Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14753
• Subject: NM_000293.3
• Aligned Length: 3305
• Identities: 3198
• Gaps: 73

Alignment

Query    1  ATGGCCTG----------CTCAC------------CTGATGCAGTCGTCT------------CTCCGTCTTC--  38
            |||||..|          |||||            |||  |.||  ||||            |||.|.|  |  
Sbjct    1  ATGGCGGGGGCGGCGGGACTCACGGCAGAAGTGAGCTG--GAAG--GTCTTGGAGCGAAGAGCTCGGAC--CAA  68

Query   39  -CGCTTTCTTAAGGTCTGGCTCAGTTTATGAACCTCTTAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACT  111
             |||          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   69  GCGC----------TCAGGCTCAGTTTATGAACCTCTTAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACT  132

Query  112  CTCTGGGATAAGTTGGACCATTATTACAGAATTGTCAAGTCAACATTGCTGCTGTATCAAAGTCCAACTACCGG  185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  133  CTCTGGGATAAGTTGGACCATTATTACAGAATTGTCAAGTCAACATTGCTGCTGTATCAAAGTCCAACTACCGG  206

Query  186  TCTCTTTCCCACTAAAACATGCGGTGGTGACCAGAAGGCCAAGATCCAGGACAGCCTATACTGCGCTGCTGGGG  259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  207  TCTCTTTCCCACTAAAACATGCGGTGGTGACCAGAAGGCCAAGATCCAGGACAGCCTATACTGCGCTGCTGGGG  280

Query  260  CCTGGGCTTTGGCTCTTGCATACAGGCGAATTGATGACGACAAGGGAAGGACCCATGAGCTGGAGCACTCAGCT  333
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  281  CCTGGGCTTTGGCTCTTGCATACAGGCGAATTGATGATGACAAGGGAAGGACCCATGAGCTGGAGCACTCAGCT  354

Query  334  ATAAAATGCATGAGAGGAATTCTCTACTGCTATATGCGTCAGGCCGATAAGGTCCAGCAGTTTAAGCAGGATCC  407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  355  ATAAAATGCATGAGAGGAATTCTCTACTGCTATATGCGTCAGGCCGATAAGGTCCAGCAGTTTAAGCAGGATCC  428

Query  408  ACGCCCAACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAATGTGCATACAGGAGATGAGTTGCTTTCCTATGAGGAATATG  481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  429  ACGCCCAACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAATGTGCATACAGGAGATGAGTTGCTTTCCTATGAGGAATATG  502

Query  482  GTCATCTTCAGATAAATGCAGTGTCACTTTATCTCCTTTACCTTGTGGAAATGATTTCCTCAGGACTCCAGATT  555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  503  GTCATCTTCAGATAAATGCAGTGTCACTTTATCTCCTTTACCTTGTGGAAATGATTTCCTCAGGACTCCAGATT  576

Query  556  ATCTACAACACTGATGAGGTCTCTTTTATTCAAAACCTTGTATTTTGTGTGGAAAGAGTTTACCGTGTGCCTGA  629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  577  ATCTACAACACTGATGAGGTCTCTTTTATTCAAAACCTTGTATTTTGTGTGGAAAGAGTTTACCGTGTGCCTGA  650

Query  630  CTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAATAATGGCAGCACAGAGCTACATTCGAGCTCGGTTGGTTTAG  703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  651  CTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAATAATGGCAGCACAGAGCTACATTCGAGCTCGGTTGGTTTAG  724

Query  704  CAAAAGCAGCTCTAGAAGCAATTAATGGATTCAACCTTTTTGGCAACCAGGGCTGTTCGTGGTCAGTTATATTT  777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  725  CAAAAGCAGCTCTAGAAGCAATTAATGGATTCAACCTTTTTGGCAACCAGGGCTGTTCGTGGTCAGTTATATTT  798

Query  778  GTGGATCTCGATGCTCACAATCGCAACAGGCAAACTTTGTGCTCGCTGTTACCCAGAGAATCAAGATCACATAA  851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  GTGGATCTCGATGCTCACAATCGCAACAGGCAAACTTTGTGCTCGCTGTTACCCAGAGAATCAAGATCACATAA  872

