Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14741
- Subject:
- XM_024450296.1
- Aligned Length:
- 1668
- Identities:
- 1206
- Gaps:
- 462
Alignment
Query 1 ATGGCCAGGACCACCAGCCAGCTGTATGACGCCGTGCCCATCCAGTCCAGCGTGGTGTTATGTTCCTGCCCATC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCCATCAATGGTGAGGACCCAGACTGAGTCCAGCACGCCCCCTGGCATTCCTGGTGGCAGCAGGCAGGGCCCCG 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------ATGGTGAGGACCCAGACTGAGTCCAGCACGCCCCCTGGCATTCCTGGTGGCAGCAGGCAGGGCCCCG 67
Query 149 CCATGGACGGCACTGCAGCCGAGCCTCGGCCCGGCGCCGGCTCCCTGCAGCATGCCCAGCCTCCGCCGCAGCCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 CCATGGACGGCACTGCAGCCGAGCCTCGGCCCGGCGCCGGCTCCCTGCAGCATGCCCAGCCTCCGCCGCAGCCT 141
Query 223 CGGAAGAAGCGGCCTGAGGACTTCAAGTTTGGGAAAATCCTTGGGGAAGGCTCTTTTTCCACGGTTGTCCTGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 CGGAAGAAGCGGCCTGAGGACTTCAAGTTTGGGAAAATCCTTGGGGAAGGCTCTTTTTCCACGGTTGTCCTGGC 215
Query 297 TCGAGAACTGGCAACCTCCAGAGAATATGCGA------------------------------------------ 328
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 TCGAGAACTGGCAACCTCCAGAGAATATGCGATTAAAATTCTGGAGAAGCGACATATCATAAAAGAGAACAAGG 289
Query 329 -------------------------------------------------------------------------- 328
Sbjct 290 TCCCCTATGTAACCAGAGAGCGGGATGTCATGTCGCGCCTGGATCACCCCTTCTTTGTTAAGCTTTACTTCACA 363
Query 329 -------------------------------------------------------------------------- 328
Sbjct 364 TTTCAGGACGACGAGAAGCTGTATTTCGGCCTTAGTTATGCCAAAAATGGAGAACTACTTAAATATATTCGCAA 437
Query 329 -------------------------------------------------------------------------- 328
Sbjct 438 AATCGGTTCATTCGATGAGACCTGTACCCGATTTTACACGGCTGAGATTGTGTCTGCTTTAGAGTACTTGCACG 511
Query 329 -------------------------------------------------------------------------- 328
Sbjct 512 GCAAGGGCATCATTCACAGGGACCTTAAACCGGAAAACATTTTGTTAAATGAAGATATGCACATCCAGATCACA 585
Query 329 -------------------------------------------CCAGGGCCAACTCATTCGTGGGAACAGCGCA 359
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 GATTTTGGAACAGCAAAAGTCTTATCCCCAGAGAGCAAACAAGCCAGGGCCAACTCATTCGTGGGAACAGCGCA 659
Query 360 GTACGTTTCTCCAGAGCTGCTCACGGAGAAGTCCGCCTGTAAGAGTTCAGACCTTTGGGCTCTTGGATGCATAA 433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 GTACGTTTCTCCAGAGCTGCTCACGGAGAAGTCCGCCTGTAAGAGTTCAGACCTTTGGGCTCTTGGATGCATAA 733
Query 434 TATACCAGCTTGTGGCAGGACTCCCACCATTCCGAGCTGGAAACGAGTATCTTATATTTCAGAAGATCATTAAG 507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 TATACCAGCTTGTGGCAGGACTCCCACCATTCCGAGCTGGAAACGAGTATCTTATATTTCAGAAGATCATTAAG 807
Query 508 TTGGAATATGACTTTCCAGAAAAATTCTTCCCTAAGGCAAGAGACCTCGTGGAGAAACTTTTGGTTTTAGATGC 581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 TTGGAATATGACTTTCCAGAAAAATTCTTCCCTAAGGCAAGAGACCTCGTGGAGAAACTTTTGGTTTTAGATGC 881
Query 582 CACAAAGCGGTTAGGCTGTGAGGAAATGGAAGGATACGGACCTCTTAAAGCACACCCGTTCTTCGAGTCCGTCA 655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 CACAAAGCGGTTAGGCTGTGAGGAAATGGAAGGATACGGACCTCTTAAAGCACACCCGTTCTTCGAGTCCGTCA 955
Query 656 CGTGGGAGAACCTGCACCAGCAGACGCCTCCGAAGCTCACCGCTTACCTGCCGGCTATGTCGGAAGACGACGAG 729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 CGTGGGAGAACCTGCACCAGCAGACGCCTCCGAAGCTCACCGCTTACCTGCCGGCTATGTCGGAAGACGACGAG 1029
Query 730 GACTGCTATGGCAATTATGACAATCTCCTGAGCCAGTTTGGCTGCATGCAGGTGTCTTCGTCCTCCTCCTCACA 803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 GACTGCTATGGCAATTATGACAATCTCCTGAGCCAGTTTGGCTGCATGCAGGTGTCTTCGTCCTCCTCCTCACA 1103
Query 804 CTCCCTGTCAGCCTCCGACACGGGCCTGCCCCAGAGGTCAGGCAGCAACATAGAGCAGTACATTCACGATCTGG 877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 CTCCCTGTCAGCCTCCGACACGGGCCTGCCCCAGAGGTCAGGCAGCAACATAGAGCAGTACATTCACGATCTGG 1177
Query 878 ACTCGAACTCCTTTGAACTGGACTTACAGTTTTCCGAAGATGAGAAGAGGTTGTTGTTGGAGAAGCAGGCTGGC 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 ACTCGAACTCCTTTGAACTGGACTTACAGTTTTCCGAAGATGAGAAGAGGTTGTTGTTGGAGAAGCAGGCTGGC 1251
Query 952 GGAAACCCTTGGCACCAGTTTGTAGAAAATAATTTAATACTAAAGATGGGCCCAGTGGATAAGCGGAAGGGTTT 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 GGAAACCCTTGGCACCAGTTTGTAGAAAATAATTTAATACTAAAGATGGGCCCAGTGGATAAGCGGAAGGGTTT 1325
Query 1026 ATTTGCAAGACGACGACAGCTGTTGCTCACAGAAGGACCACATTTATATTATGTGGATCCTGTCAACAAAGTTC 1099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326 ATTTGCAAGACGACGACAGCTGTTGCTCACAGAAGGACCACATTTATATTATGTGGATCCTGTCAACAAAGTTC 1399
Query 1100 TGAAAGGTGAAATTCCTTGGTCACAAGAACTTCGACCAGAGGCCAAGAATTTTAAAACTTTCTTTGTCCACACG 1173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400 TGAAAGGTGAAATTCCTTGGTCACAAGAACTTCGACCAGAGGCCAAGAATTTTAAAACTTTCTTTGTCCACACG 1473
Query 1174 CCTAACAGGACGTATTATCTGATGGACCCCAGCGGGAACGCACACAAGTGGTGCAGGAAGATCCAGGAGGTTTG 1247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 CCTAACAGGACGTATTATCTGATGGACCCCAGCGGGAACGCACACAAGTGGTGCAGGAAGATCCAGGAGGTTTG 1547
Query 1248 GAGGCAGCGATACCAGAGCCACCCGGACGCCGCTGTGCAG 1287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 GAGGCAGCGATACCAGAGCCACCCGGACGCCGCTGTGCAG 1587
