG 797
||.|.||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 730 GGAGATCTGCCATCCCTGGGGCTGATTCTGGTCAATGTCACCAGTGATCTCAACAAGAAGAATGTGACGTGCTG 803
Query 798 GGCAGAGAACGATGTGGGCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTCTCCTTCCCGGCCAGTGTGCAGCTGC 871
|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||.||||||||||||.|||||||||||.|||.
Sbjct 804 GGCAGAGAATGATGTGGGCCGGGCCGAGGTCTCTGTCCAAGTCAGCGTCTCCTTCCCAGCCAGTGTGCACCTGG 877
Query 872 ACACGGCGGTGGAGATGCACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTCTGCGCTGG 945
.|...|||||||||..|||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 878 GCCTAGCGGTGGAGCAGCATCATTGGTGCATCCCCTTCTCGGTGGACGGGCAGCCAGCACCGTCTCTGCGCTGG 951
Query 946 CTCTTCAATGGCTCCGTGCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTCACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAG----CCAATG 1015
.|.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.|.|| | |.||||
Sbjct 952 TTGTTCAACGGCTCTGTGCTCAACGAGACCAGTTTCATCTTCACTCAGTTCTTGGAGTCTGC-GCTGACTAATG 1024
Query 1016 AGACCGTGCGGCACGGGTGTCTGCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCTGGCT 1089
|||||.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 1025 AGACCATGCGGCACGGCTGCCTGCGCCTCAATCAGCCCACGCATGTCAACAACGGGAACTACACCCTGCTGGCG 1098
Query 1090 GCCAACCCCTTCGGCCAGGCCTCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATGGACAACCCTTTCGAGTTCAACCCCGA 1163
||||||||||.|||||||||..||||||||.||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1099 GCCAACCCCTACGGCCAGGCTGCCGCCTCCGTCATGGCTGCTTTTATGGACAACCCTTTTGAGTTCAACCCTGA 1172
Query 1164 GGACCCCATCCCT------------------GACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAGAAGAAGGACG 1219
||||||||||||| |||..||||||||||||..|||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1173 GGACCCCATCCCTGTCTCCTTCTCGCCAGTGGACGGTAACAGCACATCAAGAGACCCAGTGGAGAAGAAAGATG 1246
Query 1220 AAACACCTTTTGGGGTCTCGGTGGCTGTGGGCCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTT 1293
||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.||||..|||||||||||||.|.||.||.|||
Sbjct 1247 AAACCCCTTTTGGGGTCTCTGTGGCTGTGGGCCTAGCCGTCTCTGCCGCCCTCTTCCTTTCTGCCCTCCTTCTT 1320
Query 1294 GTGCTCAACAAATGTGGACGGAGAAACAAGTTTGGGATCAACCGCCCGGCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCT 1367
|||||||||||||||||||.|||.|.|||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||||||||
Sbjct 1321 GTGCTCAACAAATGTGGACAGAGGAGCAAATTTGGGATCAACCGCCCTGCTGTATTAGCTCCAGAGGATGGGCT 1394
Query 1368 GGCCATGTCCCTGCATTTCATGACATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCC 1441
||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1395 GGCCATGTCCCTACACTTCATGACACTGGGTGGCAGTTCTCTTTCCCCTACTGAGGGCAAAGGCTCCGGACTCC 1468
Query 1442 AAGGCCACATCATCGAGAACCCACAATACTTCAGTGATGCCTGTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTG 1515
|.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||.|||||||.|.
Sbjct 1469 AGGGCCACATCATGGAGAACCCACAGTACTTCAGTGATACCTGTGTCCATCACATCAAGCGCCAGGACATCATT 1542
Query 1516 CTCAAGTGGGAGCTGGGGGAGGGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGCCTGAGCA 1589
||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||..|||.||
Sbjct 1543 CTCAAGTGGGAGCTAGGGGAGGGAGCCTTTGGAAAGGTCTTTCTCGCTGAGTGCTACAACCTTCTGAATGATCA 1616
Query 1590 GGACAAGATGCTGGTGGCTGTCAAGGCACTGAAGGAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAGCGTGAGG 1663
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1617 GGACAAGATGCTCGTGGCTGTCAAGGCACTGAAGGAGGCATCCGAGAATGCTCGGCAGGACTTTCAGCGTGAGG 1690
Query 1664 CTGAGCTGCTCACCATGCTGCAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCGAGGGCCGCCCCCTG 1737
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..||||..||
Sbjct 1691 CCGAGCTGCTCACCATGCTACAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTTGGAGTCTGCACCGAGGGTGGCCCGTTG 1764
Query 1738 CTCATGGTCTTTGAGTATATGCGGCACGGGGACCTCAACCGCTTCCTCCGATCCCATGGACCTGATGCCAAGCT 1811
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1765 CTCATGGTCTTTGAGTACATGCGCCACGGGGACCTCAACCGTTTCCTCCGGTCCCACGGACCTGATGCAAAGCT 1838
Query 1812 GCTGGCTGGTGGGGAGGATGTGGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGCTGGCCGTGGCTAGCCAGGTCG 1885
||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1839 GCTGGCTGGTGGTGAGGATGTGGCTCCTGGTCCTCTGGGCCTTGGGCAGCTTCTGGCTGTGGCTAGCCAGGTGG 1912
Query 1886 CTGCGGGGATGGTGTACCTGGCGGGTCTGCATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGC 1959
||||.||.|||||.||.||.||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1913 CTGCTGGTATGGTATATCTAGCCAGCCTGCACTTTGTGCACCGGGATCTGGCCACACGCAACTGTCTGGTGGGT 1986
Query 1960 CAGGGACTGGTGGTCAAGATTGGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCACCGACTATTACCGTGTGGG 2033
||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1987 CAGGGACTAGTGGTGAAGATTGGAGACTTTGGCATGAGCAGAGACATCTATAGCACAGACTATTACCGAGTGGG 2060
Query 2034 AGGCCGCACCATGCTGCCCATTCGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAGCG 2107
|||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 2061 AGGTCGGACCATGCTGCCCATCCGCTGGATGCCACCCGAGAGCATCCTCTACCGCAAGTTCAGCACCGAGAGCG 2134
Query 2108 ACGTGTGGAGCTTCGGCGTGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAAC 2181
|.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135 ATGTGTGGAGCTTTGGGGTGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTATGGAAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAAC 2208
Query 2182 ACGGAGGCAATCGACTGCATCACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGAGGTCTACGC 2255
||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||.||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 2209 ACTGAGGCGATCGAGTGTATCACGCAGGGCCGGGAGCTGGAGCGGCCGCGCGCCTGCCCTCCTGATGTCTACGC 2282
Query 2256 CATCATGCGGGGCTGCTGGCAGCGGGAGCCCCAGCAACGCCACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAG 2329
|||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||.||||||.||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 2283 CATCATGCGAGGCTGCTGGCAGCGAGAACCGCAGCAACGCCTCAGCATGAAGGATGTGCACGCGCGTCTGCAGG 2356
Query 2330 CCCTGGCCCAGGCACC-TCCTGTCTACCTGGATGTCCTGGGC 2370
|||||||.|||||.|| .||.|| ||||||||.||.||||||
Sbjct 2357 CCCTGGCACAGGCGCCACCCAGT-TACCTGGACGTTCTGGGC 2397