Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14725
• Subject: NM_002556.3
• Aligned Length: 2424
• Identities: 2421
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGACGGAGCTGAGAGGAGTGGTGGGGCCAGGCCCGGCAGCCATTGCAGCACTTGGCGGCGGCGGCGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGACGGAGCTGAGAGGAGTGGTGGGGCCAGGCCCGGCAGCCATTGCAGCACTTGGCGGCGGCGGCGC  74

Query   75  CGGTCCCCCAGTGGTGGGAGGAGGCGGCGGCCGCGGAGATGCGGGGCCAGGCTCCGGGGCCGCGTCAGGGACGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGTCCCCCAGTGGTGGGAGGAGGCGGCGGCCGCGGAGATGCGGGGCCAGGCTCCGGGGCCGCGTCAGGGACGG  148

Query  149  TGGTCGCGGCGGCGGCGGGAGGCCCGGGCCCGGGGGCCGGGGGAGTGGCGGCGGCTGGCCCGGCCCCTGCGCCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGTCGCGGCGGCGGCGGGAGGCCCGGGCCCGGGGGCCGGGGGAGTGGCGGCGGCTGGCCCGGCCCCTGCGCCG  222

Query  223  CCGACTGGGGGCTCGGGCGGCTCGGGCGCTGGGGGTTCGGGCTCGGCTCGAGAGGGCTGGCTCTTCAAATGGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCGACTGGGGGCTCGGGCGGCTCGGGCGCTGGGGGTTCGGGCTCGGCTCGAGAGGGCTGGCTCTTCAAATGGAC  296

Query  297  CAATTATATCAAAGGCTACCAGCGGCGATGGTTCGTGCTGAGCAACGGGCTCCTGAGCTACTACAGATCAAAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAATTATATCAAAGGCTACCAGCGGCGATGGTTCGTGCTGAGCAACGGGCTCCTGAGCTACTACAGATCAAAGG  370

Query  371  CAGAAATGAGACATACCTGCCGTGGTACCATCAACCTCGCCACAGCCAACATCACCGTGGAGGACTCCTGCAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGAAATGAGACATACCTGCCGTGGTACCATCAACCTCGCCACAGCCAACATCACCGTGGAGGACTCCTGCAAC  444

Query  445  TTCATCATTTCCAATGGGGGTGCTCAGACCTACCATCTGAAAGCTAGTTCAGAAGTTGAGCGGCAGCGCTGGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCATCATTTCCAATGGGGGTGCTCAGACCTACCATCTGAAAGCTAGTTCAGAAGTTGAGCGGCAGCGCTGGGT  518

Query  519  GACGGCCCTGGAACTGGCCAAGGCCAAAGCTGGTGAAGATGCTGGCAGAGTCAGATGAATCAGGAGATGAAGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACGGCCCTGGAACTGGCCAAGGCCAAAGCT-GTGAAGATGCTGGCAGAGTCAGATGAATCAGGAGATGAAGAG  591

Query  593  TCTGTCTCACAAACTGACAAGACTGAGCTGCAGAATACCCTTCGGACCCTCTCTAGCAAAGTAGAGGACTTGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  TCTGTCTCACAAACTGACAAGACTGAGCTGCAGAATACCCTTCGGACCCTCTCTAGCAAAGTAGAGGACTTGAG  665

Query  667  CACGTGCAATGACTTGATAGCTAAGCATGGCACAGCTCTGCAGCGTTCTCTCAGTGAGCTGGAGTCCCTGAAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  CACGTGCAATGACTTGATAGCTAAGCATGGCACAGCTCTGCAGCGTTCTCTCAGTGAGCTGGAGTCCCTGAAGT  739

Query  741  TGCCTGCTGAGAGCAATGAAAAGATCAAACAGGTCAACGAACGAGCCACACTCTTTAGGATAACATCCAATGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  TGCCTGCTGAGAGCAATGAAAAGATCAAACAGGTCAACGAACGAGCCACACTCTTTAGGATAACATCCAATGCC  813

