Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14786
- Subject:
- NM_001321982.2
- Aligned Length:
- 1212
- Identities:
- 1146
- Gaps:
- 66
Alignment
Query 1 ATGAGCCACATCCAGATCCCGCCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACGGTGGAGGTGCTGCGACAGCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCCACATCCAGATCCCGCCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACGGTGGAGGTGCTGCGACAGCA 74
Query 75 GCCGCCTGACCTCGTCGAATTCGCAGTGGAGTACTTCACCCGCCTGCGCGAGGCCCGCGCCCCAGCCTCAGTCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCCGCCTGACCTCGTCGAATTCGCAGTGGAGTACTTCACCCGCCTGCGCGAGGCCCGCGCCCCAGCCTCAGTCC 148
Query 149 TGCCCGCCGCCACCCCACGCCAGAGCCTGGGCCACCCCCCGCCAGAACCCGGCCCGGACCGTGTCGCCGACGCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCCCGCCGCCACCCCACGCCAGAGCCTGGGCCACCCCCCGCCAGAACCCGGCCCGGACCGTGTCGCCGACGCC 222
Query 223 AAAGGGGACAGCGAGTCGGAGGAGGACGAGGACTTGGAAGTTCCAGTTCCTAGCAGATTTAATAGACGAGTATC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAAGGGGACAGCGAGTCGGAGGAGGACGAGGACTTGGAAGTTCCAGTTCCTAGCAGATTTAATAGACGAGTATC 296
Query 297 AGTCTGTGCTGAGACCTATAACCCTGATGAGGAAGAGGAAGATACAGATCCAAGGGTGATTCATCCTAAAACTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGTCTGTGCTGAGACCTATAACCCTGATGAGGAAGAGGAAGATACAGATCCAAGGGTGATTCATCCTAAAACTG 370
Query 371 ATGAACAGAGATGCAGACTTCAGGAAGCTTGCAAAGATATTCTCCTTTTCAAAAATCTTGATCAGGAACAGCTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGAACAGAGATGCAGACTTCAGGAAGCTTGCAAAGATATTCTCCTTTTCAAAAATCTTGATCAGGAACAGCTT 444
Query 445 TCTCAAGTTCTCGATGCCATGTTTGAAAGGATAGTCAAAGCTGATGAGCATGTCATTGACCAAGGAGATGATGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCTCAAGTTCTCGATGCCATGTTTGAAAGGATAGTCAAAGCTGATGAGCATGTCATTGACCAAGGAGATGATGG 518
Query 519 AGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACTTATGACATTTTAGTAACAAAAGATAATCAAACCCGCTCTGTTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACTTATGACATTTTAGTAACAAAAGATAATCAAACCCGCTCTGTTG 592
Query 593 GTCAATATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAACACCCCGAGAGCTGCTACCATTGTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTCAATATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAACACCCCGAGAGCTGCTACCATTGTT 666
Query 667 GCTACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGACTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATCATAGTGAAAAATAATGCAAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGACTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATCATAGTGAAAAATAATGCAAA 740
Query 741 GAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTGCCCCTCCTTAAATCACTAGAGGTGTCAGAACGAATGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTGCCCCTCCTTAAATCACTAGAGGTGTCAGAACGAATGA 814
Query 815 AGATTGTGGATGTAATAGGAGAGAAGATCTATAAGGATGGAGAACGCATAATCACTCA---------------- 872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGATTGTGGATGTAATAGGAGAGAAGATCTATAAGGATGGAGAACGCATAATCACTCAGGGTGAAAAGGCTGAT 888
Query 873 --------------------------------------------------GACTAAATCAAACAAGGATGGTGG 896
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGCTTTTACATCATAGAGTCTGGCGAAGTGAGCATCTTGATTAGAAGCAGGACTAAATCAAACAAGGATGGTGG 962
Query 897 GAACCAGGAGGTCGAGATTGCCCGCTGCCATAAGGGGCAGTACTTTGGAGAGCTTGCCCTGGTCACCAACAAAC 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAACCAGGAGGTCGAGATTGCCCGCTGCCATAAGGGGCAGTACTTTGGAGAGCTTGCCCTGGTCACCAACAAAC 1036
Query 971 CCAGAGCTGCCTCAGCTTATGCAGTTGGAGATGTCAAATGCTTAGTTATGGATGTACAAGCATTCGAGAGGCTT 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCAGAGCTGCCTCAGCTTATGCAGTTGGAGATGTCAAATGCTTAGTTATGGATGTACAAGCATTCGAGAGGCTT 1110
Query 1045 CTGGGGCCCTGCATGGACATCATGAAGAGGAACATCTCACACTATGAGGAACAGCTGGTGAAGATGTTTGGCTC 1118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGGGGCCCTGCATGGACATCATGAAGAGGAACATCTCACACTATGAGGAACAGCTGGTGAAGATGTTTGGCTC 1184
Query 1119 CAGCGTGGATCTGGGCAACCTCGGGCAG 1146
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGCGTGGATCTGGGCAACCTCGGGCAG 1212