Query  852  TACAGATGATGGCCTGCTCACCTGCATCAGTTATCCTGCATTTGCCCTGGATGATGAAGTTCTTTTTAGCCAGA  925
            ||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  TACAGATGCTGCCCTGCTCCCCTGCATCAGTTATCCTGCATTTGCCCTGGATGATGAAGTTCTTTTTAGCCAGA  946

Query  926  CACTTGATAAAGTGGTTAGAAAATTAAAAGGAAAATATGGATTTAAACGTTTCTTGAGAGATGGGTATAGAACA  999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  947  CACTTGATAAAGTGGTTAGAAAATTAAAAGGAAAATATGGATTTAAACGTTTCTTGAGAGATGGGTATAGAACA  1020

Query 1000  TCATTGGAAGATCCCAACAGATGCTACTACAAGCCAGCTGAAATTAAGCTATTTGATGGCATTGAATGTGAATT  1073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  TCATTGGAAGATCCCAACAGATGCTACTACAAGCCAGCTGAAATTAAGCTATTTGATGGCATTGAATGTGAATT  1094

Query 1074  TCCCATATTTTTCCTTTATATGATGATTGATGGAGTTTTTAGAGGCAATCCTAAGCAAGTACAGGAATATCAGG  1147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095  TCCCATATTTTTCCTTTATATGATGATTGATGGAGTTTTTAGAGGCAATCCTAAGCAAGTACAGGAATATCAGG  1168

Query 1148  ATCTTTTGACTCCAGTACTTCATCATACCACAGAAGGATATCCTGTTGTACCAAAGTACTATTATGTGCCAGCT  1221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169  ATCTTTTGACTCCAGTACTTCATCATACCACAGAAGGATATCCTGTTGTACCAAAGTACTATTATGTGCCAGCT  1242

Query 1222  GACTTTGTAGAATATGAAAAAAATAACCCTGGTAGTCAAAAACGATTTCCTAGCAACTGTGGCCGTGATGGAAA  1295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243  GACTTTGTAGAATATGAAAAAAATAACCCTGGTAGTCAAAAACGATTTCCTAGCAACTGTGGCCGTGATGGAAA  1316

Query 1296  ACTGTTTCTTTGGGGACAAGCACTTTATATCATCGCAAAACTCCTGGCTGATGAACTTATTAGTCCTAAAGACA  1369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317  ACTGTTTCTTTGGGGACAAGCACTTTATATCATCGCAAAACTCCTGGCTGATGAACTTATTAGTCCTAAAGACA  1390

Query 1370  TTGATCCTGTCCAGCGCTATGTCCCACTAAAGGATCAACGTAACGTGAGCATGAGGTTTTCCAATCAGGGCCCA  1443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391  TTGATCCTGTCCAGCGCTATGTCCCACTAAAGGATCAACGTAACGTGAGCATGAGGTTTTCCAATCAGGGCCCA  1464

Query 1444  CTGGAAAATGACTTGGTAGTTCATGTGGCACTTATAGCAGAAAGCCAAAGACTTCAAGTTTTTCTGAACACATA  1517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465  CTGGAAAATGACTTGGTAGTTCATGTGGCACTTATAGCAGAAAGCCAAAGACTTCAAGTTTTTCTGAACACATA  1538

Query 1518  TGGTATTCAAACTCAAACTCCTCAACAAGTAGAACCCATTCAGATATGGCCTCAGCAGGAGCTTGTGAAAGCTT  1591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1539  TGGTATTCAAACTCAAACTCCTCAACAAGTAGAACCCATTCAGATATGGCCTCAGCAGGAGCTTGTGAAAGCTT  1612

Query 1592  ATTTGCAGCTGGGTATCAATGAAAAGTTAGGACTCTCTGGAAGGCCAGACAGGCCCATTGGCTGCCTCGGGACA  1665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613  ATTTGCAGCTGGGTATCAATGAAAAGTTAGGACTCTCTGGAAGGCCAGACAGGCCCATTGGCTGCCTCGGGACA  1686

