Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14763
- Subject:
- XM_011543493.3
- Aligned Length:
- 1859
- Identities:
- 1329
- Gaps:
- 511
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACAGCTTTGACTCTCCCGGATCTTGCAGAGCAGTTTGCCCCTCCTGACATTGCCCCGCCTCTTCTTATCAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCTCGTGGAAGCCATTGAAAAGAAAGGTCTGGAATGTTCAACTCTATACAGAACACAGAGCTCCAGCAACCTGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CAGAATTACGACAGCTTCTTGATTGTGATACACCCTCCGTGGACTTGGAAATGATCGATGTGCACGTTTTGGCT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GACGCTTTCAAACGCTATCTCCTGGACTTACCAAATCCTGTCATTCCAGCAGCCGTTTACAGTGAAATGATTTC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TTTAGCTCCAGAAGTACAAAGCTCCGAAGAATATATTCAGCTATTGAAGAAGCTTATTAGGTCGCCTAGCATAC 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CTCATCAGTATTGGCTTACGCTTCAGTATTTGTTAAAACATTTCTTCAAGCTCTCTCAAACCTCCAGCAAAAAT 444
Query 1 -------ATGTACAA---TACTGTTTGGAATATGGAAGACCT-GGATTT--AGAATATGCCA--AGACAGAT-- 57
||| ||| ||||.|.||.||| |...||.||| .|.||| |||.|.| || ||.|||.|
Sbjct 445 CTGTTGAATG--CAAGAGTACTCTCTGAAAT-TTTCAGCCCTATGCTTTTCAGATTCT--CAGCAGCCAGCTCT 513
Query 58 -ATAA-ATTGTGGCACAGACTTGAT----GTTTTATATAGA-----------------AATGGA---------- 98
|||| |.|| .|.||.|.|| || |||||| ||||||
Sbjct 514 GATAATACTG-----AAAACCTCATAAAAGT----TATAGAAATTTTAATCTCAACTGAATGGAATGAACGACA 578
Query 99 -CC--CACCAGCACTGCCTCCTAAACCACCAAAACCTACTACTGTAGCCAACAACGGTATGAATAACAATATGT 169
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 579 GCCTGCACCAGCACTGCCTCCTAAACCACCAAAACCTACTACTGTAGCCAACAACGGTATGAATAACAATATGT 652
Query 170 CCTTACAAGATGCTGAATGGTACTGGGGAGATATCTCGAGGGAAGAAGTGAATGAAAAACTTCGAGATACAGCA 243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 653 CCTTACAAGATGCTGAATGGTACTGGGGAGATATCTCGAGGGAAGAAGTGAATGAAAAACTTCGAGATACAGCA 726
Query 244 GACGGGACCTTTTTGGTACGAGATGCGTCTACTAAAATGCATGGTGATTATACTCTTACACTAAGGAAAGGGGG 317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 727 GACGGGACCTTTTTGGTACGAGATGCGTCTACTAAAATGCATGGTGATTATACTCTTACACTAAGGAAAGGGGG 800
Query 318 AAATAACAAATTAATCAAAATATTTCATCGAGATGGGAAATATGGCTTCTCTGACCCATTAACCTTCAGTTCTG 391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 801 AAATAACAAATTAATCAAAATATTTCATCGAGATGGGAAATATGGCTTCTCTGACCCATTAACCTTCAGTTCTG 874
Query 392 TGGTTGAATTAATAAACCACTACCGGAATGAATCTCTAGCTCAGTATAATCCCAAATTGGATGTGAAATTACTT 465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 875 TGGTTGAATTAATAAACCACTACCGGAATGAATCTCTAGCTCAGTATAATCCCAAATTGGATGTGAAATTACTT 948
Query 466 TATCCAGTATCCAAATACCAACAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATTGAAGCTGTAGGGAAAAAATTACA 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 949 TATCCAGTATCCAAATACCAACAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATTGAAGCTGTAGGGAAAAAATTACA 1022
