Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14786
- Subject:
- XR_002959546.1
- Aligned Length:
- 1701
- Identities:
- 1146
- Gaps:
- 555
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GTCGGTCCCCGCGGCGGCGGCGGCTGCCCAGTGACAGCGGCGGCGGTGCCAGGTCGGCCGTGGTAGCGTAGGGT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGCGCGGCCCGGAAACGCAGAGCCGGCCAAAGAGCGGCGCGACGTGAGCCGGGGCCGTGCGCGAAGAGACCTCG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CGGGCGCGGAGCGAAAGGCCGGCGTGAGTGAGCGCGGAGACAGTGGCCGCCGGCGGCCCAACCCGTCTATCCCT 222
Query 1 ---------------ATGAGCCACATCCAGATCCCGCCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACGGTGGA 59
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCGGCCGCCGCCGGCATGAGCCACATCCAGATCCCGCCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACGGTGGA 296
Query 60 GGTGCTGCGACAGCAGCCGCCTGACCTCGTCGAATTCGCAGTGGAGTACTTCACCCGCCTGCGCGAGGCCCGCG 133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTGCTGCGACAGCAGCCGCCTGACCTCGTCGAATTCGCAGTGGAGTACTTCACCCGCCTGCGCGAGGCCCGCG 370
Query 134 CCCCAGCCTCAGTCCTGCCCGCCGCCACCCCACGCCAGAGCCTGGGCCACCCCCCGCCAGAACCCGGCCCGGAC 207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCCAGCCTCAGTCCTGCCCGCCGCCACCCCACGCCAGAGCCTGGGCCACCCCCCGCCAGAACCCGGCCCGGAC 444
Query 208 CGTGTCGCCGACGCCAAAGGGGACAGCGAGTCGGAGGAGGACGAGGACTTGGAAGTTCCAGTTCCTAGCAGATT 281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGTGTCGCCGACGCCAAAGGGGACAGCGAGTCGGAGGAGGACGAGGACTTGGAAGTTCCAGTTCCTAGCAGATT 518
Query 282 TAATAGACGAGTATCAGTCTGTGCTGAGACCTATAACCCTGATGAGGAAGAGGAAGATACAGATCCAAGGGTGA 355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TAATAGACGAGTATCAGTCTGTGCTGAGACCTATAACCCTGATGAGGAAGAGGAAGATACAGATCCAAGGGTGA 592
Query 356 TTCATCCTAAAACTGATGAACAGAGATGCAGACTTCAGGAAGCTTGCAAAGATATTCTCCTTTTCAAAAATCTT 429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTCATCCTAAAACTGATGAACAGAGATGCAGACTTCAGGAAGCTTGCAAAGATATTCTCCTTTTCAAAAATCTT 666
Query 430 GATCAGGAACAGCTTTCTCAAGTTCTCGATGCCATGTTTGAAAGGATAGTCAAAGCTGATGAGCATGTCATTGA 503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATCAGGAACAGCTTTCTCAAGTTCTCGATGCCATGTTTGAAAGGATAGTCAAAGCTGATGAGCATGTCATTGA 740
Query 504 CCAAGGAGATGATGGAGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACTTATGACATTTTAGTAACAAAAGATAATC 577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCAAGGAGATGATGGAGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACTTATGACATTTTAGTAACAAAAGATAATC 814
Query 578 AAACCCGCTCTGTTGGTCAATATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAACACCCCGAGA 651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAACCCGCTCTGTTGGTCAATATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAACACCCCGAGA 888
Query 652 GCTGCTACCATTGTTGCTACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGACTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATCATAGT 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCTGCTACCATTGTTGCTACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGACTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATCATAGT 962
Query 726 GAAAAATAATGCAAAGAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTGCCCCTCCTTAAATCACTAGAGG 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAAAAATAATGCAAAGAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTGCCCCTCCTTAAATCACTAGAGG 1036
Query 800 TGTCAGAACGAATGAAGATTGTGGATGTAATAGGAGAGAAGATCTATAAGGATGGAGAACGCATAATCACTCA- 872
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGTCAGAACGAATGAAGATTGTGGATGTAATAGGAGAGAAGATCTATAAGGATGGAGAACGCATAATCACTCAG 1110
Query 873 -----------------------------------------------------------------GACTAAATC 881
|||||||||
Sbjct 1111 GGTGAAAAGGCTGATAGCTTTTACATCATAGAGTCTGGCGAAGTGAGCATCTTGATTAGAAGCAGGACTAAATC 1184
Query 882 AAACAAGGATGGTGGGAACCAGGAGGTCGAGATTGCCCGCTGCCATAAGGGGCAGTACTTTGGAGAGCTTGCCC 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAACAAGGATGGTGGGAACCAGGAGGTCGAGATTGCCCGCTGCCATAAGGGGCAGTACTTTGGAGAGCTTGCCC 1258
Query 956 TGGTCACCAACAAACCCAGAGCTGCCTCAGCTTATGCAGTTGGAGATGTCAAATGCTTAGTTATGGATGTACAA 1029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGTCACCAACAAACCCAGAGCTGCCTCAGCTTATGCAGTTGGAGATGTCAAATGCTTAGTTATGGATGTACAA 1332
Query 1030 GCATTCGAGAGGCTTCTGGGGCCCTGCATGGACATCATGAAGAGGAACATCTCACACTATGAGGAACAGCTGGT 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCATTCGAGAGGCTTCTGGGGCCCTGCATGGACATCATGAAGAGGAACATCTCACACTATGAGGAACAGCTGGT 1406
Query 1104 GAAGATGTTTGGCTCCAGCGTGGATCTGGGCAACCTCGGGCAG------------------------------- 1146
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAAGATGTTTGGCTCCAGCGTGGATCTGGGCAACCTCGGGCAGTAGCCAGCAGGCTCAAGACCCAGGAAGAACC 1480
Query 1147 -------------------------------------------------------------------------- 1146
Sbjct 1481 AGTGTTTCAGTTAGCGTCCAAAAGCAGGAAAAAAGACAACATCCCAGTTCAAAGGTGACCAAAGGAAGCGCCTT 1554
Query 1147 -------------------------------------------------------------------------- 1146
Sbjct 1555 GTTGCAGTTTGATCTTGCCCACATTTGGACAGAGACACCTGCCTGTACCAAAGGGCCAACTGTGGGAGCATATG 1628
Query 1147 ------------------------------------------------------------------------- 1146
Sbjct 1629 AAATCTAGGACCCAAGCAACTGGTAGATGGAAATCTTGGGACTCACTAGGGCCCAATAAACTGGTAGCTGAAC 1701
