Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14786
- Subject:
- XM_011533943.2
- Aligned Length:
- 1182
- Identities:
- 979
- Gaps:
- 171
Alignment
Query 1 ATGAGCCACATCCAGATCCCGCCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACGGTGGAGGTGCTGCGACAGCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCCACATCCAGATCCCGCCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACGGTGGAGGTGCTGCGACAGCA 74
Query 75 GCCGCCTGACCTCGTCGAATTCGCAGTGGAGTACTTCACCCGCCTGCGCGAGGCCCGCGCCCCAGCCTCAGTCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCCGCCTGACCTCGTCGAATTCGCAGTGGAGTACTTCACCCGCCTGCGCGAGGCCCGCGCCCCAGCCTCAGTCC 148
Query 149 TGCCCGCCGCCACCCCACGCCAGAGCCTGGGCCACCCCCCGCCAGAACCCGGCCCGGACCGTGTCGCCGACGCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCCCGCCGCCACCCCACGCCAGAGCCTGGGCCACCCCCCGCCAGAACCCGGCCCGGACCGTGTCGCCGACGCC 222
Query 223 AAAGGGGACAGCGAGTCGGAGGAGGACGAGGACTTGGAAGTTCCAGTTCCTAGCAGATTTAATAGACGAGTATC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAAGGGGACAGCGAGTCGGAGGAGGACGAGGACTTGGAAGTTCCAGTTCCTAGCAGATTTAATAGACGAGTATC 296
Query 297 AGTCTGTGCTGAGACCTATAACCCTGATGAGGAAGAGGAAGATACAGATCCAAGGGTGATTCATCCTAAAACTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGTCTGTGCTGAGACCTATAACCCTGATGAGGAAGAGGAAGATACAGATCCAAGGGTGATTCATCCTAAAACTG 370
Query 371 ATGAACAGAGATGCAGACTTCAGGAAGCTTGCAAAGATATTCTCCTTTTCAAAAATCTTGATCAGGAACAGCTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGAACAGAGATGCAGACTTCAGGAAGCTTGCAAAGATATTCTCCTTTTCAAAAATCTTGATCAGGAACAGCTT 444
Query 445 TCTCAAGTTCTCGATGCCATGTTTGAAAGGATAGTCAAAGCTGATGAGCATGTCATTGACCAAGGAGATGATGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCTCAAGTTCTCGATGCCATGTTTGAAAGGATAGTCAAAGCTGATGAGCATGTCATTGACCAAGGAGATGATGG 518
Query 519 AGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACTTATGACATTTTAGTAACAAAAGATAATCAAACCCGCTCTGTTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACTTATGACATTTTAGTAACAAAAGATAATCAAACCCGCTCTGTTG 592
Query 593 GTCAATATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAACACCCCGAGAGCTGCTACCATTGTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTCAATATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAACACCCCGAGAGCTGCTACCATTGTT 666
Query 667 GCTACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGACTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATCATAGTGAAAAATAATGCAAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGACTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATCATAGTGAAAAATAATGCAAA 740
Query 741 GAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTGCCCCTCCTTAAATCACTAGAGGTGTCAGAACGAATGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTGCCCCTCCTTAAATCACTAGAGGTGTCAGAACGAATGA 814
Query 815 AGATTGTGGATGTAATAGGAGAGAAGATCTATAAGGATGGAGAACGCATAATCACTCAGACTAAATCAAACAAG 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|| |||
Sbjct 815 AGATTGTGGATGTAATAGGAGAGAAGATCTATAAGGATGGAGAACGCATAATCACTCAGGGTGAA------AAG 882
Query 889 GATGGTGG-------------GAACCAG--GAGGTCGAG---ATTGCCCGCTGCCATAAGGGGCAGTACTTTGG 944
|.||.|.| ||..|.| ||.|| ||| .||| ||.||..||| ||
Sbjct 883 GCTGATAGCTTTTACATCATAGAGTCTGGCGAAGT-GAGCATCTTG---------ATTAGAAGCA-------GG 939
Query 945 AGAG-CTTGCC-----CTGGTCACCA------ACAAACCCAGAGCTGCCTCAGCTTATGCAGTTGGAGATGTCA 1006
..|| ||||.| ||| ||| || .||||.||..||.||.|||||
Sbjct 940 CAAGCCTTGACATATTCTG----CCATCTTTTAC--------TGCTGTCTAGGCCTAGGCAGT----------- 990
Query 1007 AATGCTTAGTTATGGATGTACAAGCATTCGAGAGGCTTCTGGGGCCCTGCATGGA------CATCATGAAGAGG 1074
||||| ||..|||.|| |||| ||| .||.||||| ||.||
Sbjct 991 ---------TTATG--TGACCAACCA---GAGA------TGG----ATGAATGGATGCTTTCAGCA-------- 1032
Query 1075 AACATCTCACACTATGAGGAACAGCTGGTGAAGATGTTTGGCTCCAGCGTGGATCTGGGCAACCTCGGGCAG 1146
|||||.|| ||||.|.
Sbjct 1033 AACATTTC------TGAGTAC--------------------------------------------------- 1047