Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14722
- Subject:
- XM_011250816.2
- Aligned Length:
- 2596
- Identities:
- 2300
- Gaps:
- 83
Alignment
Query 1 ATGGATGTCTCTCTTTGCCCAGCCAAGTGTAGTTTCTGGCGGATTTTCTTGCTGGGAAGCGTCTGGCTGGACTA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATGTCTCTCTTTGCCCAGCCAAGTGTAGTTTCTGGCGGATTTTCTTGCTGGGAAGCGTCTGGCTGGACTA 74
Query 75 TGTGGGCTCCGTGCTGGCTTGCCCTGCAAATTGTGTCTGCAGCAAGACTGAGATCAATTGCCGGCGGCCGGACG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGTGGGCTCCGTGCTGGCTTGCCCTGCAAATTGTGTCTGCAGCAAGACTGAGATCAATTGCCGGCGGCCGGACG 148
Query 149 ATGGGAACCTCTTCCCCCTCCTGGAAGGGCAGGATTCAGGGAACAGCAATGGGAACGCCAGTATCAACATCACG 222
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 149 ATGGGAACCTCTTCCCTCTCCTGGAAGGGCAGGATTCAGGGAACAGCAATGGGAACGCCAGCATCAACATTACG 222
Query 223 GACATCTCAAGGAATATCACTTCCATACACATAGAGAACTGGCGCAGTCTTCACACGCTCAACGCCGTGGACAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||.|||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 223 GACATCTCAAGGAATATCACTTCCATACACATAGAGAACTGGCGAGGCCTGCACACACTCAATGCTGTGGACAT 296
Query 297 GGAGCTCTACACCGGACTTCAAAAGCTGACCATCAAGAACTCAGGACTTCGGAGCATTCAGCCCAGAGCCTTTG 370
||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||.|||.||||||||||||||.|
Sbjct 297 GGAGCTCTACACGGGACTCCAGAAGCTGACCATCAAGAATTCTGGACTCCGGAACATCCAGCCCAGAGCCTTCG 370
Query 371 CCAAGAACCCCCATTTGCGTTATATAAACCTGTCAAGTAACCGGCTCACCACACTCTCGTGGCAGCTCTTCCAG 444
|||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 CCAAGAACCCCCACTTGCGTTATATAAACTTGTCAAGTAACCGGCTCACCACACTCTCCTGGCAGCTCTTCCAG 444
Query 445 ACGCTGAGTCTTCGGGAATTGCAG-TTGGAGCAGAACTTTTTCAACTGCAGCTGTGACATCCGCTGGATGCAGC 517
||||||||.|||||||||||| || .|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACGCTGAGCCTTCGGGAATTG-AGACTGGAGCAGAACTTCTTCAACTGCAGCTGTGACATCCGCTGGATGCAGC 517
Query 518 TCTGGCAGGAGCAGGGGGAGGCCAAGCTCAACAGCCAGAACCTCTACTGCATCAACGCTGATGGCTCCCAGCTT 591
|.||||||||.|||||||||||...|||..|||||||||.|||.||||||||||..||||||||||||||.||.
Sbjct 518 TGTGGCAGGAACAGGGGGAGGCGCGGCTGGACAGCCAGAGCCTTTACTGCATCAGTGCTGATGGCTCCCAACTC 591
Query 592 CCTCTCTTCCGCATGAACATCAGTCAGTGTGACCTTCCTGAGATCAGCGTGAGCCACGTCAACCTGACCGTACG 665
||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 592 CCCCTCTTCCGCATGAACATCAGTCAGTGTGATCTCCCAGAGATCAGTGTGAGCCACGTCAACCTGACTGTCCG 665
Query 666 AGAGGGTGACAATGCTGTTATCACTTGCAATGGCTCTGGATCACCCCTTCCTGATGTGGACTGGATAGTCACTG 739
|||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||..|.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 AGAAGGAGACAATGCCGTGATCACTTGCAATGGCTCTGGCTCTCCTTTGCCTGATGTGGACTGGATAGTCACTG 739
Query 740 GGCTGCAGTCCATCAACACTCACCAGACCAATCTGAACTGGACCAATGTTCATGCCATCAACTTGACGCTGGTG 813
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 740 GGCTGCAGTCCATCAACACCCACCAGACCAATCTGAACTGGACCAATGTACATGCCATCAACTTGACCCTGGTG 813
Query 814 AATGTGACGAGTGAGGACAATGGCTTCACCCTGACGTGCATTGCAGAGAACGTGGTGGGCATGAGCAATGCCAG 887
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 AACGTGACGAGCGAGGACAATGGCTTCACCCTGACGTGCATTGCAGAGAACGTGGTGGGCATGAGCAATGCCAG 887
Query 888 TGTTGCCCTCACTGTCTACTATCCCCCACGTGTGGTGAGCCTGGAGGAGCCTGAGCTGCGCCTGGAGCACTGCA 961
||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||.|.||||||||.||.||||
Sbjct 888 TGTTGCTCTCACTGTCTACTACCCTCCACGTGTGGTGAGCCTGGTGGAGCCTGAGGTACGCCTGGAACATTGCA 961
Query 962 TCGAGTTTGTGGTGCGTGGCAACCCCCCACCAACGCTGCACTGGCTGCACAATGGGCAGCCTCTGCGGGAGTCC 1035
|.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||.|||||||||.|||||||.|||||..||.||||||||
Sbjct 962 TTGAGTTTGTGGTGCGTGGCAACCCGACACCCACGCTCCACTGGCTGTACAATGGACAGCCATTGAGGGAGTCC 1035
Query 1036 AAGATCATCCATGTGGAATACTACCAAGAGGGAGAGATTTCCGAGGGCTGCCTGCTCTTCAACAAGCCCACCCA 1109
||||||||.||..||||.||||||||.|||||.|||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 AAGATCATTCACATGGACTACTACCAGGAGGGGGAGGTCTCAGAGGGCTGCCTGCTCTTCAACAAGCCCACCCA 1109
Query 1110 CTACAACAATGGCAACTATACCCTCATTGCCAAAAACCCACTGGGCACAGCCAACCAGACCATCAATGGCCACT 1183
||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||..|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1110 CTACAACAATGGCAACTACACCCTCATTGCTAAGAATGCCCTGGGCACGGCCAACCAGACCATCAACGGCCACT 1183
Query 1184 TCCTCAAGGAGCCCTTTCCAGAGAGCACGGATAACTTTATCTTGTTTGA---CGAAGTGAGTCCCACACCTCCT 1254
||||.|||||||||||||||||||||||.|||..||||..| ||||| .||.|.|||.||.|||||||||
Sbjct 1184 TCCTGAAGGAGCCCTTTCCAGAGAGCACAGATTTCTTTGAC---TTTGAGTCTGATGCGAGCCCTACACCTCCT 1254
Query 1255 ATCACTGTGACCCACAAACCAGAAGAAGACACTTTTGGGGTATCCATAGCAGTTGGACTTGCTGCTTTTGCCTG 1328
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1255 ATCACTGTGACCCACAAACCAGAGGAAGACACTTTTGGGGTGTCCATAGCAGTCGGACTTGCTGCCTTTGCCTG 1328
Query 1329 TGTCCTGTTGGTGGTTCTCTTCGTCATGATCAACAAATATGGTCGACGGTCCAAATTTGGAATGAAGGGTCCCG 1402
.|||||..|||||||||||||..|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1329 CGTCCTTCTGGTGGTTCTCTTTATCATGATCAACAAGTATGGTCGCCGGTCCAAATTTGGAATGAAGGGTCCTG 1402
Query 1403 TGGCTGTCATCAGTGGTGAGGAGGACTCAGCCAGCCCACTGCACCACATCAACCACGGCATCACCACGCCCTCG 1476
|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1403 TGGCTGTTATCAGTGGAGAGGAGGACTCAGCCAGCCCACTGCATCACATCAACCATGGCATCACTACACCATCA 1476
Query 1477 TCACTGGATGCCGGGCCCGACACTGTGGTCATTGGCATGACTCGCATCCCTGTCATTGAGAACCCCCAGTACTT 1550
||..|||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 TCGTTGGATGCTGGGCCTGACACAGTGGTCATTGGCATGACCCGCATCCCAGTCATTGAGAACCCCCAGTACTT 1550
Query 1551 CCGTCAGGGACACAACTGCCACAAGCCGGACACGTATGTGCAGCACATTAAGAGGAGAGACATCGTGCTGAAGC 1624
|||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1551 CCGTCAGGGTCACAATTGCCACAAGCCAGACACATATGTTCAGCACATCAAGAGGAGAGACATCGTGTTGAAGA 1624
Query 1625 GAGAACTGGGTGAGGGAGCCTTTGGAAAGGTCTTCCTGGCCGAGTGCTACAACCTCAGCCCGACCAAGGACAAG 1698
|||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1625 GAGAATTGGGTGAGGGAGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTGGCTGAGTGCTACAATCTAAGCCCCACCAAAGACAAG 1698
Query 1699 ATGCTTGTGGCTGTGAAGGCCCTGAAGGATCCCACCCTGGCTGCCCGGAAGGATTTCCAGAGGGAGGCCGAGCT 1772
|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1699 ATGCTAGTGGCAGTGAAGGCCCTGAAGGATCCCACCTTGGCTGCCAGGAAGGATTTCCAGAGGGAGGCTGAGCT 1772
Query 1773 GCTCACCAACCTGCAGCATGAGCACATTGTCAAGTTCTATGGAGTGTGCGGCGATGGGGACCCCCTCATCATGG 1846
||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1773 GCTCACGAACCTGCAGCATGAGCATATTGTCAAGTTCTATGGGGTGTGTGGTGATGGTGACCCACTCATCATGG 1846
Query 1847 TCTTTGAATACATGAAGCATGGAGACCTGAATAAGTTCCTCAGGGCCCATGGGCCAGATGCAATGATCCTTGTG 1920
||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1847 TCTTTGAATACATGAAGCATGGAGACCTTAACAAGTTCCTCAGGGCCCATGGGCCAGATGCCATGATCCTCGTG 1920
Query 1921 GATGGACAGCCACGCCAGGCCAAGGGTGAGCTGGGGCTCTCCCAAATGCTCCACATTGCCAGTCAGATCGCCTC 1994
||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1921 GATGGACAGCCACGTCAGGCCAAGGGGGAGCTAGGGCTCTCTCAGATGCTCCACATCGCCAGTCAGATAGCCTC 1994
Query 1995 GGGTATGGTGTACCTGGCCTCCCAGCACTTTGTGCACCGAGACCTGGCCACCAGGAACTGCCTGGTTGGAGCGA 2068
|||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1995 GGGCATGGTGTACCTGGCTTCCCAGCACTTTGTACACCGGGACCTGGCCACGAGGAACTGCCTGGTTGGAGCCA 2068
Query 2069 ATCTGCTAGTGAAGATTGGGGACTTCGGCATGTCCAGAGATGTCTACAGCACGGATTATTACAGG--------- 2133
||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 2069 ATCTACTAGTGAAGATTGGAGATTTTGGCATGTCCAGGGACGTCTACAGTACTGATTACTACAGGGAAGGGCCA 2142
Query 2134 ------------------------------------------------------------------CTCTTTAA 2141
||||||||
Sbjct 2143 TGCCAGAAGGGCCCATTCAACGTGTCGTGGCAGCAGCAGAGGCTAGCAGCGTCAGCAGCTTCCACACTCTTTAA 2216
Query 2142 TCCATCTGGAAATGATTTTTGTATATGGTGTGAGGTGGGAGGACACACCATGCTCCCCATTCGCTGGATGCCTC 2215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 2217 TCCATCTGGAAATGATTTTTGTATATGGTGTGAGGTGGGAGGACACACCATGCTCCCCATCCGCTGGATGCCCC 2290
Query 2216 CTGAAAGCATCATGTACCGGAAGTTCACTACAGAGAGTGATGTATGGAGCTTCGGGGTGATCCTCTGGGAGATC 2289
||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 2291 CTGAAAGCATAATGTACCGGAAGTTCACCACAGAGAGTGATGTCTGGAGCTTCGGGGTTATTCTTTGGGAGATC 2364
Query 2290 TTCACCTATGGAAAGCAGCCATGGTTCCAACTCTCAAACACGGAGGTCATTGAGTGCATTACCCAAGGTCGTGT 2363
||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 2365 TTTACCTATGGGAAGCAACCATGGTTCCAGCTTTCCAACACGGAGGTCATTGAATGCATCACCCAAGGCCGTGT 2438
Query 2364 TTTGGAGCGGCCCCGAGTCTGCCCCAAAGAGGTGTACGATGTCATGCTGGGGTGCTGGCAGAGGGAACCACAGC 2437
.||||||.|.|||.||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2439 CTTGGAGAGACCCAGAGTCTGCCCTAAAGAAGTGTATGATGTCATGCTGGGGTGCTGGCAGAGGGAACCACAGC 2512
Query 2438 AGCGGTTGAACATCAAGGAGATCTACAAAATCCTCCATGCTTTGGGGAAGGCCACCCCAATCTACCTGGACATT 2511
|||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2513 AGCGGCTGAATATTAAGGAGATCTACAAAATCCTCCATGCTTTGGGGAAGGCCACCCCGATCTACCTGGACATT 2586
Query 2512 CTTGGC 2517
||||||
Sbjct 2587 CTTGGC 2592