Query  815  ATGATCAACGCCTGCAGAGATTTCCTCATGTTAGCCCAGACCCATAGTAAAAAATGGCAAAAGTCACTACAGTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  ATGATCAACGCCTGCAGAGATTTCCTCATGTTAGCCCAGACCCATAGTAAAAAATGGCAAAAGTCACTACAGTA  887

Query  889  TGAAAGAGACCAGCGTATCCGACTGGAAGAAACCCTCGAGCAGCTGGCGAAGCAGCATAATCACCTGGAGAGGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  TGAAAGAGACCAGCGTATCCGACTGGAAGAAACCCTCGAGCAGCTGGCGAAGCAGCATAATCACCTGGAGAGGG  961

Query  963  CCTTCCGAGGAGCCACGGTGCTGCCGGCAAACACTCCTGGCAATGTGGGTTCTGGTAAAGATCAGTGCTGCTCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  CCTTCCGAGGAGCCACGGTGCTGCCGGCAAACACTCCTGGCAATGTGGGTTCTGGTAAAGATCAGTGCTGCTCT  1035

Query 1037  GGCAAAGGGGACATGAGCGATGAAGATGATGAGAATGAATTTTTTGATGCACCTGAGATCATCACCATGCCTGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GGCAAAGGGGACATGAGCGATGAAGATGATGAGAATGAATTTTTTGATGCACCTGAGATCATCACCATGCCTGA  1109

Query 1111  AAATTTGGGCCACAAACGTACTGGCAGCAATATCAGTGGAGCCAGCAGTGACATCAGCCTTGATGAACAGTACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  AAATTTGGGCCACAAACGTACTGGCAGCAATATCAGTGGAGCCAGCAGTGACATCAGCCTTGATGAACAGTACA  1183

Query 1185  AGCATCAGCTGGAGGAGACCAAAAAGGAAAAGAGAACCAGAATACCATACAAGCCAAACTATAGCCTCAATTTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  AGCATCAGCTGGAGGAGACCAAAAAGGAAAAGAGAACCAGAATACCATACAAGCCAAACTATAGCCTCAATTTA  1257

Query 1259  TGGAGCATCATGAAGAACTGCATTGGAAAAGAACTCTCTAAGATCCCCATGCCGGTAAACTTTAATGAGCCCTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  TGGAGCATCATGAAGAACTGCATTGGAAAAGAACTCTCTAAGATCCCCATGCCGGTAAACTTTAATGAGCCCTT  1331

Query 1333  GTCCATGCTTCAGCGCCTTACTGAAGATCTGGAATACCATGAGCTGTTAGACCGAGCTGCAAAATGTGAGAATT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  GTCCATGCTTCAGCGCCTTACTGAAGATCTGGAATACCATGAGCTGTTAGACCGAGCTGCAAAATGTGAGAATT  1405

Query 1407  CTCTAGAACAGCTCTGTTATGTTGCAGCTTTCACCGTGTCCTCCTACTCCACTACTGTCTTCCGCACCAGTAAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  CTCTAGAACAGCTCTGTTATGTTGCAGCTTTCACCGTGTCCTCCTACTCCACTACTGTCTTCCGCACCAGTAAG  1479

Query 1481  CCATTCAACCCACTGCTTGGGGAGACCTTTGAGCTGGACCGATTAGAGGAGAATGGGTACCGATCCCTCTGTGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  CCATTCAACCCACTGCTTGGGGAGACCTTTGAGCTGGACCGATTAGAGGAGAATGGGTACCGATCCCTCTGTGA  1553

Query 1555  ACAGGTGAGTCATCATCCCCCTGCTGACTGCGCACCATGCTGAGTCCAAAAATGGCTGGACATTGCGTCAGGAA  1628
            |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  ACAGGTGAGTCATCATCCCCCTGCTG-CTGCGCACCATGCTGAGTCCAAAAATGGCTGGACATTGCGTCAGGAA  1626