Query 540 TAAATATAACACTCAGTTTCAAGAAAAAAGTCGAGAATATGATAGATTATATGAAGAATATACCCGCACATCCC 613
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 TGAATATAACACTCAGTTTCAAGAAAAAAGTCGAGAATATGATAGATTATATGAAGAATATACCCGCACATCCC 1096
Query 614 AGGAAATCCAAATGAAAAGGACAGCTATTGAAGCATTTAATGAAACCATAAAAATATTTGAAGAACAGTGCCAG 687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097 AGGAAATCCAAATGAAAAGGACAGCTATTGAAGCATTTAATGAAACCATAAAAATATTTGAAGAACAGTGCCAG 1170
Query 688 ACCCAAGAGCGGTACAGCAAAGAATACATAGAAAAGTTTAAACGTGAAGGCAATGAGAAAGAAATACAAAGGAT 761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171 ACCCAAGAGCGGTACAGCAAAGAATACATAGAAAAGTTTAAACGTGAAGGCAATGAGAAAGAAATACAAAGGAT 1244
Query 762 TATGCATAATTATGATAAGTTGAAGTCTCGAATCAGTGAAATTATTGACAGTAGAAGAAGATTGGAAGAAGACT 835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245 TATGCATAATTATGATAAGTTGAAGTCTCGAATCAGTGAAATTATTGACAGTAGAAGAAGATTGGAAGAAGACT 1318
Query 836 TGAAGAAGCAGGCAGCTGAGTATCGAGAAATTGACAAACGTATGAACAGCATTAAACCAGACCTTATCCAGCTG 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 TGAAGAAGCAGGCAGCTGAGTATCGAGAAATTGACAAACGTATGAACAGCATTAAACCAGACCTTATCCAGCTG 1392
Query 910 AGAAAGACGAGAGACCAATACTTGATGTGGTTGACTCAAAAAGGTGTTCGGCAAAAGAAGTTGAACGAGTGGTT 983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393 AGAAAGACGAGAGACCAATACTTGATGTGGTTGACTCAAAAAGGTGTTCGGCAAAAGAAGTTGAACGAGTGGTT 1466
Query 984 GGGCAATGAAAACACTGAAGACCAATATTCACTGGTGGAAGATGATGAAGATTTGCCCCATCATGATGAGAAGA 1057
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1467 GGGCAATGAAAACACTGAAGACCAATATTCACTGGTGGAAGATGATGAAGATTTGCCCCATCATGATGAGAAGA 1540
Query 1058 CATGGAATGTTGGAAGCAGCAACCGAAACAAAGCTGAAAACCTGTTGCGAGGGAAGCGAGATGGCACTTTTCTT 1131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1541 CATGGAATGTTGGAAGCAGCAACCGAAACAAAGCTGAAAACCTGTTGCGAGGGAAGCGAGATGGCACTTTTCTT 1614
Query 1132 GTCCGGGAGAGCAGTAAACAGGGCTGCTATGCCTGCTCTGTAGTGGTGGACGGCGAAGTAAAGCATTGTGTCAT 1205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 GTCCGGGAGAGCAGTAAACAGGGCTGCTATGCCTGCTCTGTAGTGGTGGACGGCGAAGTAAAGCATTGTGTCAT 1688
Query 1206 AAACAAAACAGCAACTGGCTATGGCTTTGCCGAGCCCTATAACTTGTACAGCTCTCTGAAAGAACTGGTGCTAC 1279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1689 AAACAAAACAGCAACTGGCTATGGCTTTGCCGAGCCCTATAACTTGTACAGCTCTCTGAAAGAACTGGTGCTAC 1762
Query 1280 ATTACCAACACACCTCCCTTGTGCAGCACAACGACTCCCTCAATGTCACACTAGCCTACCCAGTATATGCACAG 1353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1763 ATTACCAACACACCTCCCTTGTGCAGCACAACGACTCCCTCAATGTCACACTAGCCTACCCAGTATATGCACAG 1836
Query 1354 CAGAGGCGA 1362
|||||||||
Sbjct 1837 CAGAGGCGA 1845
