Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14787
• Subject: XM_006515014.3
• Aligned Length: 1254
• Identities: 1142
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGAGCATCGAGATCCCGGCGGGACTGACGGAGCTGCTGCAGGGCTTCACGGTGGAGGTGCTGAGGCACCAGCC  74
            |||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCATCGAGATCCCCGCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTTCACGGTGGAGGTGCTGAGGCACCAGCC  74

Query   75  CGCGGACCTGCTGGAGTTCGCTCTGCAGCACTTCACCCGCCTGCAGCAGGAGAACGAGCGCAAAGGCACCGCGC  148
            |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||
Sbjct   75  CGCCGACCTGCTGGAGTTCGCGCTGCAGCACTTCACGCGGCTGCAGCAGGAGAACGAGCGCAAGGGCGCCGCGC  148

Query  149  GCTTCTGCCATGAGGGCAGGACCTGGGGGGACCTGGGCGCCGCTGCCGGGGGCGGCACCCCCAGCAAGGGGGTC  222
            |||||.||||||||||||||||||||||||||..||||||.||.|||||||||||||.||||||.|||||.|||
Sbjct  149  GCTTCGGCCATGAGGGCAGGACCTGGGGGGACGCGGGCGCAGCCGCCGGGGGCGGCATCCCCAGTAAGGGTGTC  222

Query  223  AACTTCGCCGAGGAGCCCATGCAGTCCGACTCCGAGGACGGGGAGGAGGAGGAGGCGGCGCCCGCGGACGCAGG  296
            ||||||||||||||||||||||..||||||||||||.||||.|||||||||||||      |||||||.|||||
Sbjct  223  AACTTCGCCGAGGAGCCCATGCGCTCCGACTCCGAGAACGGCGAGGAGGAGGAGG------CCGCGGAAGCAGG  290

Query  297  GGCGTTCAATGCTCCAGTAATAAACCGATTCACAAGGCGTGCCTCAGTATGTGCAGAAGCTTATAATCCTGATG  370
            |||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  GGCGTTCAACGCTCCAGTTATAAACCGGTTCACAAGGCGTGCCTCGGTCTGTGCAGAAGCTTATAATCCTGATG  364

Query  371  AAGAAGAAGATGATGCAGAGTCCAGGATTATACATCCAAAAACTGATGATCAAAGAAATAGGTTGCAAGAGGCT  444
            ||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  365  AAGAGGAAGACGATGCAGAGTCCAGGATAATACATCCCAAAACCGATGATCAGAGAAACAGATTGCAAGAGGCT  438

Query  445  TGCAAAGACATCCTGCTGTTTAAGAATCTGGATCCGGAGCAGATGTCTCAAGTATTAGATGCCATGTTTGAAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  439  TGCAAAGACATCCTGCTGTTTAAGAACCTGGATCCAGAGCAGATGTCCCAAGTTTTAGATGCCATGTTTGAAAA  512

Query  519  ATTGGTCAAAGATGGGGAGCATGTAATTGATCAAGGTGACGATGGTGACAACTTTTATGTAATTGATAGAGGCA  592
            ||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct  513  ATTGGTCAAAGAAGGGGAACACGTAATTGACCAAGGTGATGACGGTGACAACTTTTACGTCATTGACAGAGGAA  586

Query  593  CATTTGATATTTATGTGAAATGTGATGGTGTTGGAAGATGTGTTGGTAACTATGATAATCGTGGGAGTTTCGGC  666
            ||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  587  CATTTGATATTTATGTAAAATGTGATGGCGTTGGAAGATGCGTCGGTAACTATGATAACCGTGGGAGTTTTGGA  660

Query  667  GAACTGGCCTTAATGTACAATACACCCAGAGCAGCTACAATCACTGCTACCTCTCCTGGTGCTCTGTGGGGTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GAACTGGCCTTAATGTACAATACACCCAGAGCAGCTACAATCACTGCTACCTCTCCTGGTGCTCTGTGGGGTTT  734

Query  741  GGACAGGGTAACCTTCAGGAGAATAATTGTGAAAAACAATGCCAAAAAGAGAAAAATGTATGAAAGCTTTATTG  814
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct  735  GGACAGGGTGACCTTCAGGAGAATAATTGTAAAAAACAATGCCAAAAAGAGGAAGATGTACGAGAGCTTTATCG  808

Query  815  AGTCACTGCCATTCCTTAAATCTTTGGAGTTTTCTGAACGCCTGAAAGTAGTAGATGTGATAGGCACCAAAGTA  888
            ||||.|||||.|||||.||.|||.|.|||.||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  809  AGTCCCTGCCGTTCCTCAAGTCTCTAGAGGTTTCTGAACGCCTGAAGGTGGTGGATGTGATTGGCACCAAAGTT  882

Query  889  TACAACGATGGAGAACAAATCATTGCTCAGGGAGATTCGGCTGATTCTTTTTTCATTGTAGAATCTGGAGAAGT  962
            |||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||.|||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  TACAATGATGGAGAGCAGATCATTGCTCAGGGAGATTTGGCAGACTCTTTCTTCATTGTAGAATCTGGAGAAGT  956

Query  963  GAAAATTACTATGAAAAGAAAGGGTAAATCAGAAGTGGAAGAGAATGGTGCAGTAGAAATCGCTCGATGCTCGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||..|
Sbjct  957  GAAAATTACTATGAAAAGAAAGGGTAAATCAGAAGTTGAAGAGAACGGAGCTGTGGAAATCGCTCGGTGCTTTC  1030

Query 1037  GGGGACAGTACTTTGGAGAGCTTGCCCTGGTAACTAACAAACCTCGAGCAGCTTCTGCCCACGCCATTGGGACT  1110
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1031  GGGGCCAGTACTTTGGAGAGCTTGCCCTGGTCACTAACAAACCAAGAGCAGCGTCTGCACACGCCATCGGGACT  1104

Query 1111  GTCAAATGTTTAGCAATGGATGTGCAAGCATTTGAAAGGCTTCTGGGACCTTGCATGGAAATTATGAAAAGGAA  1184
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1105  GTCAAATGCTTAGCCATGGATGTGCAAGCATTTGAAAGGCTTTTGGGACCTTGCATGGAAATTATGAAGAGGAA  1178

Query 1185  CATCGCTACCTATGAAGAACAGTTAGTTGCCCTGTTTGGAACGAACATGGATATTGTTGAACCCACTGCA  1254
            ||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1179  CATCGCCACCTATGAAGAACAATTAGTTGCGCTGTTTGGAACAAACATGGATATTGTTGAGCCCACTGCA  1248