Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14805
- Subject:
- XM_017008428.2
- Aligned Length:
- 1285
- Identities:
- 934
- Gaps:
- 335
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACAGTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCTCAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTTTCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTATTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGA 296
Query 1 -------------------------ATGGAACTGATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTGATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAG 370
Query 50 ACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAATGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATT 123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAATGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATT 444
Query 124 CACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGC 197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGC 518
Query 198 CAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCC 271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCC 592
Query 272 TGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATGGTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAA 345
|||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||| |.|||
Sbjct 593 TGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACATGTGGTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATG-------ATAAA 659
Query 346 A-------TCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCAT 412
| |.||.|||||.||.|..||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 AGGTGCAGTGCTGTTTCCTGGCACTGATCATATTGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCAT 733
Query 413 GTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTC 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 GTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTC 807
Query 487 ACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGC 560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 ACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGC 881
Query 561 CAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATC 634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 CAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATC 955
Query 635 CCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGAT 708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 CCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGAT 1029
Query 709 GAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAA 782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 GAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAA 1103
Query 783 AAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCT 856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 AAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCT 1177
Query 857 CGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCC 930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 CGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCC 1251
Query 931 TCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG 957
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 TCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG 1278