Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14791
• Subject: NM_001291434.1
• Aligned Length: 2091
• Identities: 1735
• Gaps: 153

Alignment

Query    1  ATGGCTGGTCTGGGCCCCGGCGTAGGCGATTCAGAGGGGGGACCCCGGCCCCTGTTTTGCAGAAAGGGGGCCCT  74
            |||||.|||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCGGGTCTGGGCCCTGGCGGAGGCGACTCAGAGGGGGGACCCCGACCCCTGTTTTGCAGAAAGGGGGCGCT  74

Query   75  GAGGCAGAAGGTGGTCCACGAAGTCAAGAGCCACAAGTTCACCGCTCGCTTCTTCAAGCAGCCCACCTTCTGCA  148
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  GAGGCAGAAGGTGGTCCACGAGGTGAAGAGCCACAAGTTCACCGCTCGTTTCTTCAAGCAGCCAACCTTCTGCA  148

Query  149  GCCACTGCACCGACTTCATCTGGGGTATCGGAAAGCAGGGCCTGCAATGTCAAGTCTGCAGCTTTGTGGTTCAT  222
            |.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  149  GTCACTGTACCGACTTCATCTGGGGCATTGGAAAGCAGGGCCTGCAATGTCAAGTCTGTAGCTTTGTGGTTCAC  222

Query  223  CGACGATGCCACGAATTTGTGACCTTCGAGTGTCCAGGCGCTGGGAAGGGCCCCCAGACGGATGACCCCCGGAA  296
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  223  CGCCGATGCCACGAATTTGTGACCTTCGAGTGTCCAGGCGCTGGAAAGGGCCCCCAGACGGACGACCCTCGCAA  296

Query  297  CAAACACAAGTTCCGCCTGCATAGCTACAGCAGCCCCACCTTCTGCGACCACTGTGGCTCCCTCCTCTACGGGC  370
            |||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  CAAGCACAAGTTCCGTCTGCACAGCTACAGCAGTCCCACCTTCTGCGACCACTGTGGCTCCCTCCTTTACGGGC  370

Query  371  TTGTGCACCAGGGCATGAAATGCTCCTGCTGCGAGATGAACGTGCACCGGCGCTGTGTGCGTAGCGTGCCCTCC  444
            |.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  TGGTGCACCAGGGCATGAAATGTTCCTGTTGCGAGATGAATGTGCACCGGCGCTGTGTGCGCAGCGTGCCCTCC  444

Query  445  CTGTGCGGTGTGGACCACACCGAGCGCCGCGGGCGCCTGCAGCTGGAGATCCGGGCTCCCACAGCAGATGAGAT  518
            ||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||..|.||||||||
Sbjct  445  CTTTGCGGTGTGGACCACACAGAGCGCCGTGGACGTCTGCAACTGGAAATCCGGGCTCCTACGTCGGATGAGAT  518

Query  519  CCACGTAACTGTTGGCGAGGCCCGTAACCTAATTCCTATGGACCCCAATGGTCTCTCTGATCCCTATGTGAAAC  592
            |||..|.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  519  CCATATTACTGTTGGCGAGGCCCGGAACCTCATTCCTATGGACCCCAATGGCCTGTCTGATCCCTACGTGAAAC  592

Query  593  TGAAGCTCATCCCAGACCCTCGGAACCTGACGAAACAGAAGACCCGAACGGTGAAAGCCACGCTAAACCCTGTG  666
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||....||.|||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  593  TGAAGCTGATCCCGGACCCTCGGAACCTGACAAAACAGAAGACAAAGACCGTGAAAGCCACACTGAATCCCGTG  666

Query  667  TGGAATGAGACCTTTGTGTTCAACCTGAAGCCAGGGGATGTGGAGCGCCGGCTCAGCGTGGAGGTGTGGGACTG  740
            |||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  667  TGGAACGAGACCTTCGTGTTCAACCTGAAGCCAGGGGATGTAGAGCGCCGGCTCAGTGTGGAGGTGTGGGATTG  740

Query  741  GGACCGGACCTCCCGCAACGACTTCATGGGGGCCATGTCCTTTGGCGTCTCGGAGCTGCTCAAGGCGCCCGTGG  814
            |||..||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct  741  GGATAGGACATCCCGAAATGACTTCATGGGTGCCATGTCCTTTGGTGTCTCAGAGCTACTCAAGGCCCCTGTGG  814

Query  815  ATGGCTGGTACAAGTTACTGAACCAGGAGGAGGGCGAGTATTACAATGTGCCGGTGGCCGATGCTGACAACTGC  888
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGGATGGTACAAGTTACTGAACCAGGAGGAGGGCGAATATTACAATGTACCGGTGGCCGATGCTGACAACTGC  888

Query  889  AGCCTCCTCCAGAAGTTTGAGGCTTGTAACTACCCCCTGGAATTGTATGAGCGGGTGCGGATGGGCCCCTCTTC  962
            |||||||||||||||||||||||.||.||.||||||.||||||||||||                         
Sbjct  889  AGCCTCCTCCAGAAGTTTGAGGCCTGCAATTACCCCTTGGAATTGTATG-------------------------  937

Query  963  CTCTCCCATCCCCTCCCCTTCCCCTAGTCCCACCGACCCCAAGCGCTGCTTCTTCGGGGCGAGTCCAGGACGCC  1036
                                                                                      
Sbjct  938  --------------------------------------------------------------------------  937

Query 1037  TGCACATCTCCGACTTCAGCTTCCTCATGGTTCTAGGAAAAGGCAGTTTTGGGAAGGTGATGCTGGCCGAGCGC  1110
                                                                  ||||.||||||||.||||||
Sbjct  938  ------------------------------------------------------AGGTAATGCTGGCAGAGCGC  957

Query 1111  AGGGGCTCTGATGAGCTCTACGCCATCAAGATCTTGAAAAAGGACGTGATCGTCCAGGACGACGATGTGGACTG  1184
            ||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||..||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  958  AGAGGCTCCGACGAACTCTATGCCATCAAGATACTGAAGAAAGACGTCATCGTCCAGGATGACGATGTAGACTG  1031

Query 1185  CACGCTGGTGGAGAAACGTGTGCTGGCGCTGGGGGGCCGGGGTCCTGGCGGCCGGCCCCACTTCCTCACCCAGC  1258
            |||.||.||.|||||.|||||.|||||..||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1032  CACCCTCGTAGAGAAGCGTGTCCTGGCATTGGGAGGCCGAGGTCCTGGAGGCCGGCCACACTTTCTCACGCAGC  1105

Query 1259  TCCACTCCACCTTCCAGACCCCGGACCGCCTGTATTTCGTGATGGAGTACGTCACCGGGGGAGACTTGATGTAC  1332
            |.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||
Sbjct 1106  TTCACTCCACCTTTCAGACTCCGGACCGCCTGTATTTTGTGATGGAGTATGTCACTGGGGGCGATTTAATGTAC  1179

Query 1333  CACATTCAACAGCTGGGCAAGTTTAAGGAGCCCCATGCAGCGTTCTACGCGGCAGAAATCGCTATCGGCCTCTT  1406
            |||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 1180  CACATCCAGCAACTGGGCAAGTTTAAGGAGCCTCATGCAGCATTCTACGCTGCGGAAATCGCCATAGGCCTCTT  1253

Query 1407  CTTCCTTCACAATCAGGGCATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAATGTGATGCTGGATGCTGAGGGACACA  1480
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1254  CTTCCTTCACAACCAGGGCATCATCTACAGGGACCTCAAGTTGGATAATGTGATGCTGGATGCTGAAGGACACA  1327

Query 1481  TCAAGATCACTGACTTTGGCATGTGTAAGGAGAACGTCTTCCCCGGGACGACAACCCGCACCTTCTGCGGGACC  1554
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1328  TCAAGATCACAGACTTTGGCATGTGTAAAGAGAATGTCTTCCCTGGGTCCACAACCCGCACCTTCTGTGGCACC  1401

Query 1555  CCGGACTACATAGCCCCGGAGATCATTGCCTACCAGCCCTATGGGAAGTCTGTCGATTGGTGGTCCTTTGGAGT  1628
            ||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1402  CCAGACTACATAGCACCTGAGATCATTGCCTATCAGCCCTACGGGAAGTCTGTCGACTGGTGGTCTTTTGGGGT  1475

Query 1629  TCTGCTGTATGAGATGTTGGCAGGACAGCCTCCCTTCGATGGGGAGGACGAGGAGGAGCTGTTTCAGGCCATCA  1702
            .|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||.|||||||.|||||||
Sbjct 1476  CCTGCTGTATGAGATGTTGGCAGGACAGCCACCCTTTGATGGGGAAGATGAGGAAGAGTTGTTTCAAGCCATCA  1549

Query 1703  TGGAACAAACTGTCACCTACCCCAAGTCGCTTTCCCGGGAAGCCGTGGCCATCTGCAAGGGGTTCCTGACCAAG  1776
            |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1550  TGGAACAAACTGTCACCTATCCCAAGTCACTTTCCCGGGAAGCTGTGGCCATCTGCAAAGGGTTCCTGACCAAG  1623

Query 1777  CACCCAGGGAAGCGCCTGGGCTCAGGGCCTGATGGGGAACCTACCATCCGTGCACATGGCTTTTTCCGCTGGAT  1850
            ||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1624  CACCCAGGAAAACGCCTGGGCTCAGGGCCAGATGGGGAACCCACCATCCGGGCTCATGGCTTTTTCCGTTGGAT  1697

Query 1851  TGACTGGGAGCGGCTGGAACGATTGGAGATCCCGCCTCCTTTCAGACCCCGCCCGTGTGGCCGCAGCGGCGAGA  1924
            .||.||||||.||.||||..||.||||.||..|.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1698  CGATTGGGAGAGGTTGGAGAGACTGGAAATTGCACCTCCTTTCAGACCACGTCCGTGTGGCCGCAGTGGCGAAA  1771

Query 1925  ACTTTGACAAGTTCTTCACGCGGGCGGCGCCAGCGCTGACCCCTCCAGACCGCCTAGTCCTGGCCAGCATCGAC  1998
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|.||.||.||||||||||||
Sbjct 1772  ACTTTGACAAGTTCTTCACGCGGGCAGCGCCAGCACTGACCCCGCCAGACCGCTTGGTTCTAGCCAGCATCGAC  1845

Query 1999  CAGGCCGATTTCCAGGGCTTCACCTACGTGAACCCCGACTTCGTGCACCCGGATGCCCGCAGCCCCACCAGCCC  2072
            ||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1846  CAAGCTGATTTCCAGGGCTTTACTTATGTGAACCCGGACTTCGTGCACCCAGATGCCCGCAGCCCCACAAGCCC  1919

Query 2073  AGTGCCTGTGCCCGTCATG  2091
            .|||||.|||||.||||||
Sbjct 1920  TGTGCCCGTGCCTGTCATG  1938