Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14824
• Subject: XM_017021558.1
• Aligned Length: 876
• Identities: 600
• Gaps: 276

Alignment

Query   1  ATGAAGAACTATAAAGCAATTGGCAAAATAGGAGAGGGAACGTTTTCTGAAGTTATGAAGATGCAAAGCCTGAG  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAAGAACTATAAAGCAATTGGCAAAATAGGAGAGGGAACGTTTTCTGAAGTTATGAAGATGCAAAGCCTGAG  74

Query  75  AGATGGAAACTACTATGCATGTAAACAAATGAAGCAGCGCTTTGAAAGTATTGAGCAAGTCAACAACCTACGAG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct  75  AGATGGAAACTACTATGCATGTAAACAAATGAAGCAGCGCTTTGAAAG--------------------------  122

Query 149  AGATCCAAGCACTGAGGCGCCTGAATCCGCACCCAAACATTCTTATGTTGCATGAAGTGGTTTTTGACAGAAAA  222
                                                                           ||||||||||
Sbjct 123  ----------------------------------------------------------------TGACAGAAAA  132

Query 223  TCTGGTTCTCTTGCACTAATATGTGAACTTATGGACATGAATATTTATGAGCTAATACGAGGGAGAAGATACCC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133  TCTGGTTCTCTTGCACTAATATGTGAACTTATGGACATGAATATTTATGAGCTAATACGAGGGAGAAGATACCC  206

Query 297  ATTATCAGAAAAAAAAATTATGCACTATATGTACCAGTTATGTAAGTCCCTGGATCATATTCACAGAAATGGAA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207  ATTATCAGAAAAAAAAATTATGCACTATATGTACCAGTTATGTAAGTCCCTGGATCATATTCACAGAAATGGAA  280

Query 371  TATTTCACAGAGATGTAAAACCAGAAAATATACTAATAAAGCAGGATGTCCTGAAATTAGGGGACTTTGGCTCC  444
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281  TATTTCACAGAGATGTAAAACCAGAAAATATACTAATAA---AGGATGTCCTGAAATTAGGGGACTTTGGCTCC  351

Query 445  TGCCGGAGTGTCTATTCCAAGCAGCCGTACACGGAATACATCTCCACCCGCTGGTACCGGGCCCCGGAGTGTCT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352  TGCCGGAGTGTCTATTCCAAGCAGCCGTACACGGAATACATCTCCACCCGCTGGTACCGGGCCCCGGAGTGTCT  425

Query 519  CCTCACTGATGGGTTCTACACGTACAAGATGGACCTGTGGAGCGCCGGCTGTGTGTTCTACGAGATCGCCAGTC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 426  CCTCACTGATGGGTTCTACACGTACAAGATGGACCTGTGGAGCGCCGGCTGTGTGTTCTACGAGATCGCCAGTC  499

Query 593  TGCAGCCCCTCTTTCCTGGAGTAAATGAACTGGACCAAATCTCAAAAATCCACGATGTCATCGGCACACCCGCT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500  TGCAGCCCCTCTTTCCTGGAGTAAATGAACTGGACCAAATCTCAAAAATCCACGATGTCATCGGCACACCCGCT  573

Query 667  CAGAAGATCCTCACCAAGTTCAAACAG-----------------------------------------------  693
           |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct 574  CAGAAGATCCTCACCAAGTTCAAACAGTCGAGAGCTATGAATTTTGATTTTCCTTTTAAAAAGGGATCAGGAAT  647

Query 694  --------------------------------------------------------------------------  693
                                                                                     
Sbjct 648  ACCTCTACTAACAACCAATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATG  721

Query 694  --------------------------------------------------------------  693
                                                                         
Sbjct 722  AGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAACAGAGAAACAGTCCC  783