Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14725
• Subject: NM_001033174.1
• Aligned Length: 2426
• Identities: 2190
• Gaps: 13

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGACGGAGCTGAGAGGAGTGGTGGGGCCAGGCCCGGCAGCCATTGCAGCACTTGGCGGCGGCGGCGC  74
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|..||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGACCGAGCTGAGAGGAGTGGTGGGGCCGGGCCCGGCAGCCATCGCGGCTCCGGGCGGCGGCGGCGC  74

Query   75  CGGTCCCCCAGTGGTGGGAGGAGGCGGCGGCCGCGGAGATGCGGGGCCAGGCTCCGGGGCCGCGTCAGGGACGG  148
            .|||||.||.|.|||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||.||||||..|||.|.|.|||| 
Sbjct   75  GGGTCCACCCGCGGTGGGAGGCGGCGGCGGACGCGGGGACGCGGGGCCCGGCCCCGGGGTGGCGGCCGCGACG-  147

Query  149  TGGTCGCGGCGGCGGCGGGAGGCCCGGGCCCGGGGGCCGGGGGAGTGGCGGC-GGCTGGCCCGGCCCCTGCGCC  221
                 ||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||| ||| |||||||.|.||||.||
Sbjct  148  -----GCGGCGACGGCGGGCGGCCCGGGCCCCGGGGCCGGAGGAGTGGCGGCAGGC-GGCCCGGGCTCTGCACC  215

Query  222  GCCGACTGGGGGCTCGGGCGGCTCGGGCGCTGGGGGTTCGGGCTCGGCTCGAGAGGGCTGGCTCTTCAAATGGA  295
            |||..|.|.||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  GCCAGCCGCGGGCTCGGGCGGTTCGGGCGCCGGGGGCTCGGGCTCGGCTAGAGAGGGCTGGCTCTTCAAATGGA  289

Query  296  CCAATTATATCAAAGGCTACCAGCGGCGATGGTTCGTGCTGAGCAACGGGCTCCTGAGCTACTACAGATCAAAG  369
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  290  CCAATTACATCAAAGGCTACCAGCGGCGATGGTTCGTGCTGAGCAACGGGCTCCTAAGCTACTACAGGTCCAAG  363

Query  370  GCAGAAATGAGACATACCTGCCGTGGTACCATCAACCTCGCCACAGCCAACATCACCGTGGAGGACTCCTGCAA  443
            |||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  364  GCAGAGATGAGACACACCTGCCGAGGTACCATCAACCTCGCCACAGCCAACATCACTGTGGAGGACTCTTGCAA  437

Query  444  CTTCATCATTTCCAATGGGGGTGCTCAGACCTACCATCTGAAAGCTAGTTCAGAAGTTGAGCGGCAGCGCTGGG  517
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||..||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  438  CTTCATCATCTCCAATGGCGGTGCTCAGACCTACCACTTGAAGGCCAGCTCCGAAGTAGAGCGTCAGCGCTGGG  511

Query  518  TGACGGCCCTGGAACTGGCCAAGGCCAAAGCTGGTGAAGATGCTGGCAGAGTCAGATGAATCAGGAGATGAAGA  591
            ||||.|||.|.|||||||||||||||||.||| ||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  512  TGACAGCCTTAGAACTGGCCAAGGCCAAGGCT-GTGAAGATGCTGGCCGAATCAGATGACTCAGGAGATGAAGA  584

Query  592  GTCTGTCTCACAAACTGACAAGACTGAGCTGCAGAATACCCTTCGGACCCTCTCTAGCAAAGTAGAGGACTTGA  665
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||..|||||.||.||.|||||.||||||||.||||||.|.|
Sbjct  585  GTCTGTCTCACAGACTGACAAGACCGAGCTCCAGAGCACCCTGCGAACACTCTCCAGCAAAGTGGAGGACCTCA  658

Query  666  GCACGTGCAATGACTTGATAGCTAAGCATGGCACAGCTCTGCAGCGTTCTCTCAGTGAGCTGGAGTCCCTGAAG  739
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  GCACGTGCAACGACTTGATAGCTAAGCATGGCACCGCCCTGCAGCGTTCCCTCAGTGAGCTGGAGTCCCTGAAG  732

Query  740  TTGCCTGCTGAGAGCAATGAAAAGATCAAACAGGTCAACGAACGAGCCACACTCTTTAGGATAACATCCAATGC  813
            .|||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  733  CTGCCTGCTGAGAGCAATGAGAAAATCAAGCAGGTCAATGAACGAGCCACGCTTTTTAGGATAACATCCAATGC  806

