Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14824
• Subject: XM_011537052.2
• Aligned Length: 1068
• Identities: 693
• Gaps: 375

Alignment

Query    1  ATGAAGAACTATAAAGCAATTGGCAAAATAGGAGAGGGAACGTTTTCTGAAGTTATGAAGATGCAAAGCCTGAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAACTATAAAGCAATTGGCAAAATAGGAGAGGGAACGTTTTCTGAAGTTATGAAGATGCAAAGCCTGAG  74

Query   75  AGATGGAAACTACTATGCATGTAAACAAATGAAGCAGCGCTTTGAAAGTATTGAGCAAGTCAACAACCTACGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGATGGAAACTACTATGCATGTAAACAAATGAAGCAGCGCTTTGAAAGTATTGAGCAAGTCAACAACCTACGAG  148

Query  149  AGATCCAAGCACTGAGGCGCCTGAATCCGCACCCAAACATTCTTATGTTGCATGAAGTGGTTTTTGACAGAAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGATCCAAGCACTGAGGCGCCTGAATCCGCACCCAAACATTCTTATGTTGCATGAAGTGGTTTTTGACAGAAAA  222

Query  223  TCTGGTTCTCTTGCACTAATATGTGAACTTATGGACATGAATATTTATGAGCTAATACGAGGGAGAAGATACCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTGGTTCTCTTGCACTAATATGTGAACTTATGGACATGAATATTTATGAGCTAATACGAGGGAGAAGATACCC  296

Query  297  ATTATCAGAAAAAAAAATTATGCACTATATGTACCAGTTATGTAAGTCCCTGGATCATATTCACAGAAATGGAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATTATCAGAAAAAAAAATTATGCACTATATGTACCAGTTATGTAAGTCCCTGGATCATATTCACAGAAATGGAA  370

Query  371  TATTTCACAGAGATGTAAAACCAGAAAATATACTAATAAAGCAGGATGTCCTGAAATTAGGGGACTTTGGCTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TATTTCACAGAGATGTAAAACCAGAAAATATACTAATAAAGCAGGATGTCCTGAAATTAGGGGACTTTGGCTCC  444

Query  445  TGCCGGAGTGTCTATTCCAAGCAGCCGTACACGGAATACATCTCCACCCGCTGGTACCGGGCCCCGGAGTGTCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCCGGAGTGTCTATTCCAAGCAGCCGTACACGGAATACATCTCCACCCGCTGGTACCGGGCCCCGGAGTGTCT  518

Query  519  CCTCACTGATGGGTTCTACACGTACAAGATGGACCTGTGGAGCGCCGGCTGTGTGTTCTACGAGATCGCCAGTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTCACTGATGGGTTCTACACGTACAAGATGGACCTGTGGAGCGCCGGCTGTGTGTTCTACGAGATCGCCAGTC  592

Query  593  TGCAGCCCCTCTTTCCTGGAGTAAATGAACTGGACCAAATCTCAAAAATCCACGATGTCATCGGCACACCCGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCAGCCCCTCTTTCCTGGAGTAAATGAACTGGACCAAATCTCAAAAATCCACGATGTCATCGGCACACCCGCT  666

Query  667  CAGAAGATCCTCACCAAGTTCAAACAG-----------------------------------------------  693
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct  667  CAGAAGATCCTCACCAAGTTCAAACAGTCGAGAGCTATGAATTTTGATTTTCCTTTTAAAAAGGGATCAGGAAT  740

Query  694  --------------------------------------------------------------------------  693
                                                                                      
Sbjct  741  ACCTCTACTAACAACCAATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATG  814

Query  694  --------------------------------------------------------------------------  693
                                                                                      
Sbjct  815  AGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAACAGAGGAAAACAGAGAAGCGGGCTCTG  888

Query  694  --------------------------------------------------------------------------  693
                                                                                      
Sbjct  889  GGCAGCCACAGAAAAGCTGGCTTTCCGGAGCACCCTGTGGCACCGGAACCACTCAGTAACAGCTGCCAGATTTC  962

Query  694  --------------------------------------------------------------------------  693
                                                                                      
Sbjct  963  CAAGGAGGGCAGAAAGCAGAAGACTCACTCCATAGTTCATGGCCCCGTGATCCAGAGTCCCTGCTGGCGCCTTC  1036

Query  694  --------------------------------  693
                                            
Sbjct 1037  GAGTGGGGCAGGCTGAGAACTCAAGCTGTAAC  1068