Query 1666  TCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTTGTTACCCGATTATTTTCGACCTAAGTGATTTCTACAT  1739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1687  TCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTTGTTACCCGATTATTTTCGACCTAAGTGATTTCTACAT  1760

Query 1740  GTCTCAGGATGTTTTCCTGCTGATAGATGACATAAAGAATGCGCTGCAGTTCATTAAACAATATTGGAAAATGC  1813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1761  GTCTCAGGATGTTTTCCTGCTGATAGATGACATAAAGAATGCGCTGCAGTTCATTAAACAATATTGGAAAATGC  1834

Query 1814  ATGGACGTCCACTTTTCCTTGTTCTCATCCGGGAAGACAATATAAGAGGTAGCCGGTTCAACCCCATATTAGAT  1887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1835  ATGGACGTCCACTTTTCCTTGTTCTCATCCGGGAAGACAATATAAGAGGTAGCCGGTTCAACCCCATATTAGAT  1908

Query 1888  ATGCTGGCAGCCCTTAAAAAAGGAATAATTGGAGGAGTCAAAGTTCATGTGGATCGTCTACAGACACTAATATC  1961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1909  ATGCTGGCAGCCCTTAAAAAAGGAATAATTGGAGGAGTCAAAGTTCATGTGGATCGTCTACAGACACTAATATC  1982

Query 1962  TGGAGCTGTGGTAGAACAACTTGATTTCCTACGAATCAGTGACACAGAAGAGCTTCCAGAATTTAAGAGTTTTG  2035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1983  TGGAGCTGTGGTAGAACAACTTGATTTCCTACGAATCAGTGACACAGAAGAGCTTCCAGAATTTAAGAGTTTTG  2056

Query 2036  AGGAACTAGAACCTCCCAAACATTCAAAAGTCAAACGGCAAAGCAGCACCCCTAGTGCTCCTGAACTGGGACAG  2109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2057  AGGAACTAGAACCTCCCAAACATTCAAAAGTCAAACGGCAAAGCAGCACCCCTAGTGCTCCTGAACTGGGACAG  2130

Query 2110  CAGCCGGATGTCAACATTAGTGAATGGAAGGACAAACCCACCCATGAAATTCTTCAAAAACTGAATGATTGCAG  2183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2131  CAGCCGGATGTCAACATTAGTGAATGGAAGGACAAACCCACCCACGAAATTCTTCAAAAACTGAATGATTGCAG  2204

Query 2184  TTGTCTGGCTAGCCAAGCCATCCTGCTGGGTATACTGCTCAAAAGAGAAGGCCCCAACTTCATCACAAAGGAAG  2257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2205  TTGTCTGGCTAGCCAAGCCATCCTGCTGGGTATACTGCTCAAAAGAGAAGGCCCCAACTTCATCACAAAGGAAG  2278

Query 2258  GTACCGTTTCTGATCACATTGAGAGAGTCTATAGAAGAGCTGGCAGCCAAAAACTTTGGTCGGTTGTACG---C  2328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||.||   |
Sbjct 2279  GTACCGTTTCTGATCACATTGAGAGAGTCTATAGAAGAGCTGGCAGCCAAAAACTTTGGTTGGCGGTGCGCTAC  2352

Query 2329  CGTGCAGCAAGTCTTTTA---AGTAAAGTAGTGGACAGCC----TGGCCCCATCCATTACTAATGTTTTAGTGC  2395
            .|.||.|||     ||||   ||.||     |...|..||    |.||||||..||||||||.|.||.|.||.|
Sbjct 2353  GGGGCTGCA-----TTTACCCAGAAA-----TTTTCTTCCTCTATAGCCCCACACATTACTACTTTTCTGGTAC  2416

Query 2396  AGGGCAAACAGGTAACTCTGGGTGCCTTTGGGCATGAAGAAGAAGTTATCTCTAATCCTTTGTCTCCAAGAGTG  2469
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2417  ATGGGAAACAGGTAACTCTGGGTGCCTTTGGGCATGAAGAAGAAGTTATCTCTAATCCTTTGTCTCCAAGAGTG  2490