Query  814  CATGATCAACGCCTGCAGAGATTTCCTCATGTTAGCCCAGACCCATAGTAAAAAATGGCAAAAGTCACTACAGT  887
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  807  CATGATCAATGCTTGCAGAGATTTCCTCATGTTAGCCCAGACACACAGTAAGAAGTGGCAGAAGTCACTACAGT  880

Query  888  ATGAAAGAGACCAGCGTATCCGACTGGAAGAAACCCTCGAGCAGCTGGCGAAGCAGCATAATCACCTGGAGAGG  961
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  881  ATGAAAGAGACCAGCGAATCCGACTGGAAGAAACTCTTGAGCAGCTGGCAAAGCAGCACAATCACCTGGAGAGA  954

Query  962  GCCTTCCGAGGAGCCACGGTGCTGCCGGCAAACACTCCTGGCAATG-TGGGTTCTGGTAAAGATCAGTGCTGCT  1034
            ||||||||.||||||||.||||||||.||||||.||||.||||..| |||| ||||||||||||||||||||.|
Sbjct  955  GCCTTCCGGGGAGCCACAGTGCTGCCAGCAAACCCTCCGGGCAGCGCTGGG-TCTGGTAAAGATCAGTGCTGTT  1027

Query 1035  CTGGCAAAGGGGACATGAGCGATGAAGATGATGAGAATGAATTTTTTGATGCACCTGAGATCATCACCATGCCT  1108
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1028  CTGGCAAAGGGGACATGAGCGATGAAGATGACGAGAATGAGTTTTTTGATGCACCAGAGATTATCACCATGCCT  1101

Query 1109  GAAAATTTGGGCCACAAACGTACTGGCAGCAATATCAGTGGAGCCAGCAGTGACATCAGCCTTGATGAACAGTA  1182
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct 1102  GAAAATTTGGGCCACAAACGTACTGGCAGCAATATCAGTGGGGCCAGCAGTGATGTCAGCCTTGATGAACAGTA  1175

Query 1183  CAAGCATCAGCTGGAGGAGACCAAAAAGGAAAAGAGAACCAGAATACCATACAAGCCAAACTATAGCCTCAATT  1256
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1176  CAAGCATCAGCTGGAGGAGACCAAGAAGGAAAAGAGAACCAGAATACCATATAAGCCAAACTACAGCCTCAACT  1249

Query 1257  TATGGAGCATCATGAAGAACTGCATTGGAAAAGAACTCTCTAAGATCCCCATGCCGGTAAACTTTAATGAGCCC  1330
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  TGTGGAGCATCATGAAGAACTGCATTGGAAAGGAGCTCTCTAAGATCCCAATGCCGGTAAACTTTAATGAGCCC  1323

Query 1331  TTGTCCATGCTTCAGCGCCTTACTGAAGATCTGGAATACCATGAGCTGTTAGACCGAGCTGCAAAATGTGAGAA  1404
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||
Sbjct 1324  TTGTCCATGCTTCAGCGCCTTACTGAAGATCTGGAGTACCATGAGCTGTTAGACAGAGCTGCAAAGTGTGAGAA  1397

Query 1405  TTCTCTAGAACAGCTCTGTTATGTTGCAGCTTTCACCGTGTCCTCCTACTCCACTACTGTCTTCCGCACCAGTA  1478
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1398  CTCTCTAGAACAGCTCTGCTATGTTGCAGCCTTCACTGTTTCCTCCTATTCCACTACCGTCTTCCGAACCAGCA  1471

Query 1479  AGCCATTCAACCCACTGCTTGGGGAGACCTTTGAGCTGGACCGATTAGAGGAGAATGGGTACCGATCCCTCTGT  1552
            |||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|.||||||||||||||.||.|||.|||||
Sbjct 1472  AGCCATTCAACCCTCTCCTTGGGGAGACATTTGAACTGGACCGACTGGAGGAGAATGGGTATCGGTCCATCTGT  1545

Query 1553  GAACAGGTGAGTCATCATCCCCCTGCTGACTGCGCACCATGCTGAGTCCAAAAATGGCTGGACATTGCGTCAGG  1626
            ||.||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  GAGCAGGTGAGTCATCATCCCCCTGCTG-CTGCGCACCATGCTGAATCCAAAAATGGCTGGACATTGCGTCAGG  1618