Query 1629  ATCAAAATCACCAGCAAGTTTCGAGGCAAATACCTCTCCATTATGCCCCTCGGTACCATTCATTGTATTTTCCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627  ATCAAAATCACCAGCAAGTTTCGAGGCAAATACCTCTCCATTATGCCCCTCGGTACCATTCATTGTATTTTCCA  1700

Query 1703  TGCAACTGGGCTACCACTACACTTGGAAGAAAGTTACCACAACTGTACACAACATTATTGTGGGCAAGTTGTGG  1776
            ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701  TGCAACTGGGC-ACCACTACACTTGGAAGAAAGTTACCACAACTGTACACAACATTATTGTGGGCAAGTTGTGG  1773

Query 1777  ATAGATCAGTCTGGCGAAATTGATATTGTGAATCACAAGACAGGAGACAAGTGTAATCTTAAATTTGTTCCTTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  ATAGATCAGTCTGGCGAAATTGATATTGTGAATCACAAGACAGGAGACAAGTGTAATCTTAAATTTGTTCCTTA  1847

Query 1851  TAGCTACTTCTCTCGGGATGTAGCAAGAAAGGTGACGGGGGAAGTGACAGATCCATCAGGAAAAGTCCACTTTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848  TAGCTACTTCTCTCGGGATGTAGCAAGAAAGGTGACGGGGGAAGTGACAGATCCATCAGGAAAAGTCCACTTTG  1921

Query 1925  CTCTTCTGGGGACGTGGGATGAGAAAATGGAATGTTTCAAAGTACAGCCAGTCATTGGGGAAAATGGGGGTGAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922  CTCTTCTGGGGACGTGGGATGAGAAAATGGAATGTTTCAAAGTACAGCCAGTCATTGGGGAAAATGGGGGTGAT  1995

Query 1999  GCTCGACAGAGAGGCCATGAAGCAGAGGAAAGCAGGGTCATGCTGTGGAAAAGGAATCCTTTACCGAAGAATGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  GCTCGACAGAGAGGCCATGAAGCAGAGGAAAGCAGGGTCATGCTGTGGAAAAGGAATCCTTTACCGAAGAATGC  2069

Query 2073  AGAAAACATGTACTACTTCTCAGAGCTTGCTCTGACTCTCAATGCTTGGGAAAGTGGCACTGCCCCCACAGACA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  AGAAAACATGTACTACTTCTCAGAGCTTGCTCTGACTCTCAATGCTTGGGAAAGTGGCACTGCCCCCACAGACA  2143

Query 2147  GCCGGTTACGACCTGACCAGAGACTGATGGAAAATGGACGCTGGGATGAAGCAAATGCGGAGAAGCAGCGCCTG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144  GCCGGTTACGACCTGACCAGAGACTGATGGAAAATGGACGCTGGGATGAAGCAAATGCGGAGAAGCAGCGCCTG  2217

Query 2221  GAGGAAAAACAAAGACTTTCCAGAAAGAAGAGAGAAGCGGAAGCTATGAAAGCCACAGAGGATGGCACACCATA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218  GAGGAAAAACAAAGACTTTCCAGAAAGAAGAGAGAAGCGGAAGCTATGAAAGCCACAGAGGATGGCACACCATA  2291

Query 2295  TGATCCCTATAAGGCACTGTGGTTTGAGCGGAAGAAGGACCCTGTTACCAAGGAGTTAACCCATATTTATAGGG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292  TGATCCCTATAAGGCACTGTGGTTTGAGCGGAAGAAGGACCCTGTTACCAAGGAGTTAACCCATATTTATAGGG  2365

Query 2369  GAGAATACTGGGAGTGTAAAGAAAAACAGGACTGGAGCTCATGCCCGGACATTTTC  2424
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366  GAGAATACTGGGAGTGTAAAGAAAAACAGGACTGGAGCTCATGCCCGGACATTTTC  2421