Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_14824
Subject:
XM_006720225.3
Aligned Length:
879
Identities:
693
Gaps:
186

Alignment

Query   1  ATGAAGAACTATAAAGCAATTGGCAAAATAGGAGAGGGAACGTTTTCTGAAGTTATGAAGATGCAAAGCCTGAG  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAAGAACTATAAAGCAATTGGCAAAATAGGAGAGGGAACGTTTTCTGAAGTTATGAAGATGCAAAGCCTGAG  74

Query  75  AGATGGAAACTACTATGCATGTAAACAAATGAAGCAGCGCTTTGAAAGTATTGAGCAAGTCAACAACCTACGAG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AGATGGAAACTACTATGCATGTAAACAAATGAAGCAGCGCTTTGAAAGTATTGAGCAAGTCAACAACCTACGAG  148

Query 149  AGATCCAAGCACTGAGGCGCCTGAATCCGCACCCAAACATTCTTATGTTGCATGAAGTGGTTTTTGACAGAAAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AGATCCAAGCACTGAGGCGCCTGAATCCGCACCCAAACATTCTTATGTTGCATGAAGTGGTTTTTGACAGAAAA  222

Query 223  TCTGGTTCTCTTGCACTAATATGTGAACTTATGGACATGAATATTTATGAGCTAATACGAGGGAGAAGATACCC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TCTGGTTCTCTTGCACTAATATGTGAACTTATGGACATGAATATTTATGAGCTAATACGAGGGAGAAGATACCC  296

Query 297  ATTATCAGAAAAAAAAATTATGCACTATATGTACCAGTTATGTAAGTCCCTGGATCATATTCACAGAAATGGAA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  ATTATCAGAAAAAAAAATTATGCACTATATGTACCAGTTATGTAAGTCCCTGGATCATATTCACAGAAATGGAA  370

Query 371  TATTTCACAGAGATGTAAAACCAGAAAATATACTAATAAAGCAGGATGTCCTGAAATTAGGGGACTTTGGCTCC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TATTTCACAGAGATGTAAAACCAGAAAATATACTAATAAAGCAGGATGTCCTGAAATTAGGGGACTTTGGCTCC  444

Query 445  TGCCGGAGTGTCTATTCCAAGCAGCCGTACACGGAATACATCTCCACCCGCTGGTACCGGGCCCCGGAGTGTCT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TGCCGGAGTGTCTATTCCAAGCAGCCGTACACGGAATACATCTCCACCCGCTGGTACCGGGCCCCGGAGTGTCT  518

Query 519  CCTCACTGATGGGTTCTACACGTACAAGATGGACCTGTGGAGCGCCGGCTGTGTGTTCTACGAGATCGCCAGTC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CCTCACTGATGGGTTCTACACGTACAAGATGGACCTGTGGAGCGCCGGCTGTGTGTTCTACGAGATCGCCAGTC  592

Query 593  TGCAGCCCCTCTTTCCTGGAGTAAATGAACTGGACCAAATCTCAAAAATCCACGATGTCATCGGCACACCCGCT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TGCAGCCCCTCTTTCCTGGAGTAAATGAACTGGACCAAATCTCAAAAATCCACGATGTCATCGGCACACCCGCT  666

Query 667  CAGAAGATCCTCACCAAGTTCAAACAG-----------------------------------------------  693
           |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct 667  CAGAAGATCCTCACCAAGTTCAAACAGTCGAGAGCTATGAATTTTGATTTTCCTTTTAAAAAGGGATCAGGAAT  740

Query 694  --------------------------------------------------------------------------  693
                                                                                     
Sbjct 741  ACCTCTACTAACAACCAATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATG  814

Query 694  -----------------------------------------------------------------  693
                                                                            
Sbjct 815  AGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAACAGAGAAGACTCACTCCA  879