Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14811
- Subject:
- NM_001291783.1
- Aligned Length:
- 1278
- Identities:
- 930
- Gaps:
- 240
Alignment
Query 1 ATGGCGGCGTCCTCCCTGGAACAGAAGCTGTCCCGCCTGGAAGCAAAGCTAAAGCAGGAGAACCGGGAGGCCCG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCGGAGGATCGACCTCAACCTGGATATCAGCCCCCAGCGGCCCAGGCCCACCCTGCAGCTCCCGCTGGCCAACG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATGGGGGCAGCCGCTCGCCATCCTCAGAGAGCTCCCCGCAGCACCCCACGCCCCCCGCCCGGCCCCGCCACATG 222
|||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------------------ATG 3
Query 223 CTGGGGCTCCCGTCAACCCTGTTCACACCCCGCAGCATGGAGAGCATTGAGATTGACCAGAAGCTGCAGGAGAT 296
|||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4 CTGGGGCTCCCATCAACCTTGTTCACACCGCGCAGTATGGAGAGCATCGAGATTGACCAGAAGCTGCAGGAGAT 77
Query 297 CATGAAGCAGACGGGCTACCTGACCATCGGGGGCCAGCGCTACCAGGCAGAAATCAACGACCTGGAGAACTTGG 370
||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||||
Sbjct 78 CATGAAGCAGACAGGGTACCTGACTATCGGGGGCCAGCGTTATCAGGCAGAAATCAATGACTTGGAGAACTTGG 151
Query 371 GCGAGATGGGCAGCGGCACCTGCGGCCAGGTGTGGAAGATGCGCTTCCGGAAGACCGGCCACGTCATTGCCGTT 444
|.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||.|||
Sbjct 152 GTGAGATGGGCAGTGGTACCTGTGGTCAGGTGTGGAAGATGCGGTTCCGGAAGACAGGCCACATCATTGCTGTT 225
Query 445 AAGCAAATGCGGCGCTCCGGGAACAAGGAGGAGAACAAGCGCATCCTCATGGACCTGGATGTGGTGCTGAAGAG 518
|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||..|.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 226 AAGCAAATGCGGCGCTCTGGGAACAAGGAAGAGAATAAGCGCATTTTGATGGACCTGGATGTAGTACTCAAGAG 299
Query 519 CCACGACTGCCCCTACATCGTGCAGTGCTTTGGGACGTTCATCACCAACACGGATGTCTTCATCGCCATGGAGC 592
|||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 300 CCATGACTGCCCTTACATCGTTCAGTGCTTTGGCACCTTCATCACCAACACAGACGTCTTTATTGCCATGGAGC 373
Query 593 TCATGGGCACCTGCGCTGAGAAGCTCAAGAAGCGGATGCAGGGCCCCATCCCCGAGCGCATTCTGGGCAAGATG 666
||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 374 TCATGGGCACATGTGCAGAGAAGCTGAAGAAACGAATGCAGGGCCCCATTCCAGAGCGAATCCTGGGCAAGATG 447
Query 667 ACAGTGGCGATTGTGAAGGCGCTGTACTACCTGAAGGAGAAGCACGGTGTCATCCACCGCGACGTCAAGCCCTC 740
||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 448 ACTGTGGCGATTGTGAAAGCACTGTACTATCTGAAGGAGAAGCATGGCGTCATCCATCGCGATGTCAAACCCTC 521
Query 741 CAACATCCTGCTGGACGAGCGGGGCCAGATCAAGCTCTGCGACTTCGGCATCAGCGGCCGCCTGGTGGACTCCA 814
||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 522 CAACATCCTGCTAGATGAGCGGGGCCAGATCAAGCTCTGTGACTTTGGCATCAGTGGCCGCCTTGTTGACTCCA 595
Query 815 AAGCCAAGACGCGGAGCGCCGGCTGTGCCGCCTACATGGCACCCGAGCGCATTGACCCCCCAGACCCCACCAAG 888
|||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 596 AAGCCAAAACACGGAGTGCTGGCTGTGCTGCCTATATGGCTCCCGAGCGCATCGACCCTCCAGATCCCACCAAG 669
Query 889 CCGGACTATGACATCCGGGCCGACGTATGGAGCCTGGGCATCTCGTTGCCCTGCCCGTCTCCCTCCCAGGTGGA 962
||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||| |||.|.||||||
Sbjct 670 CCTGACTATGACATCCGAGCTGATGTGTGGAGCCTGGGCAT---------------------CTCACTGGTGGA 722
Query 963 GCTGGCAACAGGACAGTTTCCCTACAAGAACTGCAAGACGGACTTTGAGGTCCTCACCAAAGTCCTACAGGAAG 1036
||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 723 GCTGGCAACAGGACAGTTCCCCTATAAGAACTGCAAGACGGACTTTGAGGTCCTCACCAAAGTCCTACAGGAAG 796
Query 1037 AGCCCCCGCTTCTGCCCGGACACATGGGCTTCTCGGGGGACTTCCAGTCCTTCGTCAAAGACTGCCTTACTAAA 1110
|||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 797 AGCCCCCACTCCTGCCTGGTCACATGGGCTTCTCAGGGGACTTCCAGTCATTTGTCAAAGACTGCCTTACTAAA 870
Query 1111 GATCACAGGAAGAGACCAAAGTATAATAAGCTACTTGAACACAGCTTCATCAAGCGCTACGAGACGCTGGAGGT 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||..||.|||||
Sbjct 871 GATCACAGGAAGAGACCAAAGTATAATAAGCTACTTGAACACAGCTTCATCAAGCACTATGAGATACTCGAGGT 944
Query 1185 GGACGTGGCGTCCTGGTTCAAGGATGTCATGGCGAAGACTGAGTCACCGCGGACTAGCGGCGTCCTGAGCCAGC 1258
|||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 945 GGATGTCGCGTCCTGGTTTAAGGATGTCATGGCGAAGACCGAGTCCCCAAGGACTAGTGGAGTCCTGAGTCAGC 1018
Query 1259 CCCACCTGCCCTTCTTCAGG 1278
.|||.|||||||||||||||
Sbjct 1019 ACCATCTGCCCTTCTTCAGG 1038