Query 1627  AAATCAAAATCACCAGCAAGTTTCGAGGCAAATACCTCTCCATTATGCCCCTCGGTACCATTCATTGTATTTTC  1700
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||
Sbjct 1619  AAATTAAAATCACCAGCAAGTTTCGAGGCAAATACCTCTCCATTATGCCCCTTGGTACTATCCACTGCATTTTC  1692

Query 1701  CATGCAACTGGGCTACCACTACACTTGGAAGAAAGTTACCACAACTGTACACAACATTATTGTGGGCAAGTTGT  1774
            ||..||||||||| ||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693  CACTCAACTGGGC-ACCATTACACTTGGAAAAAAGTTACCACAACAGTACACAACATTATTGTGGGCAAGTTGT  1765

Query 1775  GGATAGATCAGTCTGGCGAAATTGATATTGTGAATCACAAGACAGGAGACAAGTGTAATCTTAAATTTGTTCCT  1848
            ||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766  GGATAGATCAGTCTGGTGAGATTGACATTGTAAATCACAAGACAGGAGACAAGTGTAATCTTAAATTTGTTCCT  1839

Query 1849  TATAGCTACTTCTCTCGGGATGTAGCAAGAAAGGTGACGGGGGAAGTGACAGATCCATCAGGAAAAGTCCACTT  1922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1840  TATAGCTACTTCTCTCGGGATGTAGCAAGAAAGGTGACAGGTGAAGTGACAGACCCATCAGGAAAAGTTCACTT  1913

Query 1923  TGCTCTTCTGGGGACGTGGGATGAGAAAATGGAATGTTTCAAAGTACAGCCAGTCATTGGGGAAAATGGGGGTG  1996
            |||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||.|...|||||.||||||||||
Sbjct 1914  TGCCCTCCTGGGGACATGGGATGAGAAAATGGATTGTTTCAAAGTACAGGCAGCCTCCGGGGAGAATGGGGGTG  1987

Query 1997  ATGCTCGACAGAGAGGCCATGAAGCAGAGGAAAGCAGGGTCATGCTGTGGAAAAGGAATCCTTTACCGAAGAAT  2070
            |||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1988  ATGCTCGGCAGAGAGGCCATGAAGCAGAAGACAGCAGGGTCATGCTGTGGAAGAGGAACCCATTACCGAAGAAT  2061

Query 2071  GCAGAAAACATGTACTACTTCTCAGAGCTTGCTCTGACTCTCAATGCTTGGGAAAGTGGCACTGCCCCCACAGA  2144
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.||
Sbjct 2062  GCAGAGAACATGTACTACTTCTCAGAGCTTGCCCTCACTCTCAATGCCTGGGAAGGTGGCACTGCTCCCACGGA  2135

Query 2145  CAGCCGGTTACGACCTGACCAGAGACTGATGGAAAATGGACGCTGGGATGAAGCAAATGCGGAGAAGCAGCGCC  2218
            |||||||.|.||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2136  CAGCCGGCTGCGGCCCGACCAGAGACTCATGGAAAACGGGCGTTGGGATGAAGCAAATGCTGAGAAGCAGCGCC  2209

Query 2219  TGGAGGAAAAACAAAGACTTTCCAGAAAGAAGAGAGAAGCGGAAGCTATGAAAGCCACAGAGGATGGCACACCA  2292
            |||||||.|||||..|.||||||||.||||||||||||||.||||||..|||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2210  TGGAGGAGAAACAGCGGCTTTCCAGGAAGAAGAGAGAAGCAGAAGCTGCGAAAGCCACGGAAGATGGCACACCA  2283

Query 2293  TATGATCCCTATAAGGCACTGTGGTTTGAGCGGAAGAAGGACCCTGTTACCAAGGAGTTAACCCATATTTATAG  2366
            .||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct 2284  CATGACCCCTATAAAGCACTGTGGTTTGAGCGGAAGAAGGACCCTGTCACCAGGGAGCTAACCCATATTTATAG  2357

Query 2367  GGGAGAATACTGGGAGTGTAAAGAAAAACAGGACTGGAGCTCATGCCCGGACATTTTC  2424
            .||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||.|.||.|||||.||.||||||
Sbjct 2358  TGGCGAGTACTGGGAATGTAAGGAAAAGCAGGACTGGGGTTCTTGCCCAGATATTTTC  2415