Query 2470  ATTCAAAACATCATCTATTATAAGTGTAACACCCATGATGAGAGGGAAGCGGTCATTCAGCAAGAACTGGTCAT  2543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2491  ATTCAAAACATCATCTATTATAAGTGTAACACCCATGATGAGAGGGAAGCGGTCATTCAGCAAGAACTGGTCAT  2564

Query 2544  CCATATTGGCTGGATCATCTCCAATAACCCTGAGTTATTCAGTGGCATGCTGAAAATACGAATCGGGTGGATCA  2617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2565  CCATATTGGCTGGATCATCTCCAATAACCCTGAGTTATTCAGTGGCATGCTGAAAATACGAATCGGGTGGATCA  2638

Query 2618  TCCATGCCATGGAGTATGAACTTCAGATCCGTGGCGGAGACAAGCCAGCCTTGGACTTGTATCAGCTGTCACCT  2691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639  TCCATGCCATGGAGTATGAACTTCAGATCCGTGGCGGAGACAAGCCAGCCTTGGACTTGTATCAGCTGTCACCT  2712

Query 2692  AGTGAAGTTAAACAGCTTCTGCTGGATATTCTGCAGCCTCAACAGAATGGAAGATGTTGGCTGAACAGGCGTCA  2765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2713  AGTGAAGTTAAACAGCTTCTGCTGGATATTCTGCAGCCTCAACAGAATGGAAGATGTTGGCTGAACAGGCGTCA  2786

Query 2766  GATCGATGGGTCTTTGAATAGAACTCCCACCGGGTTCTATGACCGAGTGTGGCAGATTCTGGAGCGCACGCCCA  2839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2787  GATCGATGGGTCTTTGAATAGAACTCCCACCGGGTTCTATGACCGAGTGTGGCAGATTCTGGAGCGCACGCCCA  2860

Query 2840  ATGGGATCATTGTTGCTGGGAAGCATTTGCCTCAGCAACCAACCCTGTCAGATATGACCATGTATGAGATGAAT  2913
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2861  ATGGGATCATTGTTGCTGGGAAGCATTTGCCTCAGCAACCAACCCTGTCAGATATGACCATGTATGAGATGAAT  2934

Query 2914  TTCTCTCTCCTTGTTGAAGACACGTTGGGAAATATTGACCAGCCACAGTACAGACAGATCGTTGTAGAGTTACT  2987
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935  TTCTCTCTCCTTGTTGAAGACACGTTGGGAAATATTGACCAGCCACAGTACAGACAGATCGTTGTAGAGTTACT  3008

Query 2988  TATGGTTGTATCCATTGTACTGGAAAGAAACCCCGAGCTAGAATTTCAAGACAAAGTAGATCTAGACAGACTGG  3061
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3009  TATGGTTGTATCCATTGTACTGGAAAGAAACCCCGAGCTAGAATTTCAAGACAAAGTAGATCTAGACAGACTGG  3082

Query 3062  TCAAAGAAGCATTTAATGAATTTCAAAAAGATCAGAGTCGGCTAAAGGAAATTGAAAAACAAGATGACATGACT  3135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3083  TCAAAGAAGCATTTAATGAATTTCAAAAAGATCAGAGTCGGCTAAAGGAAATTGAAAAACAAGATGACATGACT  3156

Query 3136  TCCTTTTACAACACTCCTCCCCTGGGAAAAAGAGGAACATGCAGCTATTTGACAAAGGCGGTGATGAATCTGCT  3209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3157  TCCTTTTACAACACTCCTCCCCTGGGAAAAAGAGGAACATGCAGCTATTTGACAAAGGCGGTGATGAATCTGCT  3230

Query 3210  GCTGGAAGGAGAAGTCAAGCCAAACAATGATGACCCGTGTCTGATTAGC  3258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3231  GCTGGAAGGAGAAGTCAAGCCAAACAATGATGACCCGTGTCTGATTAGC  3279